甄建新
- 作品数：36 被引量：47H指数：5
- 供职机构：深圳市宝安区妇幼保健院更多>>
- 发文基金：深圳市科技计划项目国家自然科学基金深圳市宝安区科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 青光眼睫状体炎综合征与杀伤细胞免疫球蛋白样受体-人类白细胞抗原受配体复合物遗传多态性的相关性研究被引量：4
- 2014年
- 目的 研究和分析南方汉族人群青光眼睫状体炎综合征（PSS）与杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIR）及其人类白细胞抗原（HLA）配体基因多态性的相关性.方法 随机选择100例无关健康个体作为对照组,收集97例临床诊断为PSS的患者血样,采用KIR PCR-SSP方法检测KIR框架基因的有无,PCR-SBT法进行HLA-A、B、C基因的测序分型;统计分析健康对照组与患者的KIR框架基因频率、KIR基因单倍体组合型的频率、HLA配体的频率、单个KIR-HLA配体复合物的频率之间的差异.结果 与正常人群相比,PSS患者KIR框架基因频率及单倍体组合型频率差异无统计学意义（P均＞0.05）;HLA配体中的HLA-Bw4-80T在PSS患者及正常人群中的比例分别为22.1％和41.0％,差异有统计学意义（P＜0.01）;KIR-HLA配体组合中的3DL1＋ HLA-Bw4-80T在PSS患者及正常人群中的比例分别为22.1％和40.0％,差异有统计学意义（P＜0.05）,患者组与正常人群组相比都显著降低.结论 PSS与KIR框架基因及单倍型频率无关,但可能与HLA配体或KIR-HLA配体组合相关,这对研究PSS的发病机制及治疗方法具有重要意义.
- 何柳媚甄建新高素青王彦君杨宝成赵军邓志辉
- 关键词：青光眼睫状体炎综合征杀伤细胞免疫球蛋白样受体人类白细胞抗原配体基因多态性
- 南方汉族KIR-HLA系统基因多态性与慢性髓系白血病的相关性被引量：6
- 2017年
- 目的探讨中国南方汉族人群KIR-HLA系统基因多态性与慢性髓系白血病（chronic myeloid leukemia，CML）的相关性。方法对172份成年CML患者及480份随机正常对照的样本，采用PCR-SSP方法检测K豫基因，用测序分型法进行HLA-A、-B、-C基因分型。从K豫基因及其基因组合型、HLAI类配体、已知的单个KIR4-HLA受一配体组合及KIR-HLA基因型组合等4个层次比较病例组与对照组分子遗传多态性的差异。结果与KIR2DL1配位的HLA-C2、KIR2DL1＋HLA-C2、与KIR3DL1配位的HLA—BBw4—80I的检出频率均显著低于正常对照组，为CML保护因素（HLA-C2：OR=0．386，95％CI：0．240-0．620，P〈0．01；KIR2DL1＋HLA-C2：OR=0．316，95％CI：0．191～0．525，P〈0．01；HLA-BBw4—80I：OR=0．576，95％CI：0．384～0．862，P〈0．01）。HLA-C2及HLA—BBw4—801分子表达机率降低，可能导致与相应的抑制性KIR亲和力的减弱，有利于NK细胞活化。最值得注意的是：KIR-HLA基因型组合ID2（KIRAA1-HLA-C1／C1-Bw6／Bw6-A3／11）在CML组的检出频率显著高于正常对照组，为CML易感因素（OR=2．163，95％CI：1．198～3．906，P〈0．01）。结论本研究识别了KIR-HLA与CML白血病相关的易感或保护性因素，可为CML白血病的发病机制和个体化免疫治疗提供新的线索及理论依据。
- 邓志辉甄建新王大明何柳媚邹红岩
- 关键词：杀伤细胞免疫球蛋白样受体人类白细胞抗原遗传多态性慢性髓系白血病
- 艰难梭菌婴幼儿分离株毒力及基因型分布研究被引量：1
- 2016年
- 目的明确深圳地区婴幼儿粪便中分离出的艰难梭菌的毒力及其基因型。方法收集深圳市宝安区妇幼保健院2014-2015年分离出的49株艰难梭菌菌株,PCR检测其毒素A、B的编码基因tcd A、tcd B的携带状况,数字化PCR-核糖体分型方法进行基因分型。结果 49株艰难梭菌tcd A、tcd B携带率分别为44.9%(22/49)和59.2%(29/49),其中22株tcd A、tcd B均为阳性,7株为tcd A阴性、tcd B阳性;49株菌可分为22种核糖体型,最常见的核糖体型为RT017(7/49,14.3%),BA03(5/49,10.2%),BA16(5/49,10.2%)和BA13(4/49,8.2%)。7株RT017菌株均为tcd A-tcd B+,而最常见的tcd A^+tcd B^+菌株(44.9%,22/49)则来自RT017以外的15种核糖体型。结论深圳地区婴幼儿中分离出的艰难梭菌半数以上为产毒株,且产毒株多同时携带tcd A、tcd B基因;基因型则以RT017为主,且均为产毒素B而不产毒素A菌株。
