叶盛
- 作品数：15 被引量：63H指数：4
- 供职机构：重庆市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家重点实验室开放基金国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
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- 重庆三峡库区2012年乙脑病毒分离株基因序列分析被引量：4
- 2014年
- 目的通过分析2012年重庆三峡库区蚊虫中分离乙脑病毒株PrM及E基因序列，揭示毒株的遗传特性。方法对新分离乙脑病毒的PrM及E基因进行PCR扩增，将扩增产物测序。用分子生物学软件进行核苷酸及氨基酸序列分析，并绘制系统进化树。结果新分离的8株乙脑病毒株均为基因I型，与我国其他省市的既往分离株进化关系较近；分离株与减毒活疫苗株SA14—14—2相比较，PrM区核苷酸同源性在85．1％～86．7％之间，氨基酸同源性在95．1％～96．3％之间；E基因区核苷酸同源性在87．6％～87．8％之间，氨基酸同源性在96．9％～97．1％之间。所有新分离株与疫苗株在E基因存在14个氨基酸差异位点。结论2012年8株重庆乙脑分离株为基因I型，在E基因区域与疫苗株相比有部分差异。
- 叶盛文海燕喻臻冯燕陈爽凌华
- 关键词：乙脑病毒E基因
- 重庆市2009～2014年甲型H1N1流感病毒分离株HA基因变异分析被引量：3
- 2016年
- 目的对2009-2014年分离得到的甲型H1N1流感病毒进行血凝素（HA）基因测序分析,与世界卫生组织（WHO）推荐疫苗株A/California/07/2009（H1N1）比对,研究其基因变异情况。方法按分离时间及地点不同,选取47株2011-2014年分离得到的甲型H1N1流感病毒进行测序,同时选取既往已有的25株2009年甲型H1N1流感病毒的序列结果,经分子生物学软件进行核苷酸及氨基酸序列分析,并绘制系统进化树。结果 2009、2011-2014年的新型甲型H1N1流感病毒与疫苗株均位于一个大的分枝下,各病毒间的关系均较近。72株分离株的HA基因总的核苷酸差异在0-2.7%之间,氨基酸差异在0-3.1%之间;与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）的核苷酸差异在0.4%-2.4%之间,氨基酸差异在0.9%-3.1%之间。氨基酸变异情况随着年份增加累积得更多,但在氨基酸序列上仍显示为低致病性流感病毒特征;2009年有9株病毒株丢失481位的糖基化位点,2013年有6株病毒株增加位于162位的糖基化位点。结论 WHO推荐的甲型H1N1疫苗总体上对重庆地区的人群仍有较好的保护作用,但随着时间推移,部分甲型H1N1流感病毒株可能已发生抗原漂移,需继续对其监测。
- 叶盛喻臻陈爽凌华熊宇李勤
- 关键词：甲型H1N1流感病毒HA基因
- 2019-2021年重庆市外环境禽流感病毒污染状况监测结果分析被引量：5
- 2023年
- 目的分析2019-2021年重庆市外环境禽流感病毒污染状况,为人感染禽流感疫情防控提供科学依据。方法运用实时荧光定量RT-PCR法对外环境标本进行甲型通用流感病毒核酸检测,阳性标本再检测禽流感病毒H5、H7和H9亚型。用SPSS 25.0软件进行数据统计分析,率间比较采用χ^(2)检验。结果2019-2021年,共采集外环境标本4331份,甲型阳性率为23.90%。不同年份甲型阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=2.27,P>0.05),H5、H9、H5+H9混合型和甲型非H5、H7、H9型阳性检出率分别为13.43%、47.92%、35.17%、3.48%,未检出H7亚型。不同监测地区甲型阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=195.82,P<0.001),居前两位的是九龙坡区(35.36%)和铜梁区(34.76%)。