董晓根
- 作品数：65 被引量：309H指数：9
- 供职机构：北京市丰台区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项北京市科技计划项目北京市重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：医药卫生理学农业科学轻工技术与工程更多>>
- 2016年北京市丰台区两起柯萨奇病毒A组10型引起的幼儿园疱疹性咽峡炎暴发疫情调查被引量：16
- 2017年
- 2016年4月,北京市丰台区2所托幼机构相继发生疱疹性咽峡炎暴发疫情,涉及病例55例,平均罹患率为16.08%。发病高峰均呈双峰分布,病例为5~6岁儿童,实验室检测结果为柯萨奇病毒A组10型。对26例肠道病毒阳性病例发病10 d后再次采集咽拭子样本,7.69%的病例仍为阳性。病例诊断不明确、园内管理措施不严格可能导致疾病蔓延传播。
- 武晶杨军勇董晓根杨霄星余红李若曦封会茹吕春丹杜斌武庆锐陈黎黎孟艳张建军
- 关键词：疱疹性咽峡炎病原
- 2014年北京市丰台区麻疹病毒野毒株基因特征被引量：2
- 2016年
- 目的了解2014年北京市丰台区流行的麻疹野毒株的优势基因型别及特征,为进一步的麻疹防治策略提供科学依据。方法采集2014年北京市丰台辖区内疑似麻疹暴发和散发患者咽拭子标本,使用Vero/SLAM细胞分离麻疹病毒。通过逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）从分离到的麻疹病毒中扩增出核蛋白（nucleoprotein,N）基因C末端676个核苷酸片段,再对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并以C末端450个核苷酸片段构建基因亲缘关系树,进行核苷酸、氨基酸同源性分析。结果共分离到38株麻疹病毒,均为H1a基因型。38株麻疹病毒野毒株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%~100%、96.6%~100%;同源性最高的为H1a参考株Chin9322,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~99.1%、96.6%~99.3%;与2013年Beijing株（KJ556889/KJ556890/KJ556891）核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%~99.7%、97.3%~100%。结论 2014年北京市丰台区内流行的麻疹病毒野毒株优势基因型别为H1a型。
- 余红秦萌尉秀霞邢洪光董晓根李洁
- 关键词：麻疹病毒N基因基因型
- 沙门菌玻片凝集血清分型与多重荧光PCR血清分型检测试剂盒方法比较被引量：5
- 2020年
- 目的探讨在肠道多病原监测中,沙门菌多重荧光PCR血清分型检测试剂盒的适用性,扩展沙门菌的分子分型和鉴定方法,提高分型效率,以更快更好地应对由沙门菌引起的腹泻事件。方法利用沙门菌多重荧光PCR血清分型检测试剂盒和传统玻片凝集血清分型方法,对2013—2018年北京市丰台区肠道多病原监测中分离获得的95株沙门菌进行分型分析,比较2种结果的符合程度。结果采用传统玻片凝集法,95株沙门菌被分为21种血清型。采用多重荧光PCR血清分型检测试剂盒,85株沙门菌被分为17种型别,10株菌无法分型,包含Salmonella Goldcoast、S.London、S.Senftenberg、S.Thompson、S.Panama、S.Othmarsche 6种血清型。在试剂盒成功分型的85株菌中,83株菌的分型结果与玻片凝集法一致,符合率为97.65%。结论在沙门菌分型中,玻片凝集法应用良好,多重荧光PCR血清分型检测试剂盒与前者分型结果一致性高,检测效率显著提升,对不常见血清型的鉴定有待扩充,2种方法联合使用可全面提高实验室对沙门菌的分型检测效率和准确率。
