王庆杰
- 作品数：8 被引量：42H指数：5
- 供职机构：山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省自然科学基金现代农业产业技术体山东省现代农业产业技术体系创新团队建设专项资金系建设专项资金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 外源脱落酸处理的干旱胁迫下山桃叶片的转录组差异表达分析被引量：6
- 2020年
- 以一年生实生山桃苗为试材,通过正常培养、干旱胁迫以及干旱胁迫下外施脱落酸(ABA)的山桃叶片进行高通量转录组测序分析,探究山桃响应干旱胁迫的分子机制,筛选响应ABA处理的功能基因。结果表明:试验共构建9个文库进行转录组测序。转录组测序共获得67.14 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.81 Gb,Q30碱基百分比在91.71%及以上。与对照相比,干旱处理组差异表达基因显著上调596个,下调1 025个。与干旱处理组相比,干旱+ABA处理组差异表达基因显著上调394个,下调117个。GO富集分析表明:对照组、干旱处理组和干旱+ABA处理组在生物学途径中富集最多的类别都是代谢过程;在细胞组件和分子功能中, 3个不同处理组富集最多的基因类别均是细胞组分和催化活性相关的基因。KEGG富集分析表明:与对照相比,干旱处理组的样本有260个差异表达基因参与72条代谢途径;与干旱处理组相比,干旱+ABA处理组的样本有66个差异表达基因参与了38条代谢途径。经KEGG显著性富集分析,筛选到淀粉和蔗糖代谢、植物激素信号转导等相关基因。采用实时荧光定量PCR对筛选到的基因进行了表达检测,其趋势与转录组分析结果基本一致。
- 刘晓陈修德程宁姜珊张泽杰王庆杰王庆杰肖伟李玲肖伟付喜玲
- 关键词：山桃干旱脱落酸
- 葡萄中盐诱导的R2R3-MYB基因的筛选与表达分析被引量：9
- 2014年
- 以葡萄砧木‘1103P’为试材,筛选获得了4个受盐强烈诱导的R2R3-MYB基因,系统进化分析表明其编码蛋白属于不同的拟南芥R2R3-MYB亚组。该4个基因在根、茎、叶和果实中呈组成型表达,但具有不同的表达水平,尤其是VvMYB112在葡萄根系中具有较高的表达水平。在4个基因中,VvMYB112能响应100～200 mmol·L-1高盐处理。此外,VvMYB112和VvMYB15也能被聚乙二醇(PEG6000)和低温诱导,而VvMYB107和VvMYB87对PEG6000和低温不敏感或受其抑制。表明这4个基因可能通过不同的途径介导抗盐性。
- 王春荣王庆杰李晓玲姚玉新郝玉金
- 关键词：葡萄转录因子基因表达
- 桃GRAS家族全基因组鉴定与响应UV-B的表达模式分析被引量：7
- 2019年
- 【目的】GRAS基因家族成员在调节植物生长发育中发挥着关键作用。通过生物信息学分析GRAS在桃基因组中的分布、结构及进化,研究家族成员在不同组织中的表达特异性及其对UV-B的响应,解析GRAS基因家族的生物学功能。【方法】对设施油桃‘中油5号’(Prunus persica var.nectarina cv.Zhongyou5)补充适量UV-B(Ultraviolet-B)剂量,利用Plant TFDB数据库鉴定桃GRAS基因家族成员。采用Clustal W、MEGA6.0、ProtParam tool、MCScanX、Circos、SMART、NCBI-CDD、ExPASy、GSDS和MEME等软件构建系统进化树,绘制染色体定位图,预测蛋白的相对分子质量与等电点等理化性质等,分析GRAS基因家族成员在不同组织中的表达模式,利用qRT-PCR技术检测桃GRAS在UV-B处理下的表达情况。【结果】从桃全基因组中鉴定出48个GRAS转录因子家族基因,构建系统进化树将这48个成员分为9个亚家族,PpGRAS在桃的8条染色体上呈不均匀分布。