不同监测场所(χ^(2)=272.54,P<0.001)、不同类型样本(χ^(2)=187.78,P<0.001)、不同季度(χ^(2)=70.88,P<0.001)阳性率差异有统计学意义。其中,以农贸市场阳性检出率(29.17%)最高,清洗禽类污水(34.54%)和宰杀或摆放禽肉案板表面擦拭标本(31.75%)阳性检出率高于其他样本,阳性检出率高峰主要出现在冬春季。结论重庆市外环境中持续存在H5、H9禽流感病毒污染,具有人感染风险,应进一步规范活禽市场管理和加强人员防护宣教,并持续开展外环境禽流感病毒监测。
- 陈爽喻臻喻臻叶盛王明月叶盛唐云
- 关键词：禽流感病毒
- 重庆流行性乙型脑炎病毒分离株CQ11-66在PrM／C及E基因区的分子特征被引量：1
- 2012年
- 目的分析重庆地区儿童流行性乙型脑炎（简称乙脑）病毒分离株CQ11-66在PrM／C及E基因区的分子特征。方法采集重庆医科大学附属儿童医院感染消化科诊断的流行性乙脑患者血液及脑脊液标本，通过接种BHK-21细胞检测并分离乙脑病毒，并对其PrM／C及E基因区测序。使用ClustalX（1．8）、MEGA5等生物学软件进行核苷酸序列、氨基酸序列及系统进化分析。结果本研究仅从儿童乙脑患者脑脊液标本中分离到1株乙脑病毒，命名为CQ11-66。CQ11-66和其他国家及地区的乙脑病毒分离株相比，PrM／C基因区总体核苷酸及氨基酸序列同源性分别为74．8％～97．4％及85．6％098．7％，而E基因区总体核苷酸及氨基酸序列同源性分别为81．6％～99．6％及94．8％～99．6％；CQ11．66株与福建省乙脑病毒人分离株相比较，在PrM／C、E基因核苷酸及氨基酸序列同源性均很高。基于PrM／C及E基因区核苷酸序列进行系统进化分析，CQ11-66株属于基因Ⅲ型。结论在重庆市儿童乙脑患者标本中分离到1株乙脑病毒CQ11-66，CQ11-66株在PrM／C和E基因区核苷酸序列和氨基酸序列同其他乙脑病毒分离株存在一定的差异，且系统进化分析显示CQ11-66株属于乙脑病毒基因Ⅲ型。
- 许丽娟凌华叶盛冯燕朱朝敏
- 关键词：流行性乙型脑炎病毒E基因分子特征
- 微滴式数字聚合酶链式反应技术在新型冠状病毒检测中的应用与评价
- 2023年
- 目的 分析微滴式数字聚合酶链式反应(droplet digital polymerase chain reaction, ddPCR)对新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome corona virus-2, SARS-CoV-2)的核酸检测结果,并与实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction, qRT-PCR)检测结果相比较,评价其检测优缺点,为优化新型冠状病毒的核酸检测方案提供数据支持。方法 根据中国疾病预防控制中心公布的SARS-CoV-2特异性引物探针,设计针对SARS-CoV-2的ddPCR检测方法,选取1份样本梯度稀释后进行灵敏度试验;选取季节性H3N2流感病毒等6种呼吸道病毒核酸阳性的样本与SARS-CoV-2阳性样本进行特异性试验;选取5份SARS-CoV-2阳性样本进行重复性试验,并选取SARS-CoV-2阳性30份、阴性20份样本进行多临床样本检测,与qRT-PCR检测结果进行分析比较。结果 ddPCR法能特异检出SARS-CoV-2,并直接得到样本靶基因的原始拷贝数,实现精准定量;对梯度稀释阳性样本灵敏度检测显示,qRT-PCR在样本10-5稀释度部分检出靶基因,10-6稀释度未检出靶基因,而ddPCR在样本10-5、10-6稀释度均全部检出靶基因,ddPCR的检测下限相对qRT-PCR结果有2个数量级的提升,灵敏度高于qRT-PCR;两种方法重复性实验结果比对中,ddPCR变异系数为1.266%~11.814%,低于qRT-PCR的1.729%~26.174%,重复性高于qRT-PCR;对50份临床样本检测比较中,30份新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019, COVID-19)确诊病例阳性样本,两种方法均能成功检出SARS-CoV-2,20份COVID-19阴性样本经两种方法检测,结果均为阴性,检测结果符合率为100.00%(50/50)。