目的研究太原市手足口病（Hand，Foot and Mouth Disease，HFMD）患者中，肠道病毒A71型（Enterovirus Type A71，EVA71）的分子进化特征。方法采集太原市HFMD患者的咽拭子和粪便标本，采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription—Polymerase Chain Reaction，RT—PCR）方法检测EV核酸。然后随机选取11株EVA71阳性标本进行衣壳蛋白（Capsid Protein）VP，编码区基因扩增、核苷酸序列测定和分析，与其他48株各基因型和基因亚型的EV71代表株构建基因亲缘性关系树。结果太原市11株EVA71均属于C4基因亚型C4a进化分支，但11株EVA71在VP1编码区核苷酸和氨基酸的同源性分别为95．7％～100．0％和99．0％～100．0％。在亲缘进化树中显示，这些EVA71处在不同的簇中，表现为11株EVA71至少属于3条病毒传播链。结论太原市流行的EVA71属于C4基因亚型C4a进化分支，并且存在多个传播链。与中国其他地区流行的EVA71在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近，说明太原市EVA71不是独立进化的，而是与中国其他地区流行的EVA71在共同进化。