- 王中兴周天祥甄建新夏勇麦光兴肖克林
- 关键词：艰难梭菌基因型婴幼儿
- 双重复合糖基转移酶的ABO基因启动子CpG岛甲基化被引量：2
- 2013年
- 背景:在ABO血型抗原的研究中,绝大多数样本是相同的ABO基因表达出正常的相同的ABH抗原。但有一定数量的样本表现出具有相同分子遗传背景但表达出来的抗原强度却随着家系\个体不同而有所差异,说明了ABO血型中复杂的表达调控机制。分析一类罕见的双重复合型标本的ABO血型血清学与基因背景情况,深入表观遗传学的研究,有利于部分揭示ABO基因表达机制。目的:探讨双重复合型ABO糖基转移酶表达相关的ABO基因启动子CpG岛甲基化水平与ABH抗原表达的关系。方法:6例经血型血清学定为CisAB或B(A)型的标本,进行ABO基因编码区全长序列和启动子序列的测定,采用重亚硫酸盐处理法检测ABO基因启动子CpG岛甲基化程度。结果与结论:6例双重复合AB型的标本中,在B101等位基因基础上存在nt803C>G突变的2个CisAB05/B(A)06等位基因,在ABO启动子CpG岛区域两者在nt-33(30%)、nt+27(50%)、nt+49(50%)具有甲基化差异;在A101等位基因序列的基础上存在nt803C>G突变的2个CisAB01等位基因,在ABO启动子CpG岛区域两者在nt-26(10%)位置有甲基化差异;在B101等位基因基础上存在nt640A>G突变的2个B(A)04等位基因ABO启动子CpG岛,在nt-33(10%)、nt+16(50%)、nt+57(60%)、nt+59(60%)、nt+68(60%)和nt+74(60%)位有甲基化差异。全部的6例标本ABO基因启动子区域DNA序列无任何突变异常。结果提示在相同的ABO遗传基因背景下,ABO基因启动子CpG岛区域某些位点甲基化可能影响ABH抗原在红细胞膜表面的表达。
- 喻琼苏宇清甄建新邓志辉
- 关键词：正反定型不符ABO基因启动子CPG岛基因甲基化
- 人类白细胞抗原Ⅰ、Ⅱ类等位基因及单倍体多态性与中国南方汉族白血病的相关性
- 2021年
- 目的探讨人类白细胞抗原(HLA)Ⅰ类(A、B、C)、Ⅱ类(DRB1、DQB1、DPB1)等位基因和单倍体多态性与中国南方汉族急性淋巴细胞白血病(ALL)、急性髓系白血病(AML)以及慢性粒细胞白血病(CML)的相关性。方法收集深圳市血液中心845例中国南方汉族白血病患者(323例ALL、350例AML及172例CML)和745名中国南方汉族健康献血者的外周血样本。应用聚合酶链反应反向序列特异性寡核苷酸探针杂交(PCR-rSSO)及测序分型(PCR-SBT)方法对HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1和-DPB1进行基因分型,鉴定HLA等位基因前4位数。采用Arlequin 3.5软件分析HLA单倍体;从HLA低分辨水平(等位基因前2位数)及高分辨水平(等位基因前4位数)分别统计分析HLA等位基因和单倍体多态性与3种白血病的相关性。结果经Bonferroni校正,ALL组A*02(36.22%比28.26%,χ^(2)=13.41,PC<0.01)及其单倍体A*02-B*46-C*01(15.35%比10.23%,χ^(2)=10.90,PC=0.02)、DRB1*12(15.79%比11.10%,χ^(2)=9.02,PC=0.03)、A*02:03(9.75%比5.32%,χ^(2)=14.25,PC=0.002)及其单倍体A*02:03-B*38:02-C*07:02(3.80%比1.51%,χ^(2)=10.41,PC=0.02)的频率均高于对照组,是ALL易感因素;AML组A*11-B*15-C*08-DRB1*15-DQB1*06-DPB1*02的频率高于对照组(1.34%比0.07%,χ^(2)=12.54,PC=0.003),是AML易感单倍体;CML组A*02(36.63%比28.26%,χ^(2)=9.33,PC=0.02)及其单倍体A*02-B*15-C*04(2.17%比0.29%,χ^(2)=11.74,PC=0.02)、DRB1*03:01-DQB1*02:01-DPB1*02:01(1.86%比0.14%,χ^(2)=13.10,PC=0.01)的频率均高于对照组,是CML易感因素;CML组DRB1*13的频率低于对照组(1.45%比5.25%,χ^(2)=9.29,PC=0.03),是CML拮抗基因。结论在HLA低分辨及高分辨水平发现了白血病易感或拮抗HLA等位基因和单倍体,可为探究中国南方汉族白血病发病机制并制订有效治疗策略提供参考。
- 甄建新张国彬陈瑞邓志辉
- 关键词：白血病HLA抗原等位基因单倍体
- 南方汉族KIR-HLA系统分子遗传多态性与急性白血病的相关性
- 2022年