- 董晓根颜涛石婧秦萌封会茹余红王兆娥张志敏信振江
- 关键词：沙门菌血清分型
- 2013年北京市丰台区腹泻病人和水产品中副溶血性弧菌带菌状况调查被引量：3
- 2017年
- 目的了解北京市丰台区散发的腹泻患者和市售水产品中副溶血性弧菌感染状况及二者间的关联性。方法2013年4-10月采用随机抽样的方法采集辖区的市售水产品和肠道门诊就诊的散发腹泻病例的粪便标本,进行副溶血性弧菌的检测,然后通过脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)的方法,对水产品和便标本中检出的副溶血性弧菌进行比对,寻找丰台区副溶血性弧菌导致的腹泻高发的原因。结果丰台区散发腹泻病例中副溶血性弧菌的感染率为13.03%,不同月份检出率(P<0.01)和不同年龄病人中的检出率(P=0.02)差异有统计学意义;丰台区市售水产品中副溶血性弧菌的检出率为32.06%,不同季节检出率(P<0.01)和不同市场所售水产品检出率(P=0.02)差异有统计学意义;但散发腹泻病例的副溶血性弧菌和市售水产品中的副溶血性弧菌的PFGE检测结果没有相关性。结论本次研究尚不能充分证明丰台区副溶血性弧菌导致的腹泻高发和市售水产品副溶血性弧菌感染之间有直接的联系,需要进一步扩大研究范围,以便探讨副溶血性弧菌导致的腹泻高发的原因。
- 武庆锐杨军勇董晓根杨霄星孔玲郭永超武晶陈黎黎孟艳李若曦耿荣
- 关键词：水产品腹泻病例副溶血性弧菌PFGE
- 北京市丰台区诺如病毒暴发疫情的实验室鉴定及基因特征分析被引量：9
- 2015年
- 目的对北京市丰台区2014年5 6月发生的3起诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情进行病原体鉴定及基因分型。方法采用实时荧光定量-聚合酶链反应法对62份病例标本进行诺如病毒核酸检测,阳性标本经反转录-聚合酶链反应扩增RNA多聚酶区部分序列,使用Bio Edit及Mega 6.0软件对扩增序列进行同源性及进化分析。结果 36份标本中检出GⅡ型诺如病毒,阳性率为58.06%;序列分析表明幼儿园为GⅡ.7型,学校1为GⅡ.8型,学校2为GⅡ.6型。结论诺如病毒是引起丰台区急性胃肠炎暴发疫情的主要病原体,丰台区流行的诺如病毒基因型存在多样性。
- 秦萌陆翌禹封会茹杨军勇武庆瑞余红王兆娥董晓根李洁
- 关键词：诺如病毒荧光定量-聚合酶链反应进化分析基因分型
- 北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌emm基因分型及耐药基因分析被引量：6
- 2015年
- 目的了解北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌(GAS)的基因分型及对红霉素耐药基因谱的特点。方法用猩红热、扁桃体炎或咽峡炎患者的咽拭子进行细菌分离培养,应用PCR方法检测emm基因及耐药基因erm A、erm B、mef A、转座子基因Tn 916。结果北京市丰台区2011-2014年感染GAS的emm 12.0基因型占78.33%,其次为emm 1.0基因型(20.00%)、emm 22.3基因型最少(1.67%);耐药基因erm B及转座子基因Tn916的携带率均为100.00%,所有菌株都不携带耐药基因erm A和mef A。结论北京市丰台区2011-2014年感染GAS的流行株为emm 12.0型;本地区菌株对红霉素耐药率较高,菌株间耐药基因扩散现象明显。
- 王兆娥封会茹余红汤旭董晓根
- 关键词：链球菌耐药基因
- 北京市HIV-1 B’／C重组型分子流行特征分析被引量：2
- 2013年
