单文娟
- 作品数：37 被引量：101H指数：6
- 供职机构：新疆大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技攻关计划新疆维吾尔自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 基于线粒体基因的新疆托氏兔遗传多样性和种群遗传结构评价
- 2022年
- 旨在利用线粒体基因测序方法评价新疆托氏兔的遗传多样性水平,并探究亚种间的遗传结构。本研究通过PCR扩增及测序技术,获得来自新疆北部、西北部以及中东部地区的共计78例新疆托氏兔线粒体DNA的CO1和D-LOOP基因序列,并采用生物信息学的方法进行数据分析。结果表明,78个新疆托氏兔样本的合并序列共定义了68种单倍型,新疆托氏兔的单倍型多样性(h=0.996±0.002)和核苷酸多样性(π=0.049±0.023)均较高;系统发育关系和单倍型中介网络图显示,本研究中的托氏兔样本被分成3个大枝(Clade A-C),其中Clade A和C包含绝大多数来自新疆北部和西北部组群的野兔,即托氏兔西域亚种,Clade B中的野兔绝大多数来自新疆中、东部地区,即托氏兔中亚亚种,除小部分样本较为混杂,其余样本的聚类情况与其分布范围和地理距离相吻合;AMOVA分析、Fst以及基因流结果显示,新疆托氏兔亚种间遗传分化较大、基因流较小,亚种内遗传分化相对较小、基因流相对较大。中性检验结果显示,新疆托氏兔群体Tajima`D值为1.075(P>0.05),Fu`s Fs为-15.100(P<0.01),核苷酸错配分布呈现多峰,EBSPs分析显示新疆托氏兔在距今大约0.01 Ma时发生过种群扩张。基于线粒体2个基因的综合分析结果表明,新疆托氏兔具有丰富的遗传多样性和较明显的系统地理分布格局;西域亚种的北部和西北部组群间存在较强的基因流和较小的遗传分化,但中亚亚种的中部和东部组群间出现了较大的分化,可能是由于较远的地理距离所致;此外,新疆托氏兔近期经历过种群扩张。
- 米热姑丽·麦麦提周世玉刘鹏孟阳聂文悦滕培晨单文娟
- 关键词：D-LOOP
- 新疆草兔的种群遗传结构和亚种分化被引量：12
- 2011年
- 新疆草兔(Lepus capensis)的群体遗传结构至今无系统的研究报道,亚种水平的分类也长期存在争议。该文测定了形态分类上的新疆草兔3个亚种共87个个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区(control region,D-Loop)592bp的序列,经分析发现148个多态性位点,共定义了44个单倍型。新疆草兔的单倍型多样度(h,0.977±0.005)和核苷酸多样度(π,0.064±0.031)都较高,显示了较高的遗传多样性。分子变异分析(AMOVA)结果显示,4个地理群体间的显著分化可能是由地理隔离造成的。群体遗传结构分析显示,新疆草兔包含4个进化枝,并且每个进化枝都对应特定的分布区域,显示了明显的系统地理结构。该研究的结果支持形态分类上草兔西域亚种(L.c.lehmanni)的分类地位;但中亚亚种(L.c.centrasiaticus)被分为两个独立的进化枝,提示可能存在两个亚种;帕米尔亚种(L.c.pamirensis)与其他亚种间的遗传距离在13%以上,提示其可能已达到种的分化水平。
- 单文娟刘江马合木提.哈力克
- 关键词：草兔线粒体DNA控制区群体遗传多样性亚种分化
- 运用多重PCR技术鉴定新疆喀什地区塔里木兔性别被引量：1
- 2020年
- 塔里木兔是新疆重要的野生保护动物之一,而性别鉴定是开展野兔种群现状、群体遗传学和生态学研究的基础和前提工作.文章以新疆喀什地区85例未知性别的塔里木兔样本为研究对象,样本类型包括血液、肌肉、皮张等,通过改良的酚-氯仿法提取高质量的野兔基因组DNA,利用兔类SRY(Sex Determining Region Y)和APP(Amyloid Precursor Protein)基因的两对特异性引物,采用多重PCR的方法对其性别进行鉴定,成功鉴定出了43例雌性,42例雄性塔里木兔,雌雄比例为1.02∶1,说明了该地区塔里木兔性别比例平衡,野兔群体具有较强的繁殖潜力.本研究中的多重PCR方法可以对塔里木兔的性别进行快速、准确地鉴定,获得的实验结果可为今后塔里木兔的生物学研究和保护利用等提供基础数据.
