闫艳艳
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
- 供职机构:江南大学理学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学理学更多>>
- 基于H~距离对P53肿瘤抑癌基因的研究与应用(英文)
- 2016年
- 为了更深入的研究P53肿瘤抑癌基因,首先我们基于扩展的碱基表C={D,A,C,O,G,T,P}分别获得了加法运算和乘法运算,然后根据密码子集C^3={XYZ},定义了汉明距离d_H,继而通过加权和改进的汉明距离提出了H~*距离.进一步地,我们定义了密码子的外积和H~*内积.此外,也获得了DNA序列间的H~*距离d_(H~*)和H~*内积,当氮基酸的第一位或第三位碱基突变时,值都大于0;而当氮基酸第二位碱基突变时,-2≤≤4,但其中65.22%都小于或等于0,且氨基酸的理化性质都发生了变化.同时,我们也可认为当
- 谈承杰闫艳艳朱平
- 关键词:汉明距离
- 癌基因密码子间的距离和Y-内积表示及其应用
- 2011年
- 为了深入研究正常基因变为癌基因时,氨基酸亲疏水性的变化趋势,在已经建立的代数结构的基础上给出了全新的距离及Y-内积的定义,通过计算得出GF(7)上36个本原多项式及其根,并得出了对应的生物意义的表示,利用所建立的理论数学模型分析了在胃癌,食道癌,肺癌以及B细胞淋巴癌中的p53错义突变过程中氨基酸亲疏水性的变化.结果表明:当正常的基因变为癌基因且密码子的第2位碱基发生变化时,密码子间的距离不小于1;特别是当第2位碱基由A变为G,C时,其Y-内积的值为负值;由T变为G,C,A时,Y-内积的值则大于4.
- 朱平闫艳艳孔娟娟
- 关键词:密码子癌基因氨基酸