马俊才 作品数:90 被引量:200 H指数:8 供职机构: 中国科学院微生物研究所 更多>> 发文基金: 国家科技基础条件平台建设计划 国家高技术研究发展计划 中国科学院战略性先导科技专项 更多>> 相关领域: 生物学 自动化与计算机技术 农业科学 文化科学 更多>>
语义网在生物安全监测领域的应用研究 2018年 近年来,随着各个学科领域数据信息的不断增长,语义网的研究及应用逐渐变成了热点及难点,一个重要的原因就是对知识共享、知识集成及知识使用的强大需求。生物安全是当今社会关注的重要问题之一,新发突发传染病、蚊虫等重要传播媒介与疾病传播等一系列安全问题影响着人类的日常生活、国家经济等。本文首先对语义网的相关技术进行介绍和总结,如RDF、本体等,并着重将语义网相关技术应用在生物安全监测领域上,利用现有的标准体系框架,建立适合生物安全监测的统一数据标准体系及数据整合与转换技术,便于进一步数据集成、数据挖掘。 李博 戚晓鹏 李言飞 陈强 马俊才 孙清岚 王松旺关键词:语义网 知识共享 RDF 本体 枣疯病传病途径的研究 被引量:31 1984年 枣疯病是我国枣树上一种严重的传染性病害。多年试验表明:土壤、花粉、种子均不传病,病叶汁液接种以及病健树根系在地下的自然接触也不传病;人工嫁接虽可传病,但枣树繁殖一般不通过嫁接,因而不是自然传病的途径。经过对在枣树上活动害虫的系统调查,1980年于河北玉田选常见的11种叶蝉进行了传病实验,证明橙带拟菱纹叶蝉(Hishimonides aurifacialis Kuoh)、凹缘菱纹叶蝉(Hishimonus sellatus Ulhler)和红闪小叶蝉(Typhlocyba sp.)均能传播枣疯病。从接种发病的实生枣苗维管束和媒介叶蝉的唾液腺的超薄切片中,都检查到枣疯病原类菌原体。鉴于这三种叶蝉普遍存在于北方枣区。因此,认为是枣疯病在北方枣区自然传病的主要媒介。 陈子文 张凤舞 田旭东 张金歧 王祈楷 史春霖 马俊才关键词:枣疯病 盐碱地 枣树 类菌原体 类枝原体 枣苗 提高用户满意率的服务器主动调度算法 2013年 在集群环境中,为了实现多台计算机协同工作,充分利用服务器的计算能力,需要选用恰当的负载均衡策略.目前常用的服务器调度策略只是从服务器角度出发,实现硬件负载的均衡,而忽略了服务质量.本文算法定义了用户满意率(即"用户期望的任务完成时间"与"任务实际完成时间"的比值)指标来评价服务质量.算法综合用户权值,任务所属类别历史平均计算时间,用户期望计算时间,任务添加时间等四个因子,计算任务权值,然后由服务器主动按照任务权值高低进行调度.试验结果表明,该算法能够有效提高用户的满意率,充分利用服务器的计算资源. 吴军 刘翟 马俊才关键词:服务器集群 负载均衡 服务质量 调度 中国生物多样性大数据平台建设 被引量:40 2018年 生物多样性大数据资源是国家重要战略资源,也关乎国家生态安全和生态文明建设。中国生物多样性大数据平台将包括基于宏观与微观生物生态数据协同整合的大数据库和大数据深度挖掘与模型模拟运算库,支持生物多样性和生态系统多源数据整合和共享的标准以及数据集成应用的方法,实现古生物化石数据与遗传组学数据、生理与性状数据、物种多样性、生态系统多样性等跨学科数据融合,与地理、气象、遥感、环境、国民经济等跨领域数据整合,形成完整的共享数据集或栅格化图集。利用分析模型和可视化技术实现对多源生物多样性数据集的挖掘和利用,构建开放开源的生物多样性大数据处理利用的通用接口,建立一个以生物多样性和生态安全为核心的包括对海量数据进行有效管理、高效分析和可用易用的综合大数据系统,面向政府部门提供标准化、可视化服务,促进我国生物多样性资源保护和生态安全格局构建,保障国家生态安全,支撑我国生物多样性交叉学科前沿领域科学发现和产业创新发展。 