- 单文娟张玉琮徐艺玫杨羽茜代慧英马衣努尔·吐尔孙
- 关键词：性别鉴定SRY基因多重PCR
- 基于线粒体基因的新疆三种野兔分类及遗传多样性被引量：2
- 2020年
- 旨在利用分子遗传学方法探讨新疆3种野兔的系统发育关系和遗传多样性,以期明确其亲缘关系和分类地位,并评估其遗传多样性水平,为后续新疆野兔乃至中国野兔的保护遗传学等研究提供基础数据。本研究选用线粒体DNA的COI、ND4、16S rRNA 3个基因为分子标记,通过PCR扩增及测序技术分别测定采自新疆8个地区、4个地理组群共计57例野兔组织样本的3个基因序列,将序列校正拼接后用MEGA 7、DNAsp 6、Arlequin 3.1、MrBayes 3.2等软件进行数据分析。结果表明,将57例野兔样本的3个基因序列合并后共检测到43种单倍型,系统发育和中介网络图将相同及相邻地区的野兔划分为5个支系(Clade A-E)3大枝,且3大枝之间的遗传距离(4.21%~9.09%)均达到种间距离水平;其中,第3大枝中来自中部地区的野兔(Clade D)和新疆北部野兔(Clade E)的亲缘关系较近,二者之间的遗传距离≤2.26%,未达到种间遗传距离水平。新疆3种野兔中塔里木兔、藏兔帕米尔亚种和托氏兔西域亚种的单倍型多样性(h)较高,分别为0.979±0.014、0.972±0.064和0.972±0.064,而托氏兔西域亚种和中亚亚种的核苷酸多样性(π)较高,分别为0.033±0.018和0.023±0.015。基于线粒体3个基因的综合分析结果,结合已报道文献,本研究认为来自新疆西南部帕米尔高原的野兔应属于藏兔帕米尔亚种,支持将来自新疆北部阿勒泰及中部达坂城和托克逊地区的野兔分别划分为托氏兔西域亚种和托氏兔中亚亚种。新疆3种野兔具有丰富的遗传多样性和较明显的系统地理分布格局。
- 单文娟代慧英张玉琮
- 关键词：系统发育MTDNA
- 新疆家蚕抗菌肽(Cecropin-XJ)特性的研究被引量：13
- 2004年
- 探讨了新疆家蚕抗菌肽 (Cecropin -XJ)的抗菌特性。根据琼脂糖孔穴扩散法 ,检测抗菌肽的热稳定性、抑菌效价、对氨苄青霉素抗性菌的抑菌作用 ,检测抗菌肽对酸碱盐、人造胃液的耐受性及其抗菌谱。结果表明新疆家蚕抗菌肽 (Cecropin -XJ)具有很强的热稳定性、能够杀灭氨苄青霉素抗性菌、对酸碱盐、人造胃酸有一定的耐受性 ,其杀菌活力为 :1μg/ μl抗菌肽与 2 4 0 0 0单位的氨苄青霉素杀菌活力相当。新疆家蚕抗菌肽能够杀灭革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌 ,而对革兰氏阳性菌的抗菌活力高于革兰氏阴性菌 ,这一发现将为抗菌肽在农业、医疗卫生、畜牧业等方面的应用奠定基础 。
- 刘忠渊张富春蔡伦赵干单文娟钟哲王宾
- 关键词：新疆家蚕抗菌肽抗菌特性热稳定性
- 大肠杆菌nhaB基因的克隆及序列分析
- 2003年
- 采用PCR扩增的方法 ,从大肠杆菌DH5α中克隆获得了 1 5kb的Na+ H+ 反向运输体DNA片段 ,经过测序和序列分析 ,发现该基因片段包含了nhaB基因完整的读码框架。采用DNA序列同源性分析方法 ,结果显示大肠杆菌DH5αnhaB基因与E coliK12nhaB基因同源性高达 99% ,与E coli 0 15 7:H7和Shigellaflexneri的同源性均为 98% ,与Salmonellaenterica的同源性为79 % ,表明nhaB基因在细菌中是普遍存在的一种Na+ H+ 反向运输体基因。nhaB基因与大肠杆菌的耐盐性有着密切的关系 。
- 李金耀马纪单文娟王宾张富春
- 关键词：大肠杆菌基因克隆PCR扩增耐盐性基因改良
- 草原兔尾鼠卵透明带3在Pichia pastoris酵母中的分泌表达被引量：1
- 2004年