结论 ddPCR法对SARS-CoV-2能精准定量,特异性强,且灵敏度和重复性均高于qRT-PCR,但也存在一定检测局限性,更适合低载量样本的检测。在实际检测中,可将两种方法合理结合,提高检测准确性。
- 陈爽王明月喻臻喻臻叶盛唐云谭章平
- 关键词：新型冠状病毒灵敏性特异性
- 重庆市2016—2020年流感监测分析被引量：9
- 2022年
- 目的分析2016—2020年重庆市流感流行病学特征,为流感防控策略的制定提供科学依据。方法通过“中国流感监测信息系统”收集2016年1月至2020年12月重庆市流感样病例报告及病原学监测数据,采用荧光定量RT-PCR方法对流感样病例咽拭子样本进行病原学检测,对流感流行发生时间、地区、人群进行描述性流行病学及统计学分析。结果2016—2020年重庆市报告流感样病例就诊百分比(ILI%)为1.72%,五个年度依次为0.83%,0.83%,3.53%,2.23%,1.20%;流感病毒核酸阳性检出率为14.96%,五个年度分别为13.38%,20.34%,13.97%,23.81%和2.65%,流感流行主要集中在每年的1—3月和10—12月。不同年度ILI%和核酸阳性检出率差异均有统计学意义(P<0.05)。发病高峰为每年冬春季,发病人群以0~<15岁年龄组为主(85.15%),流感病毒阳性检出率最高的是5~<15岁组(19.79%)。不同年度流感流行的优势毒株型别不同,呈现交替循环的规律。结论2016—2020年重庆市流感处于季节性流行水平,流行高峰出现在每年的冬春季,不同亚型流感病毒交替流行,无重大流感疫情发生。流感核酸阳性检出人群以小学生为主,流感的防控应重点关注学校等人群聚集场所,大力推广流感疫苗接种与预防流感的知识宣传,降低流感等呼吸道传染病的发病率。
- 谭章平喻臻唐云唐云王明月叶盛漆莉凌华熊宇
- 关键词：流感病毒流感样病例
- 一起人感染羊痘病毒疫情的实验室诊断被引量：8
- 2012年
- 目的对2010年重庆彭水县一起人感染羊痘病毒疑似病例进行病原学检测,以明确诊断。方法对患者进行流行病学调查,采用羊痘病毒特异性引物对5例患者的5份疱疹液标本和来自3只病羊的眼分泌物、痘疱液、痘痂块共4份标本进行PCR检测,并采用VeroE6细胞进行病毒分离;对扩增出的DNA片断进行测序,经BLAST进行序列比对分析。结果报告的34个病例均与病羊有接触史。1份病羊痘疱液标本山羊痘病毒分离阳性。9份标本的羊痘病毒A29L基因的413bp片段扩增结果均为阳性。使用A95/B7扩增羊痘病毒P32基因,5份人的疱疹液标本中,4份为PCR扩增阳性。2份病例标本及1份病羊的病毒分离物P32基因扩增产物的DNA片段序列间具有100%的同源性,3条序列与山羊痘病毒G20-LKV病毒株具有99%的同源性。系统进化树显示:重庆市彭水县获得的山羊痘病毒与我国广西柳江2003年流行的病毒和越南2005年流行的毒株进化距离较近,与2009年重庆及甘肃的病毒株也有较近的进化距离。结论重庆市彭水县人感染羊痘病疫情系由人直接接触病羊而感染山羊痘病毒所致。
- 凌华李勤金连梅彭克发赵春芳陈熙王豫林冯连贵赵华陈应琼李稀龄叶盛
- 关键词：疫情山羊痘病毒病毒分离核酸扩增
- 2017—2021年重庆市0~14岁儿童流感监测分析
- 2024年
