杜淑辉
- 作品数：20 被引量：183H指数：5
- 供职机构：山西农业大学林学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山西省高等学校科技创新项目博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学更多>>
- 银腺杨84K盐胁迫应答基因PagMYBR96的克隆及表达分析
- 2022年
- 【目的】基于转录组测序分析,在银腺杨84K中鉴定到1个应答盐胁迫的MYB-related基因PagMYBR96,克隆了该基因并对其特征及参与的生物学过程进行分析,为后续基因功能及调控机制研究和林木基因工程育种提供参考。【方法】采用PCR技术从84K杨cDNA中扩增PagMYBR96基因,对其编码的蛋白序列进行理化性质分析。利用生物信息学分析,对该蛋白的保守结构域、进化关系、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、磷酸化位点、二级结构进行分析。采用农杆菌介导的烟草叶片瞬时转化试验分析蛋白亚细胞定位情况;通过酵母转化筛选试验分析蛋白的转录激活活性;通过RT-qPCR分析基因的空表达模式;借助基因共表达及功能注释与富集分析解析基因集参与到的生物学过程和代谢通路。【结果】从银腺杨84K中克隆了长度为882 bp的PagMYBR96基因,编码293个氨基酸,分子质量为33 306.33 Da,理论等电点为6.32,含有保守的MYB结构域和特征氨基酸,与长梗柳中的同源蛋白亲缘关系较近,没有跨膜区域,也不存在信号肽,可能是一个亲水性蛋白质。PagMYBR96为核定位蛋白,且在酵母中没有转录激活活性。基因时空表达模式分析结果表明,PagMYBR96在84K杨的根和叶中均可应答盐胁迫,且在胁迫初期上调表达,到达峰值后渐渐恢复。PagMYBR96及与其共表达的518个基因与细胞过程、代谢过程、生物调节、对刺激应答、发育过程等相关,且分别被显著富集到类泛素蛋白结合酶活性、类泛素蛋白转移酶活性、泛素蛋白转移酶活性和泛素结合酶活性等GO term及氨酰-tRNA生物合成、泛素介导的蛋白水解和丙酮酸代谢等通路中。【结论】银腺杨84K PagMYBR96基因可以在不同的组织中应答盐胁迫,并通过不同的生物学过程参与植物的生长发育及胁迫应答。PagMYBR96及其共表达基因的功能与泛素蛋白酶体系统介导的蛋白质降解及丙酮酸代
- 赵凯樊艳邹圣强郇旭辉杜淑辉韩有志王升级
- 关键词：盐胁迫
- 应用单拷贝核基因标记研究我国欧洲山杨自然居群的遗传多样性被引量：2
- 2016年
- [目的]对分布于我国新疆地区欧洲山杨自然居群的遗传多样性与遗传分化进行研究。[方法]对4个欧洲山杨自然居群共72个个体的6个单拷贝核基因标记(sing-copy nuclear markers)进行扩增与测序,并计算相应的遗传多样性和遗传分化参数。[结果]表明:比对后6个基因的长度在459 bp到747 bp之间,平均多态核苷酸位点个数为14,遗传多样性指数π和θw分别达到了0.004 8和0.004 4,基因多样性指数为0.73,以上结果表明欧洲山杨表现出较高的遗传多样性水平。Tajima中性检验结果均不显著,表明所用6个单拷贝核基因均符合中性进化假设。AMOVA分析表明89.72%的遗传变异存在于居群内,居群间的平均遗传分化指数Fst为0.10,居群间平均基因流(Nm)为3.235。[结论]高度异交,高碱基突变率及超长距离的基因流机制能够很好的解释我国新疆地区欧洲山杨表现出的较高的遗传多样性水平与较低水平的遗传分化。
- 杜淑辉王兆山保尔江·阿布都哈米提邢世岩张建国
- 关键词：欧洲山杨遗传分化
