马群群
- 作品数：10 被引量：19H指数：3
- 供职机构：中国水产科学研究院东海水产研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点分析被引量：5
- 2011年
- 根据拟穴青蟹(Scylla paramamosain)线粒体全序列设计引物,采用PCR产物双向测序法,克隆了线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因部分序列(761 bp),并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs位点。共分析了采自福建省宁德市的16只拟穴青蟹,另外,从GenBank数据库中下载了31条前人提交的拟穴青蟹COI基因序列(长度在425-522 bp之间)。利用MEGA4.0软件对所有序列进行比对分析,结果表明碱基T、C、A和G的平均含量分别为37.6%、17.8%、28.9%和15.7%,G+C的含量平均为33.5%。分析结果表明,在所克隆的761 bp的COI基因序列中共发现29个SNPs位点,其出现频率为3.8%。在这29个SNPs位点中,13个为C/T转换(占44.8%),12个为A/G转换(占41.4%),2个为A/T颠换(占6.90%),1个为G/C颠换(占3.45%),另有一个位点(201 bp处)发生了A/C颠换和C/T转换两种类型的碱基替换。氨基酸分析表明,在29个SNPs位点中,有9个位点属于非同义突变,引起了氨基酸的变化;其他20个位点属于同义突变,未引起氨基酸的变化。这将为拟穴青蟹遗传背景和群体遗传多样性研究提供新的分子标记。
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- 关键词：拟穴青蟹COI基因SNPS聚合酶链式反应
- 拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点筛选
- 本研究根据拟穴青蟹(Scylla paramamosain)线粒体全序列设计引物，采用PCR 产物双向测序法，克隆了线粒体细胞色素C 氧化酶亚基I（COI)基因部分序列(765bp)，并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs 位...
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- 关键词：拟穴青蟹聚合酶链式反应基因序列分子标记
- 文献传递
- 拟穴青蟹SNP和SSR标记开发及系谱认证技术的建立研究
- 拟穴青蟹/(Scylla paramamosain/)隶属于甲壳纲/(Crustacea/)、十足目/(Decapoda/)、短尾亚目/(Brachyura/)、梭子蟹科/(Portunidae/)、青蟹属/(Scyll...
- 马群群
- 关键词：拟穴青蟹SNPS微卫星标记亲子鉴定亲缘关系分析
- 文献传递
- 拟穴青蟹功能基因来源SNP标记的开发与评价
- 单核苷酸多态性（SNPs）标记非常适用于遗传学和进化学研究。本研究首次报道了重要经济蟹类一拟穴青蟹的SNP标记。对15个功能基因的部分序列进行测序,获得了12,500 bp的高质量DNA序列。通过对8个不同个体的同源序列...
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- 关键词：拟穴青蟹单核苷酸多态性
- 文献传递
- 利用微卫星标记比较分析拟穴青蟹不同家系的遗传多样性被引量：12
- 2011年
- 拟穴青蟹（Scylla paramamosain）是我国重要的海水养殖蟹类,随着市场需求量的增加及养殖规模的不断扩大,有必要培育高产、抗逆的优质新品种。家系选育是选择育种的有效途径,目前已应用于拟穴青蟹人工育种工作中。本研究利用8个微卫星标记对拟穴青蟹6个家系共275 ind个体进行了遗传多样性分析,共检测到50个等位基因,平均每个位点4-8个,其中3个家系各自在1个位点表现为单态,8个位点的PIC、HO和HE分别在0.40-0.77、0.33-0.81和0.42-0.80之间。对6个家系的分子方差分析（AMOVA）结果显示,家系间的固定系数FST=0.205 7,即总的遗传变异中有20.57%的变异来自家系间,79.43%的变异来自家系内。根据遗传距离采用UPGMA法对6个家系进行聚类分析,4号家系和5号家系之间的遗传距离最小,先聚合在一起,2号家系和6号家系间的遗传距离最大。本研究将为拟穴青蟹家系选择育种提供一定的理论依据。
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- 关键词：拟穴青蟹微卫星家系
- 拟穴青蟹种质资源与转录组测序研究
- 拟穴青蟹是我国重要的海水养殖蟹类和海洋渔业资源，在我国水产养殖产业中占有重要的地位。本研究分析了青蟹属4种青蟹的线粒体COI基因序列，建立了基于PCR方法的分子鉴定技术。采用5种方法开发了拟穴青蟹的多态性徼卫星分子标记。...
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- 关键词：拟穴青蟹种质资源转录组测序
- 拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点筛选
- 本研究根据拟穴青蟹(Scylla paramamosain)线粒体全序列设计引物,采用PCR产物双向测序法,克隆了线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因部分序列(761bp),并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs位点.共...
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- 关键词：拟穴青蟹COI基因SNPS聚合酶链式反应
- 一种拟穴青蟹基于微卫星标记的系谱认证方法
- 本发明涉及一种拟穴青蟹基于微卫星标记的系谱认证方法，包括：（1）基因组DNA提取；（2）微卫星引物的PCR扩增；（3）扩增产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳；（4）家系区分。本发明能够克服物理标记的不足，可准确、有效区分拟穴青...
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- 文献传递
- 拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点筛选
- 本研究根据拟穴青蟹(Scyllaparamamosain)线粒体全序列设计引物，采用PCR产物双向测序法，克隆了线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因部分序列(765bp)，并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs位点。共分...
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- 关键词：拟穴青蟹COI基因聚合酶链式反应序列克隆群体遗传多样性
- 拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点筛选
- 本研究根据拟穴青蟹(Scylla paramamosain)线粒体全序列设计引物,采用PCR产物双向测序法,克隆了线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ (COI)基因部分序列(765bp),并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs位点....
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- 关键词：拟穴青蟹COI基因单核苷酸多态性SNPS
