郭晓琳
- 作品数:11 被引量:37H指数:5
- 供职机构:北京大学人民医院更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学更多>>
- 2009年甲型流感过后散发成人流感样病例病原学特征被引量:5
- 2013年
- 目的 分析2010年6月-2012年2月的流感样病例(ILI)病原学资料,探讨成人散发ILI病原谱特征.方法 采集502例ILI患者的咽拭子标本.279例用多重PCR检测12种呼吸道病毒;413例用细胞培养法分离鉴定流感病毒,进行统计分析.结果 多重PCR法中26.9% (75/279)病例检出呼吸道病毒,甲型流感病毒(FLU-A)是2010-2011年流行优势株,占病毒阳性病例85.3%,占ILI的22.9%(64/279).其他呼吸道病毒阳性率低于3%.413例细胞培养分离的ILI中,新甲型H1N1(pH1N1)阳性率2.7%(11/413),H3阳性率2.4%(10/413),乙型流感病毒(FLU-B)阳性率6.5% (27/413).2010-2011年优势株为FLU-A,2011-2012年优势株为FLU-B.2009-2012年流感流行高峰分别出现在2009年11月、2011年1月和2012年1~2月,2010和2011年的ILI%整体低于2009年同期水平.结论 pH1N1对流感季节性无影响.甲流过后散发ILI的病原以流感病毒为主.高峰在次年1~2月份.
- 杨晓花陈美芳高燕郗盟杨霞郭晓琳孙春玲朱建莹谢艳迪刘雅芬魏来
- 关键词:流感病毒A型流感病毒B型病原学
- 2012-2013北京甲型流感病毒流行特征及抗原性研究
- 目的:2009年5月,新型甲型H1N1流感病毒侵入中国;2013年3月,禽流感H7N9感染人类并导致死亡,因此进一步加强对流感病毒的流行病学及分子水平的检测尤为重要。
方法:在本研究中,分别用快速抗原检测、病毒...
- 房琼璇高燕陈美芳郭晓琳杨霞杨晓花魏来
- 关键词:甲型流感病毒流行病学抗原性分析位点突变
- 文献传递
- Molecular Characteristics of hemagglutinin and Neuraminidase of influenza A in Beijing during winter 2012-2014
- <正>Objective To analyze nucleotide and amino acid characteristics of 54 influenza A viruses during2012-2014 Fl...
- 房琼璇高燕陈美芳郭晓琳杨霞丛旭潘孝本韩进超魏来
- 文献传递
- 长学制医学生对传染病专业认知程度调查分析被引量:2
- 2009年
- 目的:了解八年制临床医学专业学生对传染病专业的认识程度、就业意愿等现状,为传染病教学改革提供参考依据。方法:采用自行设计的匿名调查表,对2005级八年制临床医学专业学生55人进行问卷调查。结论:长学制学生对传染病专业认识不足,就业意愿较低。为此,应该从多方面加强学生对传染病专业的认识和兴趣。
- 高燕魏来马慧陈美芳郭晓琳周庆环
- 关键词:传染病就业意愿
- 军团菌分子生物学研究进展被引量:1
- 1996年
- 本文综述了应用分子克隆方法对嗜肺军团菌蛋白酶、外毒素、溶血素、MIP基因、人工诱变技术的研究,以及核酸检测军团菌方面的新进展。
- 郭晓琳万毅新
- 关键词:嗜肺军团菌基因探针聚合酶链反应
- 2012年至2014年北京54株甲型流行性感冒病毒血凝素和神经氨酸酶变异分析被引量:6
- 2014年
- 目的 分析两个流行性感冒(流感)流行季甲型H1N1流感病毒pdm09和H3N2流感病毒的核苷酸和氨基酸变异特点.方法 在2012年12月至2013年2月和2013年12月至2014年2月两个流感流行季,对反转录PCR证实的54株流感病毒株进行分型和血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)扩增并测序,从GenBank获得2009年以来全球范围包括北京地区的甲型H1N1流感病毒pdm09和H3N2流感病毒序列,用Bioedit7.09和Mega5.05软件进行比对并构建系统进化树.结果 共分离到甲型H1N1流感病毒pdm09 35株,H3N2流感病毒19株.甲型H1N1流感病毒pdm09株的HA和NA基因在进化树上的聚集情况基本一致,2012年至2013年的H3N2流行株位于3C亚群.北京地区2009年至2014年甲型H1N1流感病毒pdm09表面抗原HA和NA氨基酸差异分别为0.3%~15.2%和0.5%~3.3%;2012年至2013年的HA抗原表位发生L178I、S202T和H155Q/R位点突变,分别位于抗原表位Sa、Sb和Ca; 2013年至2014年又新增K180Q和G187E位点突变.2009年至2014年H3N2流感病毒表面抗原HA氨基酸差异为0~7.8%,与疫苗株A/Texas/50/2012相比,北京地区2012年至2014年H3N2流感病毒表面抗原HA氨基酸差异为0~0.7%.2012年至2013年H3N2流感病毒HA抗原表位突变位点为R158K/G、N161S和P214S,位于抗原表位A和B;2013年至2014年新增I208V和I64V突变位点.未发现奥司他韦耐药毒株.结论 2012年至2014年北京地区甲型流感病毒发生新的位点突变,历年流行的病毒株表面抗原(尤其是HA)差异范围较大.