- 我国观赏植物新品种保护与DUS测试研究进展被引量：5
- 2010年
- DUS测试是植物新品种保护的技术基础和授予品种权的科学依据。我国观赏植物DUS测试研究相对滞后,目前已经完成约30个DUS测试指南的编制,部分指南作为行业标准或国家标准发布,但大量列入保护名录的观赏植物尚未进行测试指南编制研究。论述了我国观赏植物新品种保护和DUS测试指南研究的现状,结合已经完成的测试指南编制,对测试性状的选取进行了分析并针对存在的问题提出了建议,展望了分子标记等新的技术和方法在植物DUS测试中的应用。
- 杜淑辉臧德奎孙居文
- 关键词：园林植物观赏植物新品种保护DUS测试指南
- 中国山杨遗传多样性及遗传结构分析被引量：3
- 2018年
- 利用6个单拷贝核基因标记,对中国山杨(Populus davidiana Dode)14个自然居群的遗传多样性和遗传分化水平进行了研究。结果表明,中国山杨表现出较高的遗传多样性水平,各居群间基因流(Nm)为0.66;居群内的变异占总变异的百分比(71.82%)大于居群间(28.18%)。Mantel test检验结果显示居群遗传距离和地理距离间没有相关性。失配分布检测显示中国山杨历史上曾经历过种群的扩张。复杂的种群历史动态、高度异交和较高的碱基突变速率是中国山杨遗传多样性水平较高的原因;而较强的花粉和种子扩散能力及中国山杨的连续分布可能是其居群间遗传分化较小的原因。
- 杜淑辉王兆山胡晓艳张建国
- 关键词：中国山杨
- 木瓜属植物新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试指南的研制被引量：8
- 2011年
- 遵循国际植物新品种保护联盟及我国的相关规定,分析木瓜属植物品种的性状变异规律及其稳定性和相关性(DUS),探讨标准品种和测试性状的选择。筛选31个测试性状和12个标准品种用于新品种DUS测试;其中,质量性状10个、数量性状6个、假质量性状15个,"*"号性状24个、非"*"号性状7个,每个性状的表达状态给以相应的代码。"*"号性状主要有株型、花色、花径、重瓣性、果实形状及果皮皱缩状况等。提出木瓜属植物新品种的特异性、一致性、稳定性判别标准。
- 臧德奎马燕杜淑辉孙居文
- 关键词：木瓜属DUS测试指南
- 木瓜属新品种DUS测试指南及已知品种数据库的研究
- 木瓜属/(Chaenomeles/)植物既是我国著名的观赏花木,又是传统中药,其栽培历史悠久,种质资源丰富,近年来新品种不断涌现。但是本属新品种DUS测试和已知品种数据库的研究尚属空白。本文通过分析植物新品种保护及DUS...
- 杜淑辉
- 关键词：木瓜属DUS测试指南数据库
- 文献传递
- 山西省酸枣遗传多样性及遗传结构分析被引量：3
- 2020年
- [目的]山西省是我国酸枣集中分布区之一,开展山西省酸枣遗传多样性研究,为酸枣种质资源保护及可持续利用奠定基础。[方法]本研究利用生物信息学方法筛选酸枣中单拷贝核基因标记,对山西省14个酸枣居群的遗传多样性、遗传结构及居群动态进行分析。[结果]本研究筛选得到6个单拷贝核基因标记用于开展山西省酸枣种质资源相关研究。单拷贝核基因标记的长度为199~846 bp,分离位点数目和单倍型多样性平均值分别为37和0.857,表明单拷贝核基因标记多样性较高。中性检验表明:所有单拷贝核基因标记均符合中性进化假设。山西省酸枣表现出产高的遗传多样性(π=0.00720,θw=0.00925),这与高度异交及居群历史动态有关。失配分布分析表明:山西省酸枣在进化历史上经历过居群持续扩张,这与黄土高原地区受第四纪冰期循环影响小有关。STRUCTURE分析表明:山西酸枣居群没有形成明显的遗传结构。AMOVA分析显示:居群间遗传分化水平较高(Fst=0.145),居群内变异是总变异的主要来源(85.48%)。Mantel test表明:遗传距离和地理距离之间没有相关性(r=0.1775,P=0.216.)。[结论]单拷贝核基因标记可以应用于酸枣种质资源遗传学研究。山西省酸枣种质资源遗传多样性水平较高,居群间遗传分化较明显。