马克平 朱敏 纪力强 马俊才 郭庆华 欧阳志云 朱丽关键词:生态安全 数据共享 决策支持 国际微生物大数据平台的应用与启示 被引量:5 2018年 微生物资源与微生物大数据是国家重要战略资源,是人类赖以生存和发展的重要物质基础和生物技术创新的重要源泉,微生物资源及数据的开放共享对微生物资源的开发利用具有重要意义。世界微生物数据中心建设的全球微生物菌种资源目录大数据平台,拥有46个国家的120个国际微生物资源中心的40万株微生物实物资源数据信息。该中心以统一数据门户的形式对全世界科技界和产业界提供微生物菌种资源的信息服务,全面参与国际微生物数据标准制定,并为《名古屋议定书》(The Nagoya Protocol)及履约工作在微生物领域的实施提供重要支撑。在此基础上,2017年世界微生物数据中心启动了全球微生物模式菌株基因组和微生物组测序合作计划,从而实现了从微生物资源数据到微生物实体资源共享利用的转变,希望通过微生物大数据平台促进生物大数据产业的发展,进一步推动中国微生物组计划的实施,主导国际微生物组计划,提升我国在微生物领域的话语权。 刘柳 马俊才关键词:微生物资源 战略资源 农民采用新技术行为研究——对江苏农民采用水稻抛秧技术的实证分析 该文试图在分析研究信息交流、技术扩散、技术采用的基础上,揭示信息双向交流的特点,把握农民采用新技术的决策过程,探讨影响农民采用新技术的障碍因子. 马俊才关键词:农户行为 水稻抛秧 物种科学名称确定方法、装置、电子设备及存储介质 本公开提供了物种科学名称确定方法、装置、电子设备及存储介质。该方法的一具体实施方式包括:获取目标物种的待确定名称以及对应的菌株编号集合,基于待确定名称,在物种分类数据库中查找与待确定名称匹配的第一物种信息,响应于未查找到... 范国梅 孙清岚 史文聿 吴林寰 马俊才生物数据分析平台中的大文件多线程传输方案 被引量:1 2021年 随着云计算技术的飞速发展,越来越多的数据相关服务需要通过云平台来实现.国家科学微生物数据中心目前已建立了以云计算为基础的生物信息分析的数据平台,为了解决平台用户进行文件上传时可能面临的效率、安全、稳定等一系列问题,本文在分片上传、断点续传等技术的基础上,提出一种根据带宽时延积选择并发线程数的传输方案,解决了受意外中断时文件需要全部重新上传的问题,提升了多线程上传时的带宽资源利用效率,提高了大文件的传输效率. 史若曦 马俊才 田园静 张荐辕关键词:大文件传输 多线程 带宽时延积 北京地区肉类中沙门氏菌全基因组分型及耐药分析 被引量:8 2020年 目的对我国北京地区肉类产品中沙门氏菌进行分离鉴定,基于全基因组测序结果,分析其耐药基因分布情况及亲缘关系。方法以38株沙门氏菌为研究对象,对不同来源的沙门氏菌进行全基因组分析,然后通过测定菌株对15种抗生素的最小抑菌浓度,结合全基因组测序结果分析不同来源的沙门氏菌的耐药特性及多重耐药状况。结果对38株沙门氏菌进行15种抗生素耐药性检测,其中34.2%为多重耐药株,68.4%的沙门氏菌对喹诺酮萘啶酸耐药,42.1%分离株对氨苄西林耐药。基于全基因组测序结果,对38株沙门氏菌进行分型为12种型别,其中88.2%的肠炎沙门氏菌与标准菌株ATCC9184亲缘关系较近。结论全基因组耐药基因和毒力基因与耐药表型有一定的关联,为监控北京地区的沙门氏菌耐药基因和毒力基因的传播方式提供理论基础。 畅晓晖 张捷 亓合媛 石嵩 杨向莹 杨磊 赵琢 李小林 史文聿 孙清岚 马俊才 陈广全关键词:沙门氏菌 全基因组测序 耐药基因 耐药表型 我国生物种质资源保护和共享利用的现状与发展思考 被引量:9 2018年 生物种质资源的保护和共享利用是提升生物种质资源对科技创新支撑作用的核心内容。文章首先基于生物种质资源多样性阐述生物种质资源在科研基础研究中的重要作用,然后通过对国内外生物种质资源的保存及共享利用情况进行对比分析,最后在科技创新对生物种质资源建设发展需求分析的基础上,提出加强我国生物种质资源保护和共享利用的思考与建议。 程苹 卢凡 张鹏 马俊才 王瑞丹关键词:生物种质资源