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孙奕钢
作品数:
1
被引量:2
H指数:1
供职机构:
浙江大学数学系
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发文基金:
国家自然科学基金
浙江省重点科技计划
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相关领域:
农业科学
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合作作者
张忠华
浙江大学沃森基因组科学研究院
高雷
中国科学院理论物理研究所
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DNA编码
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浙江大学
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中国科学院
作者
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孙奕钢
1篇
高雷
1篇
张忠华
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遗传
年份
1篇
2005
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寻找水稻DNA编码与非编码区边界方法的比较研究
被引量:2
2005年
在分析DNA序列复杂度、预测基因编码区和非编码的DNA边界识别等问题中,以熵为基础构造的离散量度量提供了一种强有力的工具。为改进寻找水稻基因编码与非编码区边界的效率,提出了两个新的离散量度量(αKL离散量与αJensenShannon离散量),根据密码子的GC含量对氨基酸对应密码子构建了粗粒化向量。比较了融合JensenShannon离散量、JensenRenyi离散量、αKL离散量和αJensenShannon离散量等不同向量所获得的精度,结果表明,在对水稻基因编码区‘终止子’的识别效率上,构建的密码子粗粒化向量融合新引进的度量方法比Bernaola等人的方法(2000)提高了4~5倍。
孙奕钢
高雷
张忠华
薛庆中
关键词:
编码区
水稻
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