- 目的探讨中国南方汉族人群KIR-HLA系统分子遗传多态性与急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)、急性髓系白血病(acute myelocytic leukemia,AML)的相关性。方法对323份成年ALL、350份成年AML患者以及745份随机健康对照的样本,采用PCR-序列特异性引物(sequence specific primer,SSP)方法检测KIR基因,采用测序分型法进行HLA-A、-B、-C基因分型。从KIR基因、KIR基因组合型、HLAⅠ类配体、已知的KIR+HLA受-配体组合等4个方面比较各病例组与对照组分子遗传多态性的差异。结果ALL及AML病例组中分别检出了32种、33种KIR基因组合型,与对照组中检出的35种KIR基因组合型相比,AA1在ALL组和AML组的检出频率均显著低于健康对照组(ALL组:45.79%vs.55.30%,P_(c)=0.004;AML组:48.27%vs.55.30%,P_(c)=0.030),为急性白血病保护性因素;ALL组中2DL2及其受-配体组合2DL2+HLA-C1、2DS2及其受-配体组合2DS2+HLA-C1的检出频率均显著高于健康对照组,而2DL3基因、HLA-A3/A11配体及3DL2+HLA-A3/A11受-配体组合的检出频率均显著低于健康对照组(P<0.05),但经过Bonferroni校正后差异显著性均丢失(P_(c)>0.05);AML组2DS1和2DL5的检出频率均显著高于健康对照组,而HLA-C2配体及2DL1+HLA-C2受-配体组合的检出频率均显著低于健康对照组(P<0.05),但经过Bonferroni校正后差异显著性均丢失(P_(c)>0.05)。结论本文获得了南方汉族KIR-HLA系统中与急性白血病相关的潜在易感或保护性因素,尤其是保护性因素AA1基因组合型,可为急性白血病发病机制和个体化免疫治疗提供新的线索及理论依据。
- 甄建新杨智超邓志辉
- 关键词：杀伤细胞免疫球蛋白样受体人类白细胞抗原遗传多态性急性淋巴细胞白血病急性髓系白血病
- 14个功能性杀伤细胞免疫球蛋白样受体KIRs基因同步测序分型的方法
- 本发明基于KIR基因组全长序列的结构特点、SNPs多态性分布以及外显子两翼的内含子的长度，制定了科学的PCR扩增策略，设计具有相近退火温度的KIR基因特异性PCR引物56对。每个功能性KIR基因的全部编码区序列分别采用3...
- 邓志辉甄建新张国彬
- 文献传递
- 南方汉族急性髓细胞白血病患者杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因的研究
- 2012年
- 目的研究和分析南方汉族急性髓细胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)的基因频率和单倍型。方法采用序列特异性引物PCR(polymerase chain reaction with sequence-specific primers,PCR-SSP)技术对南方地区76例急性髓细胞白血病患者进行KIR基因的检测和分析,并与77例随机健康对照人群KIR基因频率进行比较。结果共检出16个KIR基因;在AML患者中检出15种基因型,正常人群中检出18种基因型。结论与正常人比较,AML患者各KIR基因频率无显著性差异。
- 何柳媚甄建新徐筠娉邓志辉
- 关键词：杀伤细胞免疫球蛋白样受体急性髓细胞白血病单倍型
- KIR3DL1基因分型引物组及其应用
- 本发明提供一种KIR3DL1基因分型引物组及其应用。该KIR3DL1基因分型引物组包括高表达型KIR3DL1*h等位基因特异性引物对；低表达型KIR3DL1*l等位基因特异性引物对和通用型KIR3DL1基因特异性引物对。...
- 甄建新熊礼宽
- 文献传递
- KIR 2DL4基因测序分型中杂合碱基位置峰高不平衡现象及其意义被引量：2
- 2017年
- 目的研究KIR 2DL4基因测序分型中序列及分型结果"异常"的原因。方法 2016年5月对KIR 2DL4基因测序分型时检出的2例杂合碱基位置峰高不平衡、判定为模棱两可结果或无完全匹配分型结果的标本,采集新鲜外周血样,提取mRNA,反转录成c DNA后,进行c DNA分子克隆和单体型测序;同时采用荧光定量法检测基因组DNA中2DL4基因的拷贝数。结果分子克隆和单体型测序表明,1例标本携带正常的KIR 2DL4*00102,*00501及*011等位基因;另一标本中检出了KIR 2DL4*00102,*00501及*00602等位基因。2例标本中均检出了3种不同的KIR 2DL4等位基因,无新等位基因检出。荧光定量PCR实验证实这2例标本KIR 2DL4拷贝数均为3个。结论人类KIR单体型上KIR 2DL4基因的拷贝数存在多样性,当出现杂合碱基位置峰高不平衡、无与之完全匹配分型结果,并非由新等位基因所致。
- 喻琼甄建新张国彬陈瑞陈瑞邓志辉
- 关键词：KIR测序分型
