邓圣荣
- 作品数:6 被引量:4H指数:1
- 供职机构:云南大学化学科学与工程学院教育部自然资源药物化学重点实验室更多>>
- 发文基金:中国科学院“百人计划”国家自然科学基金云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目更多>>
- 相关领域:医药卫生理学化学工程生物学更多>>
- 1A26蛋白中紫杉醇等药物分子活性位点的研究
- 第一章是前言,介绍与本论文工作相关的基础知识。在量子力学基础上发展起来的量子化学理论及其相关的计算方法,产生用于量子化学计算的Gaussian程序,把化学推向了一个新的高度,使化学从实验研究阶段迈向理论研究阶段,为化学研...
- 邓圣荣
- 关键词:量子化学质子转移结合位点分子对接紫杉醇药物分子
- HIV-1逆转录酶非核苷类抑制剂MKC分子结合位点的理论研究被引量:1
- 2009年
- 1RT1蛋白是一个HIV-1逆转录酶核心蛋白,是抑制剂药物分子的作用靶点.非核苷类抑制剂MKC分子是1RT1蛋白中的配体分子.采用量子力学密度泛函理论,B3LYP计算方法,结合6-31G(d,p)基组,逐个计算MKC分子与其周围半径0.7 nm结构范围内的34个氨基酸残基相互作用和结合能,发现在1RT1蛋白中103Lys残基是MKC分子的结合作用位点,结合能值为-46.73 kJ.mol-1.该结合位点的发现将为进一步设计和寻找抗HIV-1逆转录酶抑制剂药物分子提供一些理论基础.
- 王宁邓圣荣金毅徐四川何耀莹
- 关键词:HIV-1结合位点DFT
- 牛视紫红质蛋白质中视黄醛的活性位点被引量:3
- 2009年
- 视紫红质蛋白是一个跨膜蛋白,视黄醛(RET)在该蛋白中的活性结合位点涉及到视觉过程机理,与一些眼科疾病病理有关.基于牛视紫红质蛋白1U19的蛋白质晶体结构数据,采用密度泛函理论的B3LYP方法计算RET-Lys296残基与视黄醛分子周围半径为0.6nm的空间范围30个氨基酸残基相互作用和结合能.数值显示1U19蛋白中的残基Glu113、Glu181和Glu122是质子化的RET-Lys296残基的活性结合位点,结合能分别为-333.38、-205.67和-194.56kJ·mol-1.这些氨基酸残基带有一个负电荷,与质子化的RET-Lys296残基发生强烈的离子静电相互作用.另外几个残基Ala292、Cys187、Phe293、Pro291以及Trp265等与质子化RET-Lys296残基也有相互吸引作用.当RET-Lys296残基非质子化,上述相互作用消失,促使视黄醛分子与视蛋白分离.研究发现残基Glu113和Glu181周围各自有一个结晶水分子通过双氢键形式起着稳定作用.
- 徐四川邓圣荣马丽英史强葛茂发张兴康
- 关键词:视紫红质活性位点密度泛函理论
- ADP核糖基转移酶蛋白活性位点的研究
- <正>ADP 核糖基转移酶影响肿瘤发生和生命老化。体外和体内研究表明抑制 ADP 核糖基转移酶则可降低 DNA 修复功能,增强放疗和化疗对肿瘤的治疗效果。ADP 核糖基转移酶是一个潜在的治疗癌症靶点。所以,研究 ADP ...
- 徐四川王宁邹成亮王琳马丽英邓圣荣经山
- 文献传递
- CIONO2+Cl^-→NO3^-+Cl2反应的溶剂化
- 2008年
- 气相反应CIONO2+Cl^-→NO3^-+Cl2 ,存在一个深达-55.3kJ/mol的势能阱,低温时阻止该反应产生产物NO3^-和Cl2。本文采用B3LYP/6—311++G(d,P)理论方法,研究该化学反应中水分子溶剂化作用,探讨溶剂化过程反应机理。研究结果显示,水分子溶剂化作用使该反应势能阱消失,反应快速产生产物NO3-和Cl2。
- 迟绍明王宁方芳邓圣荣马丽英徐四川
- 关键词:密度泛函理论溶剂化
- H2NCH2C(OH)NH→H2NCH2CONH2质子转移反应从头计算研究
- <正>2-氨基乙酰亚胺酸(H2NCH2C(OH)NH)分子是氨基乙腈(H2NCH2CN)Strecker水解反应生成甘氨酸的中间体分子,它的质子转移反应涉及到氨基酸起源的研究。采用量子力学从头计算,MP2计算方法和CCS...
- 邓圣荣马丽英王宁单香丽张令霞徐四川
- 关键词:质子转移MP2PCM
- 文献传递