殷智婷
- 作品数:9 被引量:17H指数:3
- 供职机构:新疆农业大学更多>>
- 发文基金:新疆维吾尔自治区自然科学基金新疆维吾尔自治区科技支疆项目更多>>
- 相关领域:农业科学轻工技术与工程更多>>
- 建立李属坏死环斑病毒的逆转录环介导等温扩增检测方法
- 本发明公开了一种建立李属坏死环斑病毒的逆转录环介导等温扩增检测方法,本发明针对目的基因PNRSV的6个区域设计4条特异引物,利用一种链置换DNA聚合酶在等温65℃左右,几十分钟即可实现核酸的高效扩增;4条引物对靶序列的6...
- 罗明殷智婷韩剑周国辉张祥林董代幸
- 李属坏死环斑病毒(PNRSV)新疆巴旦木分离株运动蛋白基因(MP)克隆与序列分析
- 李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)属雀麦花叶病毒科(Bromoviridae)等轴不稳环斑病毒属(Ilarvirus),是我国二类进境检疫性有害生物.该病毒主要为...
- 韩剑罗明殷智婷周国辉张祥林
- 关键词:PNRSV运动蛋白
- 枣疯病植原体新疆分离物16S rDNA基因克隆与序列分析被引量:10
- 2012年
- 利用植原体16SrDNA基因保守序列通用引物对新疆阿克苏地区和喀什地区的疑似枣疯病植株总DNA进行常规PCR和巢式PCR检测,分别扩增出1.5kb和1.2kb的特异性片段。对片段进行克隆、序列测定分析及系统发育树构建,结果表明,新疆枣疯病阿克苏分离物和喀什分离物的16SrDNA基因序列同源性极高,达到100%,与16SrⅤ组植原体的同源性达到98.4%以上,并且与16SrⅤ-B亚组中的枣疯病山东莱芜株系、山东龙口株系同源性最高,达到99.5%,因此归属于榆树黄化组16SrⅤ-B亚组。首次报道新疆枣疯病植原体16SrDNA的序列,确定新疆枣疯病植原体的分类地位,为枣疯病的早期诊断和检测提供依据。
- 韩剑徐金虹王同仁殷智婷罗明董代幸
- 关键词:枣疯病植原体RDNA
- 枣疯病植原体环介导等温扩增快速检测方法
- 本发明公开了一种枣疯病植原体环介导等温扩增快速检测方法,本发明针对枣疯病植原体16S?rDNA基因保守序列的6个区域设计4条特异引物,利用一种链置换DNA聚合酶在等温62℃左右,几十分钟即可实现核酸的高效扩增;4条引物对...
- 韩剑罗明张祥林何贵伦殷智婷
- 文献传递
- 李属坏死环斑病毒(PNRSV)RT-LAMP检测方法的建立被引量:4
- 2014年
- 针对李属坏死环斑病毒(PNRSV)外壳蛋白(CP)基因保守序列,设计了1套特异性识别CP基因中6个不同区段的环介导等温扩增(LAMP)引物。通过对反应条件的优化,建立了适用于PNRSV的RT-LAMP检测技术,对优化后的方法进行特异性、灵敏度评价。结果显示,此方法能够特异性的检测出PNRSV,对马铃薯X病毒(PVX)、马铃薯Y病毒(PVY)、黄瓜花叶病毒(CMV)、蚕豆萎蔫病毒(BBWV)的检测均为阴性,灵敏度高于RT-PCR 10倍。
- 韩剑罗明殷智婷周国辉张祥林
- 关键词:CP基因
- 李属坏死环斑病毒新疆分离物运动蛋白基因片段的克隆与序列分析
- 2015年
- 为进一步揭示李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)新疆巴旦木分离物的分子特征、遗传变异及其与宿主之间的相互关系,采用RT-PCR方法扩增并克隆了4个PNRSV新疆巴旦木分离物运动蛋白(move protein,MP)基因片段,并进行了测序及序列同源性分析。结果表明,4个新疆巴旦木PNRSV分离物MP基因片段分别为259、258、254、260 bp;其核苷酸和氨基酸序列与已报道的PNRSV分离物的同源性分别为72.7%~91.7%和75.6%~92.9%,表现出明显差异,其中与美国分离物CH9同源性最高,分别达88.8%~91.7%和82.6%~92.9%;而与同属03亚组的苹果花叶病毒(Apple mosaic virus,Ap MV)同源性较低,仅为51.2%~58.1%和52.3%~61.9%;新疆PNRSV各分离株之间MP基因核苷酸序列同源性较高。系统发育树显示,4个新疆巴旦木PNRSV分离物与Ⅰ组代表毒株PV32的核苷酸序列同源性达88.4%~91.3%,并与Ⅰ组分离物聚集成簇,表明PNRSV新疆巴旦木分离物属于引起严重症状的Ⅰ组株系,且Ⅰ组中各分离物之间表现出一定的寄主相关性,而Ⅱ组和Ⅲ组中各分离物之间未表现出明显的寄主相关性。
- 韩剑罗明殷智婷周国辉张祥林
- 关键词:李属坏死环斑病毒RT-PCR
- 枣疯病植原体环介导等温扩增快速检测方法
- 本发明公开了一种枣疯病植原体环介导等温扩增快速检测方法,本发明针对枣疯病植原体16S rDNA基因保守序列的6个区域设计4条特异引物,利用一种链置换DNA聚合酶在等温62℃左右,几十分钟即可实现核酸的高效扩增;4条引物对...
- 韩剑罗明张祥林何贵伦殷智婷
- 建立李属坏死环斑病毒的逆转录环介导等温扩增检测方法
- 本发明公开了一种建立李属坏死环斑病毒的逆转录环介导等温扩增检测方法,本发明针对目的基因PNRSV的6个区域设计4条特异引物,利用一种链置换DNA聚合酶在等温65℃左右,几十分钟即可实现核酸的高效扩增;4条引物对靶序列的6...
- 罗明殷智婷韩剑周国辉张祥林董代幸
- 文献传递
- 李属坏死环斑病毒(PNRSV)新疆巴旦木分离物外壳蛋白基因(CP)片断的克隆与序列分析被引量:3
- 2012年
- 【目的】为了查明新疆巴旦木果树病原病毒的种类,为病毒的分子检测提供基础。【方法】采用双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS-ELISA),从巴旦木果树叶片中检测到李属坏死环斑病毒(PNRSV)。以阳性样品的总RNA为模板进行PNRSV外壳蛋白基因(CP)RT-PCR扩增,对预期430 bp大小的4个扩增产物进行克隆、测序和序列分析。【结果】结果表明,PNRSV新疆巴旦木分离物CP基因的核苷酸和氨基酸序列与世界各地已报道的分离物具有较高的同源性,分别为80.0%~97.2%和80.1%~94.1%,其中与阿根廷分离物AY217的同源性最高;而与同属03亚组的苹果花叶病毒(ApMV)同源性较低,仅为52.9%~55.4%和45.6%~48.6%。新疆PNRSV各分离物之间CP基因高度同源。序列比对与系统发生树的分析显示,PNRSV新疆巴旦木分离物的株系属于GroupⅠ组。【结论】确定了PNRSV为侵染新疆巴旦木果树的病原病毒。这是PNRSV在新疆发现的首次报道。
- 殷智婷韩剑周国辉张祥林罗明潘亚南
- 关键词:CP基因