万晓华
- 作品数:21 被引量:3H指数:1
- 供职机构:中国科学院计算技术研究所更多>>
- 发文基金:中国科学院知识创新工程重要方向项目国家自然科学基金中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 芸香科多物种密码子使用模式分析方法和系统
- 本发明涉及一种芸香科多物种的密码子使用模式分析方法,包括:通过芸香科的多个物种的基因数据,获取每个该物种的密码子序列;提取该密码子序列的第一特征值,以该第一特征值的关系验证该多个物种的进化关系;提取该密码子序列的第二特征...
- 万晓华申泽南张法张金智甘志猛
- 文献传递
- ATOM 1.0:基于GPU的电子断层重构软件被引量:1
- 2011年
- 电子断层成像技术能够在纳米尺度下重构出不具有全同性的细胞或大分子的三维结构,正受到越来越广泛的重视。针对现有电子断层成像技术中重构软件的不足,特别是迭代重构算法速度慢的缺点,我们开发了一款基于Graphic Processor Unit(GPU)平台的电子断层重构软件——ATOM,实现了图像对位、重构参数计算、三维重构及数据可视化等电子断层重构的基本功能。其中,在二维对位方面,ATOM实现了迭代的无标记平移和旋转对位;在三维重构方面,实现了背投影和多种迭代重构算法,并实现了迭代重构在GPU平台上的并行加速,获得了良好的加速比,如SIRT算法得到了47倍加速比。ATOM是绿色开源软件,可以运行在支持Qt和CUDA的所有操作系统上。ATOM为图形界面软件,结合详尽的安装及使用文档,便于用户使用。
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- 关键词:GPU加速图形界面
- 用于从遥感图像中识别不透水面的模型及训练模型的方法
- 本发明提供一种用于从遥感图像中识别不透水面的模型,所述模型包括编码器、与编码器输出相连的解码器、与解码器输出相连的分类器,其中:所述编码器包括多层逐层加深的特征提取模块,用于逐层提取输入遥感图像中的包含空间信息的不透水面...
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- 文献传递
- 一种高分辨率遥感图像变化检测方法、系统及装置
- 本发明公开了一种高分辨率遥感图像变化检测方法,包括:构建孪生神经网络模型,以Dice损失函数和交叉熵损失函数构成的联合损失函数作为该孪生神经网络模型的损失函数;构建数据集,以该数据集对该孪生神经网络模型进行训练及评估,以...
- 万晓华曹召宾张法谭光明刘新宇
- 文献传递
- 基于卷积神经网络的ET细胞图像自动分割方法及系统
- 本发明提出基于卷积神经网络的ET细胞图像自动分割方法方法及系统,包括:获取待图像分割的ET细胞图像作为原始图像,根据预设的原始顺序切分该原始图像,得到多个图像块,利用多个由卷积层构成的下采样模块,对该图像块进行压缩,得到...
- 万晓华张恩泽张法
- 文献传递
- 一种二维冷冻电镜图像去噪模型的训练方法、去噪方法
- 本发明提供一种二维冷冻电镜图像去噪模型的训练方法,所述方法包括:S1、获取原始图像数据集,从原始图像数据集中提取每个图像对应的纯噪声区域以获得纯噪声样本并组成纯噪声数据集;S2、采用步骤S1获得的纯噪声数据集训练生成式模...
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- 文献传递
- 一种冷冻电子断层三维重构的并行迭代算法被引量:2
- 2009年
- 迭代重构算法是当前解决冷冻电子断层三维重构问题的有效算法,但其海量计算需求限制了其广泛应用.提出了一种冷冻电子断层三维重构的并行迭代算法,在曙光4000H高性能计算机上的实验结果表明并行迭代算法不仅能够获得较好的加速性能,而且能够有效提高重构结果的精度.
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- 关键词:迭代算法并行计算
- 电子断层三维重构迭代算法及其基于GPUs的高效并行
- 电子断层技术允许在分子分辨率级上研究复杂生物大分子的三维结构.迭代重构算法是解决其三维重构问题的有效算法,但由于收敛速度慢,计算量大没有得到广泛应用.本文针对联合代数迭代算法的缺点提出了一种针自适应联合代数迭代算法,采用...
- 万晓华张法储琪刘志勇
- 关键词:并行计算GPUS
- 文献传递
- 一种基于卷积神经网络的三维颗粒类别检测方法及系统
- 本发明提出一种基于卷积神经网络的三维颗粒类别检测方法和系统,包括:构建包括混合尺度的三维扩张卷积层、稠密连接和损失函数的三维混合尺度密集卷积神经网络,用已标注颗粒坐标的三维冷冻电子断层图像训练该卷积神经网络,得到颗粒挑选...
- 张法郝语万晓华刘志勇李锦涛
- 文献传递
- 一种基于磁共振血管造影图像的脑血管分割方法和系统
- 本发明提出一种基于磁共振血管造影图像的脑血管分割方法和系统.发明目的是解决现有的基于统计模型的MRA图像脑血管分割方法中对细小血管的分割效果较差,血管的连续性不足的问题。针对已有模型中采用的单高斯模型来刻画脑血管灰度值分...
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