对GRAS基因家族进行理化性质分析发现,其蛋白平均长度为590.52 aa,等电点在4.36—7.56。GRAS家族基因结构分析表明,有40个基因不含内含子,8个基因含有1个内含子。保守元件分析显示,GRAS家族包含20个保守元件,其中Motif 2和4在GRAS的家族中高度保守,同一个亚家族成员含有相同的保守元件,其可能具备相似的功能。然而,有些亚家族成员的表达模式不同,这可能与其保守基序之外的序列有关。PpGRAS在不同组织中具有不同的表达模式。叶片中PpGRAS5经UV-B处理后上调表达最显著,而有多达15个基因表达量呈现下调。果实中PpGRAS13经UV-B处理后上调表达,但有9个基因表达下调。韧皮部中,UV-B处理后有14个基因上调表达,而PpGRAS16经处理后在韧皮部中表达下调最明显。【结论】从桃基因组中共鉴定出48个GRAS基因家族成员,分布于8条染色体上;多数PpGRAS能响应UV-B处理,但在不同组织中的表达不尽相同。
- 李晨赵雪惠王庆杰王旭旭肖伟陈修德付喜玲李玲李冬梅
- 关键词：生物信息学分析UV-B
- 苹果MdcyMDH过量表达对光合、激素和生长的影响被引量：5
- 2015年
- 【目的】获得过量表达苹果细胞质苹果酸脱氢酶基因(Mdcy MDH)的苹果植株,评价其过量表达对转基因株系生长的影响,并通过光合特性和和激素水平来探讨其调控生长的机理,为进一步揭示该基因调控生长发育的机制奠定基础。【方法】从苹果叶片中克隆Mdcy MDH编码区,连接植物表达载体p BI121,转化农杆菌LBA4404;利用农杆菌侵染‘嘎啦’苹果叶片,通过叶片再生的方法获得Mdcy MDH过表达的转基因苹果株系。以分化的苹果组培苗叶片为材料,提取基因组DNA,利用来自35S启动子和转化基因序列的引物,通过PCR初步筛选转基因株系;然后,提取初筛的转基因苹果组培苗叶片RNA,分别采用半定量和荧光定量PCR的方法检测Mdcy MDH表达量,来确定Mdcy MDH过表达株系。以继代培养40和60 d的野生型和转基因苹果组培苗为材料,进行生根处理,30 d后测定Mdcy MDH过表达对组培苗表型以及株高、叶片数量、根重等生长参数的影响。以驯化的、在大田生长一年的野生型和转基因苹果苗为材料,测定叶片光合参数和叶绿素含量的变化;以组培苗为材料,利用液质联用仪测定叶片内源激素含量的变化。【结果】以苹果叶片基因组DNA为材料,PCR初步筛选获得了3个转基因株系,即Line2、Line 3和Line 4;半定量和荧光定量PCR检测发现Line 2和Line 4中Mdcy MDH表达量分别比野生型提高了12倍和5倍,因此确定以上两个株系为Mdcy MDH过表达株系。此外,Mdcy MDH过量表达也提高了叶绿体苹果酸脱氢酶基因(Mdch MDH)表达量。组培苗生根培养30 d后,Mdcy MDH过表达对转基因株系的株高、叶数目、茎粗度、地上部重量未造成显著性影响,但小幅提高了转基因株系的株高和地上部总重量;与野生型相比,Mdcy MDH过量表达显著提高了根系的重量和总鲜重。Mdcy MDH过表达显著提高了转基因株系的光合速率,Line 2和4光合速率分别提高了13.2%和15.1%
- 王庆杰金仲鑫周李杰郝玉金姚玉新
- 关键词：苹果MDH转基因生长势光合特性脱落酸
- 桃WRKY转录因子PpWRKY18克隆及表达分析
- 2021年