- 房琼璇高燕陈美芳郭晓琳杨霞丛旭潘孝本韩进超魏来
- 关键词:流感病毒A型抗原变异进化
- 腹泻标本中肺炎克雷伯菌的分离鉴定和16S rDNA系统进化分析被引量:2
- 2008年
- 目的探讨腹泻标本中肺炎克雷伯菌属亚种的分类和鉴定。方法腹泻标本使用麦康凯和SS培养基划线培养,挑取可疑菌落分纯后使用细菌生化鉴定仪鉴定到亚种;提取菌株的全基因组DNA,以克雷伯菌16S rDNA引物PCR扩增菌株的1500bp16S rDNA序列,扩增产物进行测序,测序结果经截取后,使用Blastn程序在GenBank库中搜索16S rDNA序列的相似性匹配;用PHYLIP程序建立分离菌株及GenBank库中16S rDNA序列的进化发生树并进行分析。结果113份腹泻标本中,经生化鉴定有25株(分离率22.2%)肺炎克雷伯菌株,其中,肺炎亚种21株(分离率18.6%)、鼻炎亚种4株,未分离到鼻硬结亚种。这些标本中未分离到常见腹泻病原菌。生化鉴定的肺炎亚种菌株均对青霉素G耐药,而对多黏菌素敏感,对呋喃坦叮、头孢噻吩、卡那霉素和妥布霉素有部分耐药。菌株的16S rDNA序列在GenBank库中搜索发现,生化鉴定为鼻炎亚种的4株菌株与沙门菌等肠道致病菌株有最大相似性匹配;16S rDNA序列系统进化树将生化鉴定的肺炎亚种聚为一群,但不能将肺炎克雷伯菌属的3个亚种完全区分开来。结论16S rDNA序列进化分析在肺炎克雷伯菌的鉴定和分类中有一定意义。
- 郭晓琳王多春张燕敏王晓梅张怡左颖张冬梅阚飙魏来高燕
- 关键词:腹泻标本肺炎克雷伯菌RDNA
- 克雷伯菌16S rDNA和rpoB基因系统进化及序列特征分析被引量:5
- 2009年
- 目的比较分析克雷伯菌属的种之间16S rDNA和rpoB系统进化发育关系和序列进化特征。方法选取经生化鉴定的克雷伯菌18株,提取菌株染色体作为模板,分别使用16S rDNA和rpoB通用引物扩增并测序16S rDNA和rpoB序列。与GenBank中目前已公布的8种克雷伯属菌株16S rDNA和rpoB序列各8条、除克雷伯菌外其他肠道菌株的16S rDNA和rpoB序列各9条一起,共计各35条16S rDNA和rpoB序列,在MEGA4.0中建立进化树并进行分群分析,使用DNAStar/MegAlign程序比较分析8种克雷伯菌的种间16S rDNA和rpoB序列变异碱基位点,并做分歧度分析。结果在所有受试的16SrDNA和rpoB的各35条序列中,16S rDNA和rpoB进化发育树都将克雷伯菌区分为3个群:分离的18株克雷伯菌中,15株肺炎亚种与GenBank中除产酸克雷伯菌和运动克雷伯菌外的其余6种克雷伯菌聚为一群(Ⅰ),其余3株克雷伯菌(FX246、FX280和FX286),经生化鉴定为产酸克雷伯菌,与GenBank中产酸克雷伯菌(DQ835530)聚为一群(Ⅱ);而GenBank中的运动克雷伯菌单独聚为一群(Ⅲ);进一步的分析,在rpoB进化发育树中,无论是Ⅰ群和Ⅱ群,还是Ⅰ群内的两个亚群,rpoB进化发育树的结点处自引导值都明显高于16S rDNA进化发育树;而且rpoB对产酸克雷伯菌的分群优于16S rDNA。