尚立国
- 作品数：20 被引量：13H指数：3
- 供职机构：中国农业科学院生物技术研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程石油与天然气工程更多>>
- 假单胞菌碳代谢抑制调控系统各组分的功能及作用机制被引量：4
- 2014年
- 在复杂的生存环境中,微生物通过碳代谢抑制作用(CCR)优先利用优势碳源,同时抑制非优势碳源的使用,进而达到最佳的生长和代谢过程。碳代谢抑制调控在细菌中普遍存在,但在不同物种间存有差异。大肠杆菌中以CRP蛋白为核心,而假单胞菌的碳代谢抑制调控以CbrAB-CrcZ-Crc为核心发挥作用,其中Crc蛋白是一个全局性的调控因子,CrcZ是一个新发现的非编码调控RNA,二元调控系统CbrAB控制CrcZ的表达,整个过程的调控复杂且高效。将国际上最新的相关进展与本实验室工作相结合,详细介绍了假单胞菌属中CbrAB-CrcZ-Crc调控系统的作用机制,有助于提高对微生物碳代谢抑制调控以及环境适应机制的认识。
- 弓湃尚立国战嵛华燕永亮林敏
- 关键词：假单胞菌CRC
- 非生物胁迫条件下施氏假单胞菌生物膜形成规律的研究被引量：3
- 2017年
- 旨在系统研究非生物胁迫因素对固氮施氏假单胞菌A1501生物膜形成能力的影响,测定了不同NaCl浓度、pH值、温度等培养条件下A1501生长及其生物膜形成能力的变化规律。结果显示,上述3种环境因素均对A1501菌的生长及生物膜形成具有影响,且呈现出一定的规律性。NaCl浓度2 mmol/L、p H值6.8、温度30℃是A1501的最适生长条件,而在0.6 mol/L的NaCl、p H值6.0及温度40℃等胁迫条件下,A1501菌的生物膜形成量均达到最高,分别为最佳生长条件下的7.8、7.0和2.0倍。在测试的诸因素中,NaCl浓度对A1501生物膜形成影响最大。以上结果表明,生物膜的形成与菌体生长负相关,即高盐、弱酸、高温等条件不利于A1501的生长,但刺激了其生物膜的形成。
- 闫宁杨智敏尚立国戴淑玲战嵛华陆伟林敏燕永亮
- 关键词：非生物胁迫生物膜形成
- 固氮施氏假单胞菌全局性调控因子RsmA的进化分析及表达特性研究
- 2014年
- RsmA是假单胞菌属高度保守的全局性调控因子,该蛋白可通过与靶基因的mRNA结合影响其稳定性或者抑制靶基因的翻译影响蛋白表达。固氮施氏假单胞菌A1501中发现一个rsmA同源基因及一个可能参与rsmA活性调节的非编码小RNA rsmZ基因。对A1501菌中RsmA及RsmZ的分子进化及表达特性进行了研究。分析结果表明,RsmA与铜绿假单胞菌同源性可达98%,RsmZ具有4个RsmA的结合位点。实时定量RT-PCR结果显示,rsmA在生长初期具有高表达量,而在指数生长期以及平台稳定期表达量下降。非编码RNA rsmZ的转录水平在整个生长时期未发生显著变化。在碳匮乏条件下,rsmA和rsmZ的表达量都显著下调。在一般胁迫σ因子rpoS突变株中,rsmA的表达未受影响,但rsmZ表达上调了30多倍,说明rsmZ的表达受rpoS的负调控。进一步发现,A1501菌中,rsmA和rsmZ的转录不受转录调控因子gacA突变的影响,这与荧光假单胞菌CHAO和铜绿假单胞菌PAO1的调控模式区别,表明RsmA的转录调控模式在固氮施氏假单胞菌A1501中有其独特性。该结果为进一步探索固氮施氏假单胞中RsmA的功能及其特定条件下的调控机制奠定了理论基础。
- 尚立国弓湃战嵛华邓志平燕永亮
- 关键词：生物固氮RSMA
- 固氮施氏假单胞菌次级代谢抑制因子RsmA的功能研究
- 生物膜的形成在微生物环境适应及其与宿主互作中发挥重要作用。假单胞菌次级代谢抑制因子RsmA被证实广泛参与包括致病性、耐药性、群体感应及生物膜形成等一系列生理过程。固氮施氏假单胞菌A1501分离自水稻根际，基因组分析表明A...
