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顾万君: 作品数：15 被引量：92H指数：5; 供职机构：东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>; 相关领域：生物学医药卫生电子电信水利工程更多>>

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不同折叠类型蛋白编码基因的密码子使用被引量：10: 2002年; 对 1 95个编码不同折叠类型蛋白 (5 0种全α结构蛋白 ,6 6种全 β结构蛋白 ,3 7种α +β结构蛋白 ,42种α/β结构蛋白 )基因的密码子使用偏性的方差分析研究表明 ,不同折叠类型蛋白的密码子使用偏性有着显著的区别 .特定折叠类型的蛋白有着特定的编码基因的密码子使用模式 .这一结果表明 ,在蛋白质折叠类型和蛋白质二级结构的预测过程中 ,编码基因的密码子使用偏性可以作为蛋白质一级结构以外的一项重要的预测标准 .; 顾万君马建民周童孙啸陆祖宏; 关键词：编码基因密码子折叠类型方差分析

基因密码子使用和蛋白质结构的生物信息学分析: 随着人类基因组计划和模式生物基因组计划的完成,公共数据库中生物数据的增长速度越来越快.如何从海量的生物数据中解读、提取和获得有用的生物信息,已成为基因组计划下一步亟待解决的问题.本文中,我们利用生物信息学的方法对基因的同...; 顾万君; 关键词：生物信息学同义密码子使用蛋白质二级结构预测单倍体; 文献传递

Selection on Nucleotide Sequences and Synonymous Codons for mRNA Secondary Structure Characteristics near Translation Termination Sites: Background: Both experimental and computational studies recently suggest that secondary structure of mRNA sequ...; 许育铭顾万君; 关键词：SECONDARY TRANSLATION TERMINATION CODON SELECTION

Site discrepancy of synonymous codon usage in SARS coronavirus and other viruses in Coronaviridae: 2005年; The synonymous codon usage in the translational initiation and termination regions of genes of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus and five other viruses in Coronaviridae was systematically analyzed.The results indicate that most minor codons for these coronaviruses are preferentially used in the initial and terminal region.The minor codons preferentially used in the initial region are thought to have a negative effect on gene expression,which can be explained by the minor codon modulator hypothesis.It also indicates that the minor codons preferentially used in the terminal region may regulate the level of gene expression.The proposed results strongly imply that the minor codon modulator hypothesis can be applied to both some bacteria and some viruses.; 周童顾万君马建民孙啸陆祖宏; 关键词：CORONAVIRUS

乳腺癌影像基因组学研究进展被引量：8: 2018年; 近年来,我国乳腺癌发病率不断升高,并呈年轻化趋势[1],对乳腺癌的早期预防、精确诊疗和预后分析能力迫切需要提高。分子生物学与免疫学的快速发展为乳腺癌早期诊断、分型、预防警示及预后判断奠定了基础。最初,乳腺癌按照基因表达谱差异分为4类分子亚型,但这种分型方式受到基因分析的成本、设备和技术要求等的限制,很难对每一位患者进行分类[2]。因此,临床上通常借助免疫组化法替代基因分析,但免疫组化法预测乳腺癌预后的鲁棒性较差,且其分类结果与基因分析结果的一致性也较差[3]。因此,需要一种新的分类方法,以实现乳腺癌的精准分类[4]。; 明文龙袁少勋谢建明刘宏德顾万君孙啸; 关键词：乳腺肿瘤磁共振成像乳房X线摄影术基因组学

A empirical-mechanical codon model for detecting selection at RNA structure: Background: A basic problem of molecular evolution is to describe the natural selection on DNA sequence.So-cal...; 李沐升顾万君; 关键词：NATURAL SELECTION CODON RNA SECONDARY

影像组学辅助磨玻璃结节诊断的研究进展被引量：6: 2019年; 磨玻璃结节的良恶性判定对肺癌的早期发现、早期诊断、早期治疗具有重要意义。影像组学可以通过无创技术,利用结节的特征性表现实现对磨玻璃结节良恶性的早期诊断。本文就CT影像组学在辅助磨玻璃结节的诊断方面的最新研究进展进行综述。; 李洪韩路李响虞梁袁梅顾万君陈亮王俊; 关键词：CT

基于序列特征的环状RNA识别被引量：1: 2018年; 环状RNA是新发现的一类具有重要生物学功能的RNA。现有的环状RNA识别工具依赖高通量测序数据,因数据本身和识别方式的弊端而普遍存在准确性不足、不同方法间重复性低以及假阳性率/假阴性率高等缺点。为了解决该问题,我们搭建模型来实现不依赖于测序数据而根据序列的内在特征的环状RNA从头预测。本文选取了包括剪接位点上下游内含子的长度、A-to-I密度和Alu重复序列等100个与RNA成环相关的序列特征,建立了机器学习模型,并识别了人类基因组中的环状RNA,比较了两种机器学习方法随机森林法(RF)和支持向量机(SVM)的分类效果。结果表明,所选序列特征能有效地鉴别RNA能否成环,同时,不同序列特征对模型的分类预测能力的贡献也不同。相比于SVM方法,RF分类的效果更好。; 周晶谢雪英顾万君; 关键词：支持向量机

DNA存储中的编码技术被引量：4: 2020年; 脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic Acid,DNA)是一种天然的信息存储介质,具有存储密度高、存储时间长、损耗率低等特点。在传统存储方式不能满足信息增长的需求时,DNA数据存储技术逐渐成为研究热点。DNA编码是用尽可能少的碱基序列无错的存储数据信息,包括压缩(尽可能少的占用空间)、纠错(无错存储)和转换(数字信息转为碱基序列)3部分。DNA编码是DNA存储中的关键技术,它的结果直接影响存储性能的优劣和数据读写的完整。本文首先介绍DNA存储的发展历史,然后介绍DNA存储的框架,其中重点介绍DNA编码技术,最后对DNA存储中的编解码技术的未来发展方向进行讨论。; 毕昆顾万君陆祖宏; 关键词：纠错算法

一种基于密码子使用偏性的检测型基因芯片设计方法被引量：4: 2002年; 首先预测特定蛋白密码子使用概率表 ,以确定序列中各氨基酸的编码密码子 ,这样可以将芯片表面探针的数量减少为原来的 4.47% .然后进一步考虑密码子在编码时的C G选择性分离原则、G T配对原则 ,以进一步将芯片表面探针的数量减少至 4.2 5 % .在对探针特异性要求不高的情况下 ,可以采用最优密码子使用概率表 ,以求最大限度的降低探针的数目 ,这样芯片表面探针的数量可减少到原来的 0 .2 0 % .通过上述方法。; 马建民顾万君周童孙啸陆祖宏; 关键词：设计方法特定蛋白密码子使用偏性遗传密码