对克雷伯菌的序列分析发现,16S rDNA序列存在41个碱基变异位点,有4个易变区,rpoB序列存在63个碱基变异位点,有1个易变区;克雷伯菌16S rDNA和rpoB的相似性分别为95.9%~100%和90.2%~100%。进一步的克雷伯菌种间序列分歧值分析,rpoB分歧值(0~10.6)高于16S rDNA(0~4.0)。结论克雷伯菌rpoB比16S rDNA具有更高的分歧度,在克雷伯菌属内种的分子分类和鉴定中,rpoB比16S rDNA基因更具优越性。
- 郭晓琳王多春阚飙张燕敏张怡左颖魏来高燕
- 关键词:克雷伯菌RDNARPOB
- 成人散发性病毒性胃肠炎的病原学分析被引量:7
- 2008年
- 目的了解北京地区成人散发性病毒性胃肠炎中诺如病毒、轮状病毒及肠道腺病毒感染情况和流行病学特点,为临床防治提供理论依据。方法收集北京大学人民医院2005年至2006年成人肠道门诊散发非霍乱水样便腹泻患者粪便标本312份,用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)进行轮状病毒核酸的检测;分别用德国R—Biopharm公司的酶免疫试剂盒进行诺如病毒和肠道腺病毒抗原的检测。结果312份粪便标本中,轮状病毒核酸检测全部阴性;125份粪便标本中诺如病毒阳性22份,阳性检出率17.6%(22/125),其中10月份检出率最高,为32.4%(11/34);92份粪便标本中肠道腺病毒阳性3例,检出率3.3%(3/92),其中1例诺如病毒和腺病毒混合感染。结论北京地区成人散发性病毒性胃肠炎病原以诺如病毒多见,秋季多发;轮状病毒感染率可能很低。
- 陈美芳高燕丛旭孙春玲朱建莹郗萌郭晓琳杨霞李颖魏来
- 关键词:胃肠炎病原轮状病毒感染
- 前脂蛋白乙二酰转移酶基因(lgt)与霍乱弧菌噬菌体VP3的受体相关
- 2004年
- 目的 研究霍乱弧菌噬菌体VP3的受体相关基因 ,确定前脂蛋白乙二酰转移酶基因在霍乱菌株可被VP3感染中的作用。方法 采用转座子 (TnphoA)插入 ,筛选对VP3感染产生抗性的突变株。Southernblot鉴定突变株染色体中TnphoA的拷贝数 ,利用反向PCR扩增TnphoA插入位点旁侧研究菌株的染色体序列。对扩增产物测序确定插入位点基因。另外 ,克隆被破坏基因的完整序列 ,转入该突变株 ,以反式互补实验确定回补突变株对VP3的敏感性。结果 获得 1株VP3的抗性转座突变株 ,Southernblot确定TnphoA在其中为单拷贝插入 ,反向PCR(IPCR)扩增得到插入位点处的结构基因为霍乱弧菌lgt基因 ,其表达产物为前脂蛋白乙二酰转移酶 (Lgt)。反式互补表明突变株恢复了对VP3的敏感性。结论 前脂蛋白乙二酰转移酶在赋予霍乱菌株噬菌体VP3的敏感性方面有重要作用 ,可能为VP3转染的受体合成中的必需酶类。
- 王多春郭晓琳刁保卫梁未丽邱海燕高守一阚飙
- 关键词:受体霍乱弧菌染色体