- 尚立国
- 关键词：RSMA生物固氮
- 文献传递
- 葡萄糖促进施氏假单胞菌A1501生物膜形成
- 刘亚群杨华尚立国战嵛华陆伟燕永亮林敏
- 固氮施氏假单胞菌亚硝酸盐还原酶基因nirS转录特性及功能鉴定被引量：4
- 2015年
- 【目的】研究固氮施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501亚硝酸盐还原酶结构基因nir S的转录调控机制及其在反硝化过程中的功能。【方法】构建nir S-lac Z融合载体,利用三亲本结合法将其导入野生型A1501,通过β-半乳糖苷酶活性的测定,分析不同供氧状况、不同浓度的硝酸盐、亚硝酸盐对nir S基因表达的影响;同时将该载体导入rpo N突变株中,研究氮代谢调控因子Rpo N对nir S基因转录影响。通过同源重组方法构建nir S突变株,通过生化表型测定明确nir S在反硝化过程中的功能。【结果】启动子活性测定表明,nir S基因厌氧条件下高水平表达,是好氧条件下表达水平的4倍;nir S的表达受硝酸盐诱导,但不受亚硝酸盐的诱导;Rpo N突变株中,nir S的表达活性为野生型的1/4,nir S启动子未发现Rpo N的保守结合位点,表明nir S的表达受Rpo N间接调控。表型测定显示以硝酸盐为电子受体时Δnir S的反硝化能力降低了约20%;以亚硝酸盐为电子受体时Δnir S仅有微弱的反硝化能力,并且nir S的突变使得菌体在反硝化条件下利用亚硝酸盐的能力显著减弱。nir S突变提高了菌体在亚硝酸为电子受体的反硝化条件下的固氮酶活。【结论】A1501中nir S基因的转录受外界氧及硝酸盐的影响,同时受氮代谢Sigma因子Rpo N的调控。nir S在A1501菌反硝化过程中起关键作用,参与了亚硝酸盐的转化。
- 弓湃王丽英尚立国战嵛华平淑珍燕永亮林敏
- 关键词：反硝化
- 固氮施氏假单胞菌GGDEF结构域蛋白质SadC的功能鉴定
- 环二鸟苷酸C-di-GMP是微生物中的一种重要的第二信使分子,参与生物膜形成、菌体运动、群体感应等生理活动.C-di-GMP主要由一类含有GGDEF结构域的蛋白质催化合成.固氮施氏假单胞菌(Pseudomomas stu...
- 卢佳思尚立国张云华燕永亮
- 固氮施氏假单胞菌bifA基因的功能分析被引量：1
- 2016年
- 环二鸟苷酸(c-di-GMP)是细菌中一种重要的第二信使,能够调控多种生理活动。C-di-GMP由两个GTP分子经环化酶(DGCs)合成,而被磷酸二酯酶(PDEs)降解,在铜绿假单胞菌中bifA基因为降解c-di-GMP的基因,参与了胞内c-di-GMP的浓度调节。以固氮施氏假单胞菌A1501中的bifA基因为研究对象,构建了bifA基因突变株;鉴定了bifA基因在c-di-GMP降解及生物膜形成中的功能。结果表明,bifA基因的突变造成了A1501菌中c-di-GMP的积累,同时增强了菌株的生物膜形成能力。此外bifA突变株运动能力大幅下降。由此推测bifA为c-di-GMP降解的关键基因,通过调节胞内c-di-GMP水平间接参与调控了生物膜形成以及菌体运动等生理活动。该结果为解析固氮微生物的信号传递及环境适应机制提供了理论基础。
- 卢佳思尚立国战嵛华陆伟张云华燕永亮
- 关键词：施氏假单胞菌生物膜形成磷酸二酯酶
- 施氏假单胞菌固氮生物膜形成的网络调控机制
- 自然界中,生物膜形成对细菌的环境适应至关重要,但其调控网络非常复杂,通常分为转录调控和转录后调控两种方式。大量研究发现,胞外多糖是影响生物膜形成的最重要的组分,环二鸟苷酸（c-di-GMP）则是调控胞外多糖重要的第二信号...
- 尚立国
- 关键词：C-DI-GMP
- 文献传递
- 环境因素对固氮施氏假单胞菌生物膜形成能力的影响
- 闫宁杨智敏尚立国戴淑玲战嵛华陆伟林敏燕永亮