- 为了探究WRKY转录因子在植物抵抗逆境胁迫方面的重要作用,本研究从桃中克隆PpWRKY18基因,通过生物信息学分析PpWRKY18蛋白含有典型WRKY功能结构域。系统进化树分析表明,桃PpWRKY18与蔷薇科物种的亲缘关系最为相近。生物信息学预测PpWRKY18蛋白定位细胞核,并通过农杆菌瞬时注射烟草叶片证实PpWRKY18定位于细胞核。对PGEX-PpWRKY18融合蛋白进行诱导表达,发现PpWRKY18融合蛋白主要在包涵体中表达。荧光定量PCR结果表明,PpWRKY18受干旱诱导表达量上升,复水后PpWRKY18表达量下降。生物信息学预测显示,蛋白磷酸酶蛋白家族(Protein Phosphatase 2C)、C2H2蛋白家族(PpZAT5)、ERF蛋白家族(PpERF9)、BHLH蛋白家族(PpBHLH92)可能与PpWRKY18蛋白互作,推测PpWRKY18蛋白通过与这些蛋白互作协同响应干旱胁迫。本研究为探索PpWRKY18响应干旱的分子机制提供了理论依据。
- 李森王庆杰陈修德张蕊李玲杜桂英付喜玲
- 关键词：生物信息学分析干旱
- 桃ERF转录因子家族生物信息学分析及芽萌发相关基因筛选被引量：5
- 2018年
- 以中油四号油桃(Prunus persica var.nectarina)为研究对象,利用MEGA 6.0、MEME、GSDS和DNAMAN 6.0等软件对桃ERF家族数据进行生物信息学分析,鉴定得到102个ERF转录因子家族基因,并通过构建系统进化树将这102个基因分为10个子家族(I–X)。基因结构分析表明,有81个基因不含内含子,20个基因含有1个内含子,有1个基因与其它成员差异较大,含有5个内含子。保守元件分析表明,ERF家族包含20个保守元件,其中Motif 1、Motif 2和Motif 4都属于AP2/ERF结构域,同一个保守元件主要出现在同一个子家族中,并且大部分保守元件的功能未知。VIII子家族基因的荧光定量PCR分析表明,在桃叶芽处于不同的发育状态时,Ppe ERF068的表达量存在较大差异,光照培养箱中培养的桃芽在萌发过程中各时期表达量变化趋势进一步表明该基因可能与叶芽萌发有关,将其命名为Ppe EBB1。该研究为进一步揭示Ppe EBB1的分子机制奠定了基础,并为桃树的栽培管理和熟期调控了提供理论指导。
- 赵雪惠王庆杰李晨陈修德肖伟高东升付喜玲
- 不同砧木嫁接对‘金手指’葡萄生长和一些生理特性的影响被引量：7
- 2015年
- 以‘3309C’、‘101-14M’、‘5BB’和‘金手指’为砧木,分别嫁接‘金手指’葡萄,评价了嫁接后第2、3年不同砧木对接穗生长和一些生理特性的影响。结果表明,4种砧木均降低了‘金手指’的生长势,其中3309C对新梢生长的抑制最明显。总体上看,4种砧木均提高了‘金手指’的光合速率、蒸腾速率和气孔导度,具体调节受砧木类型和发育阶段的影响;4种砧木能不同程度提高‘金手指’茎流速率,以101-14M的提高最为明显;4种砧木均能提高接穗总氮质量分数,但不能提高K+质量分数,对Ca2+、Mg2+、Zn2+、Fe2+离子质量分数也有不同的影响。
- 袁园园门洪文马盼金仲鑫王庆杰翟衡姚玉新
- 关键词：砧木生长势光合参数茎流速率
- 桃转录因子PpWRKY11的克隆及表达分析被引量：3
- 2019年
- WRKY转录因子能够响应生物及非生物胁迫。本研究基于前期实验室桃花芽休眠解除前后表达量明显下调的Prupe.1G071400基因进行研究,通过定量PCR表明此结果与前期实验结果相符合,证明该基因可能与桃花芽休眠解除密切相关。从桃‘中油四号’叶片克隆了Prupe.1G071400基因,通过生物信息学分析,命名此基因为PpWRKY11; PpWRKY11蛋白编码282个氨基酸,包含特有WRKY结构域。进化树分析发现PpWRKY11与蔷薇科苹果和梨等亲缘关系最为相近;亚细胞定位显示PpWRKY11定位于细胞核中;酵母双杂显示PpWRKY11蛋白没有自主激活活性,进一步对PpWRKY11进行筛库,筛选出互作的蛋白;构建PGEX-PpWRKY11原核表达载体,转化大肠杆菌Rosetta(DE3)诱导出符合大小的蛋白,发现PpWRKY11蛋白主要在沉淀中。
- 王庆杰张泽杰高彦刚陈修德肖伟付喜玲李玲李冬梅高东升
- 关键词：芽休眠基因克隆亚细胞定位基因表达
