周宗祥
- 作品数：20 被引量：72H指数：5
- 供职机构：复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市现代生物与新药产业发展基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 一条人脑胶质瘤相关新基因的克隆与表达被引量：3
- 2006年
- 目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条与脑胶质瘤相关的新基因进行了克隆和表达的研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察二者表达谱的差异情况,对 681F05克隆子进行了Northern blot,生物信息学分析和蛋白质的表达。结果通过四次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经northern blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达, 而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52％和72％。cDNA序列分析发现这两个克隆是同一个基因[命名为cyclophilin—like gene (PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。并在大肠杆菌中得到了PPIL3a和PPIL3b与 GST较好表达的融合蛋白。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。
- 祁震宇惠国桢张世明李瑶周宗祥顾少华应康谢毅
- 关键词：基因芯片脑胶质瘤融合蛋白全长新基因
- 采用基因芯片技术获取人脑胶质瘤差异表达的基因及一条全长新基因的研究被引量：5
- 2001年
- 目的 运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因 ,并对其中一条基因进行了初步的研究。方法 抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针 ,经杂交、洗涤后 ,通过计算机观察二者表达谱的差异情况 ,对 436F11克隆子进行了northernblot,原位杂交和生物信息学分析。结果 通过四次基因芯片筛选 ,获得 15条与胶质瘤相关的新基因 ,经northernblot证实 436F11基因在人正常脑组织中高表达 ,而在人脑胶质瘤中低表达。原位杂交得到相同的结果。BLASTn和BLASTx分析显示 ,436F11基因为全长新基因 ,共编码 78个氨基酸 ,其理论分子量为 86 48Da ,等电点为 4 6 9,与鼠PKIβ 6 9%同源 ,命名为人PKIβ。 结论 基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少、高质量、高速度、高敏感等特性。人PKIβ可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因 。
- 祁震宇惠国桢李瑶唐榕周宗祥夏放顾少华应康谢毅
- 关键词：基因芯片脑胶质瘤全长基因
- FD耐热逆转录酶的部分酶学性质研究被引量：5
- 1998年
- ＦＤ耐热逆转录酶（ＦＤ－ＴＲＴ）来自一株栖热杆菌菌株．通过ＲＴ－ＰＣＲ方法，论文对ＦＤ－ＴＲＴ的部分酶学性质进行了研究．ＦＤ耐热逆转录酶能耐受９５℃的高温，最适反应温度在６５～７５℃左右，这时ＲＮＡ的高级结构能解开，可以提高逆转录反应的效率；同时引物和ＲＮＡ模板识别的专一性强，可大大提高逆转录的特异性．实验表明ＦＤ－ＴＲＴ逆转录反应的最适条件为：２５ｍｍｏｌ／ＬＴｒｉｓ－ＨＣｌ（ｐＨ８．８，１５ｍｍｏｌ／Ｌ（ＮＨ４）２ＳＯ４，１００μｇ／ｍｌ明胶，５００μｍｏｌ／ＬｄＮＴＰｓ，２５ｐｍｏｌ逆转录引物，１ｍｍｏｌ／ＬＭｎＣｌ２，２ＵＦＤ耐热逆转录酶，反应在６５～７０℃下进行．在上述条件下，用ＲＴ－ＰＣＲ可检出少于５ｐｇ外周血总ＲＮＡ中特异的α珠蛋白ｍＲＮＡ．
- 郑佐华周宗祥朱蔚殷长传季朝能毛裕民
- 关键词：逆转录酶耐热逆转录PCR
- 编码序列的(G+C)%与蛋白质的耐热性相关性分析被引量：7
- 1999年
- 运用计算机统计方法，对以木糖异构酶为主的几个蛋白质家族的核酸和氨基酸序列进行分析，发现密码于各位上的（G+C）％与编码序列的（G＋C）％成线性正相关。大多数氨基酸的含量与编码序列的（G＋C）％也存在相关性。按其相关性，将氨基酸分为正相关、负相关和不相关3类。对木糖异构酶氨基酸序列和酶的耐热性的统计发现，那些在统计学上显著的、可能提高蛋白质耐热性的氨基酸替换，往往伴随着编码序列中GC含量的上升。这提示了GC的水平上升，不仅能提高核酸的稳定性，而且有助于提高蛋白的耐热性。
- 朱蔚郑佐华袁有忠周宗祥毛裕民
- 关键词：木糖异构酶耐热性
- 人脑胶质瘤差异表达的基因的获得及一条全长新基因的克隆
- 本实验运用基因芯片筛选出与胶质瘤相关的新基因.通过大规模cDNA测序,从人胎脑cDNA文库中克隆到两条新的cDNA序列,cDNA序列分析发现是同一个基因peptidylprolyisomerase(cyclophilin...