- 目的分析北京市HIV-1B’／C重组型毒株的分子流行特征。方法采集北京市2006-2010年新发现B’／C重组型HIV-1感染者的抗凝全血标本，分离血浆和提取病毒RNA，用反转录／巢式聚合酶链式反应扩增病毒gag基因，并进行系统进化分析。结果成功扩增了159例标本，CRF07-BC147例，CRF08-BC12例，CRF07-BC系统进化树中存在3个主要的亚簇，IDU-Max亚簇包含89例样本，静脉吸毒传播占71．9％，同参考株97CN001组间离散率为2．8％；IDU-Min亚簇包含22例样本，静脉吸毒传播占77．3％，组间离散率为2．8％；MSM亚簇包含34例样本，男男同性传播占67．6％，组间离散率为3．1％；3个亚簇内均无其他国家的序列，只有IDU—Max亚簇包含1条来自中国台湾的序列；核苷酸多态性分析结果显示，以IDU．Max亚簇为参照，IDU．Min和MSM亚簇分别有32和41个位点的核苷酸组成存在著性差异。结论首次观察到北京市流行的CRF07-BC病毒株中存在3个独立的亚簇，异性传播和静脉吸毒传播序列混杂分布，而男同传播病例则聚集成1个亚簇，应当继续对B’／C重组型分子流行特征进行监测。
- 叶景荣董晓根卢红艳郝明强苏雪丽辛若雷余双庆冯霞闫红贺雄曾毅
- 关键词：HIV分子流行病学
- 丰台区居民血脂水平现状分析
- 本文报道了892名丰台区居民的血脂水平,结果发现,丰台区居民血清TC、TG、HDL、LDL均值分别波动在144.77～194.58mg/dL、56.70~115.56mg/dL、45.66~75.96 mg/dL、57....
- 董晓根
- 关键词：血脂水平体质指数文化程度
- 甲苯萃取-微波消解-原子荧光光谱法测定富硒保健品中有机硒和总硒被引量：26
- 2008年
- 目的：建立分离、消解、测定富硒保健品中有机硒和总硒的分析方法。方法：采用甲苯萃取分离样品中的有机硒后,利用HNO3-H2O2消解体系微波消解,原子荧光光谱法测定样品中的有机硒和总硒。结果：在优化工作条件下,硒的检出限为0.088μg/L,相对标准偏差为0.43%-0.53%,线性范围为0-200μg/L,应用该方法检测不同富硒保健品中的总硒含量为0.87-13.04 mg/kg,有机硒含量为0.76-8.54 mg/kg,总硒加标回收率为95.1%-106.2%。结论：该方法简便、灵敏、重现性好、干扰少,适合富硒保健品中的有机硒和总硒测定。
- 李四生董晓根李家涛周勤文李建伟
- 关键词：微波消解原子荧光光谱法有机硒
- 贝氏柯克斯体毒力相关基因芯片对其他胞内寄生菌基因组DNA检测结果分析
- 2012年
- 目的用建立的贝氏柯克斯体毒力相关基因芯片研究贝氏柯克斯体与其致病性相似的专性胞内寄生菌(立克次体、埃立克体、新立克次体),以及与其密切相关的兼性胞内寄生菌(巴通体和肺炎军团菌)等病原菌的毒力基因的差异。方法贝氏柯克斯体国际标准株-九里株作为本研究参考株,从全基因序列中选取166个毒力及毒力相关基因进行PCR扩增,纯化后的产物制备基因芯片。采用双色荧光标记,待测DNA(即用于分析的各菌株基因组DNA)用Cy5标记,贝氏柯克斯体九里株参照基因组DNA用Cy3标记。芯片杂交后,采用软件GenePixPro4.1,辅助以软件Excel,进行图片处理和数据分析。结果芯片的166个基因片段中有165个存在于所有贝氏柯克斯体属的6个分离株中,另一锚定蛋白(AnkI)基因(CBU1213)仅存在于九里株及Grita株;立克次体属的5株菌株均与CBU1631和CBU1125杂交;埃立克体属的3种菌株与新立克次体属的3种菌株均含有基因CBU1125;东方属的1株菌株具有基因CBU1449,而巴通体属的菌株,军团菌和大肠杆菌与基因芯片均无杂交。结论贝氏柯克斯体种内基因组具有高度保守性,它的专性细胞内寄生菌的毒力相关基因与胞外寄生菌的毒力相关基因有非常显著差异。
- 王世斌赵建忠董晓根
- 关键词：贝氏柯克斯体毒力基因基因芯片杂交
