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罗永海

作品数:2 被引量:24H指数:2
供职机构:江苏师范大学生命科学学院更多>>
发文基金:江苏省高校自然科学研究项目农业部农作物物种资源保护项目江苏高校优势学科建设工程资助项目更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇农业科学

主题

  • 2篇甘薯
  • 1篇野生
  • 1篇野生种
  • 1篇生种
  • 1篇种间
  • 1篇系统发育
  • 1篇系统发育树
  • 1篇进化分析
  • 1篇近缘
  • 1篇近缘野生种
  • 1篇NRDNA_...
  • 1篇SNP
  • 1篇AF-S
  • 1篇BLAST
  • 1篇EQ
  • 1篇NRDNA

机构

  • 2篇江苏师范大学
  • 1篇中国农业科学...

作者

  • 2篇罗永海
  • 2篇李宗芸
  • 1篇曹清河
  • 1篇谢逸萍
  • 1篇刘美艳
  • 1篇俞立璇
  • 1篇韩永华
  • 1篇石璇
  • 1篇余益成

传媒

  • 1篇作物学报
  • 1篇植物科学学报

年份

  • 1篇2016
  • 1篇2014
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNA ITS序列分析被引量:6
2014年
采用核糖体DNA内转录间隔区(nrDNAITS)序列比较分析了甘薯及其近缘野生种的遗传多样性及系统进化关系,首次报道了栽培种甘薯‘徐薯18’(Ipomoea batatas‘Xushu 18’)及其近缘野生种I.triloba(DOM),I.cordatotriloba(MEX),I.nil(PER)。I.nil(JPN)。I.hederacea Jacq.(USA),f.hederacea Jacq.(HK)和种间杂交种67-1(I.batatas‘Xushu18’×I.hederacea Jacq.)及回交种(67-1×I.batatas‘Xushu18’)的nrDNAITS序列。序列分析表明,栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNAITS序列长度为570-600bp。其中,ITS1序列为185~209bp,GC含量为53.11%~61.83%;ITS2序列为214-226bp,GC含量为61.21%-72.89%;5.8S序列均为165bp,GC含量为54.55%-55.76%。此外,栽培种甘薯及其近缘野生种ITS序列信息位点均集中在ITS1和ITS2区;与其他甘薯属植物相比,I.wrightii ITS2的末端缺失了6~8个碱基。系统进化分析表明,栽培种甘薯‘徐薯18’(I.batatas‘Xushu18’)和野生种I.triloba、I.cordatotriloba、I.ecunosa、I.trifida的亲缘关系较近,与I.wrightii、I.pes-tigridis、I.grandifolia、I.nil、I.hederaceaJacq.、I.pur-purea的亲缘关系较远;杂交后代与栽培种甘薯‘徐薯18’(I.batatas‘Xushu18’)亲缘关系较近,与野生种父本I.hederaceaJacq.的亲缘关系较远。
俞立璇刘美艳曹清河余益成谢逸萍罗永海韩永华李宗芸
关键词:甘薯NRDNABLAST系统发育树
利用简化基因组技术分析甘薯种间单核苷酸多态性被引量:18
2016年
选用Xushu 18(6x)和Nancy Hall(6x)、2个二倍体I.trifida(2x)品系(4597-10和4597-21)、四倍体I.trifida(4x)、六倍体I.trifida(6x)、二倍体I.temussima(2x)和I.littorallis(2x)以简化基因组测序技术SLAF-seq测序,获得724 589个SLAF标签,其中多态性SLAF标签35 310个。通过序列分析,获得40 765个有效单核苷酸多态(SNP),并用这些SNP分析了8个种质的群体结构和系统发生树。结果表明,利用简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低成本地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记;通过构建进化树发现甘薯栽培种和野生种I.trifida的亲缘关系比较近。这些分析结果为进一步研究甘薯栽培种的起源提供了基础数据。
石璇王茹媛唐君李宗芸罗永海
关键词:甘薯SNP进化分析
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