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扬州市近3年新甲型H1N1流感病毒HA基因分析被引量：6: 2013年; 采用Real time PCR(RT-PCR)对患者鼻咽拭子样品进行检测,筛选新甲型H1N1流感病毒。将阳性样品接种MDCK细胞进行病毒分离,通过RT-PCR扩增病毒HA基因并进行测序分析,分析扬州市2009～2011年新甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因的遗传进化特征。结果表明:分离出9株新甲型H1N1流感病毒,其HA基因核苷酸及氨基酸同源性分别为98.1%～99.8%和96.6%～99.8%;与疫苗株A/California/07/2009相比,核苷酸及氨基酸的同源性分别为98.4%～99.5%和97.0%～99.3%,其中2011年3株病毒在抗原位点上发生了点突变。遗传进化分析显示9株病毒形成3个明显的分支。证明新甲型H1N1流感病毒已发生了一定抗原漂移。; 肖越胜宿春虎黄瑶张军彭大新; 关键词：H1N1 血凝素遗传进化分析

鹅源坦布苏病毒SHYG株E蛋白生物信息学分析被引量：1: 2013年; 为了探索坦布苏病毒E蛋白的抗原结构,以鹅源坦布苏病毒SHYG株E蛋白基因组序列为基础,用DNAStar、Antheprot等软件对E蛋白的二级结构、亲水性、表面可能性、抗原性指数、跨膜结构及等电点等进行预测,用I-TASSER分析E蛋白三级结构。结果表明坦布苏病毒E蛋白等电点为7.15;综合分析显示37~39、80~86、124~126、133~134、233~237、276、315~318、398~399位是可能的B细胞抗原表位,其中80~86、233~237、315~318、398~399位形成抗原表位可能性更高。抗原表位的预测为坦布苏病毒E蛋白的抗原表位的鉴定提供理论依据。; 邹晓艳潘金金宿春虎管萌娄亚坤陈素娟彭大新刘秀梵; 关键词：E蛋白 B细胞表位

多重PCR方法快速鉴别肠炎、鼠伤寒、鸡白痢及鸡伤寒沙门菌被引量：17: 2014年; 根据沙门菌属特异性基因hut及型特异性基因SdfⅠ、Spy、glgC和Spec序列,设计5对引物,建立沙门菌多重PCR方法,并用临床样品分离菌株对该方法进行检验。结果显示,该方法能特异性地鉴定肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌、鸡白痢沙门菌和鸡伤寒沙门菌,4种细菌检测灵敏度均为3×103 CFU,染色体DNA检测灵敏度分别为162、202、214和178pg·μL-1。55份临床分离株检测的结果显示,与传统血清学方法相比,此多重PCR方法敏感性为100%,符合率最低为96.4%。该法能快速而准确地鉴定上述4种血清型的沙门菌。; 杨林娄亚坤宿春虎张华管萌许晨旭陈素娟魏荣陈继明彭大新; 关键词：沙门菌多重PCR 血清型

鹅源坦布苏病毒SHYG株的分离与鉴定被引量：12: 2013年; 【目的】分离鹅源坦布苏病毒,并研究其对雏鹅的致病性。【方法】用RT-PCR方法对江苏省3个鹅场送检的产蛋期病鹅样品进行检测;对坦布苏病毒核酸阳性的样品进行病毒分离,测定分离病毒的生物学特性和E蛋白基因序列。【结果】这些样品中坦布苏病毒呈阳性;从病料中分离鉴定一株病毒,命名为SHYG。E蛋白基因序列同源性比对显示其与中国鸭源坦布苏病毒同源性达到99.3%;生物学特性研究表明该病毒可致Vero细胞病变,对小鼠无致病性,接种2周龄雏鹅出现精神沉郁、腹泻、神经症状甚至死亡;组织学变化可见肝脏淤血、胆小管扩张、脂肪变性;肺淤血、炎性渗出及含铁血黄素沉着,脾脏网状内皮细胞空泡化,肾出血,脑充血、胶质细胞增生。【结论】坦布苏病毒SHYG株对雏鹅有较强的致病性。; 潘金金邹晓艳李鑫宿春虎柴茂姜逸胡艳芬赵国王彦红石火英陈素娟彭大新

三株H9亚型禽流感病毒HA基因的遗传进化分析: 2013年; 2012年初从东台地区分离到3株H9亚型禽流感病毒,通过RT-PCR扩增出其HA基因,并对其进行测序及遗传进化分析。结果显示3株病毒的HA基因开放阅读框全长1683bp,共编码560个氨基酸,其核苷酸和氨基酸的同源性分别为95.8%～97.8%、97.7%～98.9%,与A/chicken/F/98的同源性分别为90.9%～91.4%、93.2%～93.9%;其裂解位点均为PSRSSR↓GLF,符合低致病力禽流感毒株的特征,推导的氨基酸序列含8个相同的潜在糖基化位点,A/chicken/DT/1/2012比其他2株H9亚型AIV多了一个267NCT的糖基化位点;受体结合位点的226位为L,具有α-2,6受体结合的特征。遗传进化分析显示3株分离株属欧亚种系,与A/Duck/Hong Kong/Y280/97代表株的亲源关系较近。; 高如一缪晓斌宿春虎陈素娟王晓泉刘晓文彭大新; 关键词：H9 禽流感病毒血凝素基因遗传进化分析

江苏部分地区猪圆环病毒2型的分子流行病学检测被引量：8: 2014年; 根据猪圆环病毒2型(PCV2)基因序列,设计1对特异性PCV2的鉴定引物,利用PCR方法对65份疑似PCV2感染的病料进行检测。PCR检测为阳性的病料经处理后,接种无PCV污染的Dulac细胞进行间接免疫荧光检测。对各分离毒株的全基因组进行PCR扩增、测序和基因型分析。结果表明:共分离鉴定21株PCV2,均属2b基因型,其中有16株为1C群,5株为1A/1B群。研究显示PCV2b 1C群已在江苏成为流行毒株。; 管萌宿春虎许晨旭刘星杨林娄亚坤焦库华陈素娟彭大新刘秀梵; 关键词：猪圆环病毒2型基因型 PORCINE CIRCOVIRUS TYPE

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宿春虎