- 胡晓艳杜淑辉王兆山韩有志
- 关键词：酸枣
- 新农科背景下园林植物类课程PBL教学模式构建
- 2022年
- 目前,中国已经步入以质量提升为核心的内涵式发展的新常态,教学质量的好坏直接影响学生培养的质量,尤其对卓越农林人才培养提出更高的要求,要求农林院校对接新时代创新发展要求,着力提升学生的创新精神与科研素养。该文首先探讨传统教学模式的不足,然后基于PBL教学模式,以山西农业大学园林植物类课程教学为例,重新整合理论教学内容模块和实验教学内容,对园林植物类课程的授课方式、实验设置、综合评价进行教学改革与实践,形成一套符合一流专业建设实际需要的园林植物类课程PBL教学模式体系。
- 杜淑辉胡晓艳田旭平王志玲
- 关键词：PBL教学模式
- 黄连木变色期叶片色素变化规律及呈色机理
- 2024年
- 【目的】研究黄连木(Pistacia chinensis)秋季叶片变色期相关生理指标含量变化,揭示其叶色变化与生理特征间的内在规律。【方法】以变色期的黄连木为研究对象,对其叶色参数、色素、渗透物质、全氮、全磷含量和关键酶活性变化进行定量测定及分析。【结果】变色期黄连木叶片中叶绿素和类胡萝卜素含量不断下降,花青素含量增多,叶片变为红色;黄连木变色期叶片中花青素与色相参数a^(*)值、类胡萝卜素与叶绿素质量比、花青素与叶绿素质量比、可溶性糖、游离氨基酸含量、苯丙氨酸解氨酶和花青素合成酶活性极显著正相关(P<0.01),与二氢黄酮醇-4-还原酶活性显著正相关(P<0.05),与全氮含量显著负相关(P<0.05),与全磷含量极显著负相关(P<0.01)。【结论】黄连木秋季变色期叶片中花青素与叶绿素质量比及花青素含量在变色中期剧增是导致叶片变红的物质基础,可溶性糖含量、苯丙氨酸解氨酶活性是影响呈色的关键因子,同时,变色期矿质元素氮和磷含量显著降低,共同促进花青素合成进而对叶色产生影响。
- 许志钊杨秀云王祎琛杜淑辉
- 关键词：黄连木花青素呈色机理
- 银杏转录组数据中EST-SSR位点的生物信息学分析被引量：4
- 2020年
- 银杏(Ginkgo biloba L.)是雌雄异株植物,其植株价值因性别不同而异。银杏转录组数据中EST-SSR位点的生物信息学分析将为银杏遗传学研究开展提供重要的理论与方法支持。首先通过高通量测序技术获得银杏大、小孢子叶球转录组数据,然后开展数据拼接组装与EST-SSR位点挖掘及相应的生物信息学分析。转录组数据处理及拼接组装后共获得108307条unigenes,然后利用MISA软件发掘银杏转录组数据中的SSR位点,最终从8178条unigenes中检索出9668个SSR位点。其中,单核苷酸重复的数量最多,有5663个;其次是二核苷酸和三核苷酸,重复数量分别为2471、1438个;四核苷酸至六核苷酸重复的数量相对较少,共有96个。银杏转录组EST-SSR位点共包含147种重复基元。在单核苷酸重复中,A和T是优势重复基元类型,分别有2808、2685个;在二核苷酸重复基元中,AT与TA数量较多,分别为469、383个,所占比例为34.48%。此外,设计得到6809对银杏EST-SSR位点特异引物。银杏转录组EST-SSR位点的发掘将为银杏遗传图谱构建、遗传性状分析、幼年期性别鉴定方法的建立等提供有力的理论与方法支持。
- 秦姣姣杨玉琦胡晓艳杜淑辉
- 关键词：银杏转录组SSR位点