- 祁震宇惠国桢李瑶周宗祥顾少华应康谢毅
- 关键词：胶质瘤基因芯片CDNA文库克隆基因
- 文献传递
- RBM13 cDNA的克隆及其表达谱分析被引量：20
- 2000年
- 从人胎脑cDNA文库中克隆到一条长3479bp的cDNA，它含一个长903bp的开放阅读框架，拟编码一个300个氨基酸的蛋白质，其分子质量为35397u，等电点为5．35，与酵母MAK16蛋白的同源性为41％，该编码蛋白有一个双侧核定位信号motif和一个RNA结合motif，将这一新cDNA序列推导的蛋白命名为RNA结合基序蛋白13（RBM13），基因定名为RBM13，用RBM13基因的cDNA探针进行Northern杂交，检测到3．6kb和2．2kb二种长度的转录本。在心脏，骨骼肌，肾脏和肝脏中有较高表达。
- 周宗祥徐坚等
- 关键词：CDNA克隆NORTHERN杂交表达谱RNA结合蛋白
- 一个耐热碱性磷酸酯酶突变型的研究被引量：3
- 2000年
- 为了进一步揭示蛋白质的耐热机制，对含有耐热碱性磷酸酯酶（ＦＤ－ＴＡＰ）的表达质粒ｐＴＡＰ５０３Ｆ进行了随机诱变，用菌落原位显色法从约５０００个转化子中筛选到４个耐热性下降的突变型克隆，并对其中１个克隆（ＴＡＰＭ３）进行了部分酶学性质、ＤＮＡ和氨基酸序列的研究。酶学性质研究表明，与野生型相比，该突变型酶的耐热性有较大幅度的下降，而热激活性无明显改变。 ＤＮＡ序列分析表明在１２３９位ＴＡＰＭ３发生Ｇ→Ａ转换，导致４２７位的甘氨酸变为丝氨酸（Ｇ４２７５），这种突变对酶的耐热性、米氏常数、活化能影响较为明显。这说明只须１个氨基酸置换就会对蛋白质耐热性变化起巨大作用，并且氨基酸残基侧链的大小、电荷等能使蛋白质结构松散的性质，会导致蛋白质耐热性下降。
- 袁有忠赵思汇周宗祥季朝能盛小禹毛裕民
- 关键词：耐热碱性磷酸酯酶蛋白质耐热机制
- 一种耐热碱性磷酸酯酶及其表达
- 本发明属生物工程技术领域，涉及一种耐热碱性磷酸酯酶。本发明提供了该耐热碱性磷酸酯酶的氨基酸序列，以及编码该氨基酸序列的DNA片段。本发明还包括克隆有该DNA片段或其一部分的表达载体和生产该重组酶的方法。同时还涉及利用该酶...
- 盛小禹毛裕民袁有忠季朝能周宗祥
- 文献传递
- 利用基因芯片对一高保守基因进行肿瘤相关分析被引量：2
- 2002年
- 本文对大规模人类cDNA测序过程中获得的一条高保守基因进行了初步功能研究 ,生物信息学研究发现该基因在人类、小鼠、果蝇、拟南芥和裂殖酵母中都有很高的保守性 ,其他分析预测该基因可能具有肿瘤相关性。RT -PCR分析表明 ,该基因在成人和胎儿组织中广谱表达。利用基因芯片分析该基因在 7例肝癌、5例胰腺癌、2例喉癌和 2例肺癌中表达情况 ,结果证实了该基因的肿瘤相关性 ,并且提示该基因在不同肿瘤类型中可能处于不同的地位。
- 程超周宗祥徐明赵炜徐坚曾立黄燕吴奇涵戴建锋应康谢毅毛裕民
- 关键词：基因芯片结构域
- 高三尖杉酯碱对HL-60细胞和QGY7703细胞的作用研究被引量：1
- 2001年
- 采用MTT法和流氏细胞仪技术 ,研究了高三尖杉酯碱对HL -60细胞和QGY770 3细胞的存活率和细胞周期分布影响。结果表明 ,高三尖杉酯碱对HL -60细胞的IC50 是 1 .2 8umol.L-1,对QGY770 3细胞的IC50 是 0 .5 5umol.L-1。高三尖杉酯碱处理HL -60细胞 2 4h后 ,G0 -G1期细胞分布有所增加 ,G2 -M期和S期细胞分布有所降低 ;高三尖杉酯碱处理QGY770 3细胞 2 4h后 ,G2 -M期分布略有降低 ,G0 -G1期细胞分布略有增加 ;高三尖杉酯碱处理HL -60细胞2 4h后 ,G0 -G1期峰前有亚二倍体峰出现 ,说明高三尖杉酯碱在所用剂量下能够诱导HL -60细胞发生凋亡。
- 金伟黄青山侯俊梅王亚威周宗祥应康谢毅毛裕民
- 关键词：高三尖杉酯碱细胞毒细胞周期HL-60细胞抗癌药