- 目的分析2017—2021年重庆市0~14岁儿童流感流行病学特征,为儿童流感防控提供科学依据。方法通过中国流感监测信息系统收集2017年1月至2021年12月重庆市0~14岁儿童流感样病例(ILI)报告及病原学监测数据,对儿童流感发病特征进行描述性分析。结果2017—2021年重庆市报告0~14岁儿童ILI%为1.48%,流感病毒核酸阳性检出率为13.51%,5年度分别为21.24%、12.67%、20.64%、1.91%和10.75%,不同年度核酸阳性检出率差异有统计学意义。流感病毒核酸阳性率在学生组中最高(25.02%),其次为幼托儿童组(18.55%)及散居儿童组(7.09%),3组间阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=1150,P<0.001)。儿童流感流行主要在每年的冬春季,11月至次年1月是儿童流感流行的高发月份,流感阳性率最高,春季以甲流为主,新甲H1N1为优势毒株,夏、秋、冬3季以乙流为主,Victoria系阳性率较高。按年龄组分析,流感样病例以0~5岁年龄组为主,但流感阳性率不高;7~14岁年龄组儿童流感样病例较少,但流感病毒核酸阳性检出率最高。不同性别儿童流感阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=,P<0.001),不同型别流感毒株在不同性别构成比差异也无统计学意义(χ^(2)=,P<0.001)。结论2017—2021年重庆市儿童流感处于季节性流行水平,冬春季阳性率较高,不同年度儿童流感流行的优势毒株型别不同,呈交替循环的规律。幼托儿童和学生是流感的高发人群,是流感防控的重点对象,应加强流感疫苗接种。
- 谭章平陈爽喻臻喻臻叶盛唐云漆莉叶盛熊宇
- 关键词：流感病毒儿童流感
- 2011-2015年重庆市流感监测结果分析被引量：24
- 2017年
- 目的了解重庆市2011-2015年流感流行特征及优势毒株的型别分布,为流感防治工作提供科学依据。方法通过收集流行病学资料、核酸检测技术及病毒分离技术,对重庆市2011-2015年流感样病例(ILI)进行流行病学、病原学及统计学分析。结果 2011-2015年重庆市流感样病例百分比(ILI%)为1.15%,ILI%曲线总体走势平稳,各监测年度ILI%有差异(P<0.01)。从年龄上看,ILI在0~4岁组最高(55.29%),在60~岁组最低(2.69%),各年龄组ILI分布有差异(P<0.01)。流感监测核酸阳性率13.29%,暴发阳性率达到66.75%,型别分布均以H3型和B为主,各年份核酸阳性率有差异(P<0.01)。5年共分离到流感毒株2244株,病毒分离率为8.60%。不同哨点医院ILI采样核酸阳性率、不同网络实验室病毒分离率存在差异。结论 2011-2015年重庆市流感活动强度保持平稳,不同亚型流感病毒交替流行,无重大流感疫情发生。坚持开展流感监测工作,对控制流行与预测有重要意义。
- 陈爽凌华喻臻唐云叶盛
- 关键词：流感病毒流感监测
- 重庆市2011-2016年甲型H1N1流感病毒分离株NA基因变异分析被引量：2
- 2017年
- 目的 研究重庆市2011-2016年甲型H1N1流感病毒株神经氨酸酶（NA）基因特征,为甲型H1N1流感病毒感染的监测和预防提供试验依据.方法 按分离时间及地点的不同选取43株甲型H1N1流感病毒,经RT-PCR扩增病毒NA基因片段并进行序列测定,进行核苷酸及氨基酸序列分析.结果 基于NA基因的进化树显示,2011-2016年的甲型H1N1流感病毒与疫苗株关系均较近.43株病毒之间的NA基因同源性较高,与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）的核苷酸同源性为97.9%~99.4%,氨基酸同源性为96.8%~98.9%.研究中大部分甲型H1N1病毒NA蛋白上都具有疫苗株NA蛋白具有的8个糖基化位点,但也有部分毒株增加42位（NQS）的糖基化位点,或者丢失386位的糖基化位点.结论 甲型H1N1病毒的NA序列变异情况逐年增加,但总体上来说,重庆地区大部分甲型H1N1病毒仍对达菲敏感;同时应加强耐药性监测,为制定应对甲型H1N1流感流行措施提供参考.
- 陈爽叶盛凌华喻臻唐云
- 关键词：甲型H1N1流感病毒NA基因