- 本研究通过酵母Pichiapastoris系统表达草原兔尾鼠卵透明带 3(lZP3)蛋白 ,获得控制害鼠生育研究的抗原物质。根据本实验室克隆获得的lZP3基因序列设计引物 ,并分别在 5’引物和 3’引物中引入了EcoRI和XbaI酶切位点。经PCR扩增 ,将lZP3克隆至穿梭质粒pSuperY上 ,获得的重组穿梭质粒pSuperY -lZP3经线性化后 ,采用电激法将重组穿梭质粒转入酵母SMD116 8菌株中 ,Zeocin+筛选阳性克隆 ,经小瓶发酵后 ,取上清作SDS -PAGE和Western -blot检测 ,结果表明lZP3在酵母中得到了成功表达 ,表达产物的分子量约为 5 5kD 。
- 单文娟张富春刘忠渊朱馨蕾
- 关键词：草原兔尾鼠卵透明带3PICHIAPASTORIS
- 单引物方法克隆盐角草orf25基因被引量：3
- 2003年
- 采用单引物RT PCR扩增的方法 ,从新疆野生植物盐角草 (Salicorniaeuropaea)中克隆获得了 1.7kb的cDNA片段 ,经过测序和序列分析 ,发现基因片段包含了orf2 5基因完整的读码框架。采用序列同源性分析方法 ,结果显示新疆盐角草orf2 5基因与甜菜线粒体同源性高达 98% ,与烟草线粒体同源性达到 95 % ,与小麦同源性为 92 % ,与玉米同源性为 88% ,表明orf2 5基因在植物中是高度保守的一种基因 ,同时说明野生植物盐角草中也存在与农作物相似的雄性不育相关基因 ,orf2 5基因编码的功能性蛋白可能在影响植物雄性不育改良作物品种方面具有重要的意义。
- 李金耀张富春马纪单文娟王宾
- 关键词：植物雄性不育基因克隆
- 基于头骨形态指标的新疆野兔年龄鉴定被引量：4
- 2021年
- 为了解新疆野兔的种群年龄结构,从头骨计量学方面探讨新疆野兔的年龄鉴定依据,试验用碱腐蚀法将采自新疆不同生境中的139例兔属样本的头骨制作成标本,测量6项头骨指标并进行性别差异分析和主成分分析,制作不同生境野兔的颅全长频数分布图,划分年龄组,分析分布形式。结果表明:6项头骨变量均无性别差异,颅全长是最具有代表性的生长指标,不同生境野兔的颅全长频数分布图明显呈两头低、中间高的分布形式,根据颅全长频数分布图划分了幼年组、亚成年组、成年组、老年组,且亚成年组和成年组个体较多,而幼年组和老年组数量较少。说明以颅全长鉴定兔属动物年龄的方法是可行且可靠的。不同生境中野兔的颅全长存在一定差异,推测这可能与气候、海拔等自然因素有关。不同年龄组分布结构表明目前新疆野兔种群数量呈稳定增长模式。
- 代慧英单文娟
- 关键词：头骨形态年龄鉴定种群年龄组成
- 基于RNA-Seq技术的野生和圈养塔里木马鹿皮肤组织转录组比较分析
- 2023年
- 为探寻野生和圈养塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)的基因表达谱是否存在差异,并进一步筛选该物种适应干旱环境的相关基因,利用RNA-Seq技术对野生和圈养塔里木马鹿的皮肤组织进行转录组测序,对测序数据质控后比对参考基因组,筛选差异表达基因并对其进行功能注释和富集分析,利用qRT-PCR方法对转录组测序结果进行可靠性检测。结果显示:与圈养塔里木马鹿相比,在野生塔里木马鹿皮肤组织中共有3 303个差异表达基因,包括上调表达基因1 535个,下调表达基因1 768个,其中上调表达基因显著富集在221个GO terms和12个KEGG通路上,下调表达基因显著富集在1 104个GO terms和38个KEGG通路上;qRT-PCR分析结果显示,转录组测序结果可靠。相比于圈养塔里木马鹿,皮肤和表皮发育相关基因、DNA损伤修复相关基因、转谷氨酰胺酶编码基因和热休克蛋白家族基因在野生塔里木马鹿皮肤组织中上调表达,表明这些基因可能直接或间接参与塔里木马鹿在极端干旱炎热环境中的皮肤保护策略,通过最大限度地减少水分流失和调节体温来保护机体免受外界刺激的损伤。皮肤发育相关基因(K2C6A)、热应激相关基因(HSPA4、TRAP1和HSPH1)和氧化应激相关基因(PRDX2和PRDX6)在塔里木马鹿干旱环境适应性中可能发挥潜在作用。
- 布威海丽且姆·阿巴拜科日单文娟马合木提·哈力克钟林强
- 关键词：塔里木马鹿转录组差异表达基因
