朱文漓
- 作品数:6 被引量:51H指数:4
- 供职机构:四川大学更多>>
- 发文基金:通威股份科研项目四川省科技攻关计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 草鱼腺苷酸基琥珀酸裂解酶克隆及序列分析被引量:2
- 2009年
- 腺苷酸基琥珀酸裂解酶(Adenylosuccinate lyase,ADSL)是嘌呤核苷酸合成过程中的关键酶。研究以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道cDNA文库为基础,应用PCR、RT-PCR和RACE技术,成功获得了草鱼肠道组织腺苷酸基琥珀酸裂解酶基因的cDNA全长和基因组DNA全长。该基因全长1584 bp,包含一个1449 bp的开放阅读框,编码482个氨基酸,与其他脊椎动物比对显示,其序列具有较高的保守性。草鱼腺苷酸基琥珀酸裂解酶基因组DNA由13个外显子和12个内含子组成,其外显子拼接位点非常保守,遵循GT-AG原则。
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- 关键词:草鱼肠道克隆
- 草鱼肠道细胞胞质苹果酸脱氢酶基因序列
- 本发明公开了一种草鱼肠道细胞胞质苹果酸脱氢酶的基因,以本实验室保存草鱼肠道cDNA文库中胞质苹果酸脱氢酶EST序列为模版设计引物,结合RACE技术,用PCR法扩增克隆得到草鱼肠道细胞胞质苹果酸脱氢酶基因的全表达序列。对于...
- 徐恒朱文漓辜文博顾继锐吴江王娟
- 文献传递
- 草鱼肠道cDNA文库构建及部分ESTs分析被引量:22
- 2007年
- 本项研究以雌性草鱼肠道为实验材料,采用非均一化的Oligo-dT引物定向克隆技术构建了草鱼肠道组织的cDNA文库,对文库质量的分析结果表明:cDNA文库的库容量至少为2.3×105,重组率达95%,平均插入片断长度大于1000bp。挑取cDNA克隆进行5’端测序,总共进行了1571个成功反应,其中1411条ESTs长度大于100bp,初步拼接得到939个单基因簇(Unigene),其中包括188个重叠群(Contigs),751个单拷贝EST(Singletons)。使用BLAST软件将这些序列同GenBank等数据库进行比对、查询和注释,结果显示418条序列有相关同源性,其他的521(55.5%)条序列没有明显的同源性(E-valu 1.00E-10),但是也同时揭示出在这些ESTs中能够发现新功能基因的相当可能性。本研究结果对草鱼以及其他鲤科鱼类的消化系统功能基因的筛选和发现具有指导意义。此外,草鱼肠道cDNA文库的构建和EST测序工作将为草鱼基因组计划的实施奠定基础。
- 张学俊屈刚朱文漓张黎王娟吴江刘汉元陈放徐恒
- 关键词:草鱼CDNA文库EST测序
- 蛭弧菌研究进展被引量:9
- 2007年
- 蛭弧菌(Bdellovibrio bacteriovorus)是一类专性捕食革兰氏阴性菌的寄生细菌,在自然界分布广泛。蛭弧菌研究集中在蛭弧菌分类和基因组分析上,并以此指导蛭弧菌噬菌机制的研究,同时在生态学研究方面也有进展。蛭弧菌的噬菌性质可能作为一种行使杀菌功能的"活抗生素"成为目前研究热点。但在应用方面还存在一些需进一步研究和解决的问题。
- 朱文漓李永文屈刚吴江徐恒
- 关键词:蛭弧菌
- 草鱼胞质苹果酸脱氢酶(cMDH)的序列克隆及分析被引量:6
- 2008年
- 以实验室构建的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道cDNA文库苹果酸脱氢酶(cMDH)EST序列为基础,采用末端快速扩增法(RACE),从健康雌性草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道细胞RNA中获得1391 bp的草鱼肠道cMDH的cDNA序列(NCBI登录号:EU569765)。结果显示:该序列包含62 bp的5′非编码区(5′-UTR),330 bp的3′非编码区(3′-UTR),典型加尾信号AATAA位于polyA起点上游16 bp。开放阅读框ORF长999 bp,共编码333个氨基酸,预测蛋白等电点为6.67,大小为36 kDa。多序列比对显示草鱼胞质苹果酸脱氢酶具有典型的苹果酸脱氢酶功能区保守序列,该酶与斑马鱼cMDH相似度最高达到95.5%,与模式植物拟兰介的相似度为57.8%,其预测三级结构具有典型cMDH功能区。Southern杂交结果表明草鱼cMDH属于多拷贝基因家族。
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- 关键词:肠道CDNA克隆
- 大口鲶病原菌蛭弧菌的分离及其生物学特性研究被引量:14
- 2006年
- 从患病南方大口鲶分离得到病原菌N1、N2、N3、N4,以N3为宿主菌,从鱼塘淤泥中分离到三株蛭弧菌。其中蛭弧菌Bd-tw7的宿主菌范围广泛,不仅能降解嗜水气单胞菌、N1、N2、N3、N4等鱼类病原菌,而且能降解大肠杆菌C600、金黄色葡萄球菌等细菌。其在1/10NB双层琼脂平板上形成圆形透明的噬菌斑,最适温度35℃,最适pH为7.5,短杆状,单极生鞭毛。在水体防病试验中,试验组的鱼存活率明显高于对照组(P<0.05)。
- 李永文朱文漓顾继锐伍翠芳吴江谢显连徐恒
- 关键词:南方大口鲶病原菌蛭弧菌