龙文敏 作品数:10 被引量:37 H指数:4 供职机构: 上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山西省自然科学基金 山西省青年科技研究基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 更多>>
健康成年人肠道硫酸盐还原菌和丁酸盐产生菌的性别差异 被引量:3 2015年 探究人体肠道内重要的功能菌——硫酸盐还原菌和丁酸盐产生菌在健康成年个体中的数量,并分析其与年龄、性别的关系。采集40名健康成年志愿者(男性:女性=1:1,年龄23~53岁)的粪便样品,采用试剂盒Invi Mag誖Stool DNA Kit联合Bead beating的方法提取粪便中细菌总DNA。通过定量PCR技术对总菌、硫酸盐还原菌以及丁酸盐产生菌的拷贝数进行定量检测。结果显示,40名健康成年人每纳克粪便DNA中含有的细菌总量为(9.22×106±7.35×106)个拷贝,硫酸盐还原菌拷贝数为(9.21×103±9.87×103),而丁酸盐产生菌拷贝数稍高于硫酸盐还原菌,为(2.68×104±3.08×104)。硫酸盐还原菌和丁酸盐产生菌的数量在不同个体间存在较大差异。Spearman相关分析显示三类基因的拷贝数与志愿者年龄无显著相关关系。硫酸盐还原菌和丁酸盐产生菌的拷贝数及其相对丰度存在显著的性别差异,表现在男性个体含有更少的硫酸盐还原菌(p<0.05)和更多的丁酸盐产生菌(p<0.01)。本研究揭示了硫酸盐还原菌和丁酸盐产生菌在健康成年人肠道内的数量,为进一步探究肠道菌群的性别差异提供了新的思路。 冯舟 李敏 龙文敏 庞小燕关键词:性别差异 定量PCR 硫酸盐还原菌 肠道硫酸盐还原菌DGGE分析技术的建立 被引量:2 2013年 目的建立分析肠道内硫酸盐还原菌(Sulfate-reducing bacteria,SRB)组成的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gra-dient gel electrophoresis,DGGE)技术,并用于分析10例健康人粪便样品中的SRB组成。方法从GenBank中下载13株脱硫弧菌科细菌的腺苷酰硫酸还原酶α亚基基因(aprA)的序列,利用Clustal X、Simulated PCR(SPCR)软件比较、评估了2对针对aprA基因的引物(AprA-3-FW/APS-RV和AprA-1-FW/AprA-5-RV)用于扩增粪便样品中的SRB的特异性。确定PCR引物和条件,进一步摸索并建立DGGE分析体系。结果 Clustal X和SPCR软件分析的结果均表明引物AprA-3-FW/APS-RV优于AprA-1-FW/AprA-5-RV。实际PCR的结果也显示AprA-1-FW/AprA-5-RV扩增效率低并有非特异扩增。建立DGGE体系,对10例健康人肠道中SRB的分析显示,每个个体肠道中SRB的种类有1到5种不等。结论基于aprA序列的DGGE技术是分析肠道SRB组成的有效方法。 刘辰雷 殷晓晨 龙文敏 费娜 赵立平 庞小燕关键词:硫酸盐还原菌 DGGE 肠道菌群 中华稻蝗AFLP反应体系的建立与优化 被引量:5 2007年 以中华稻蝗为研究材料,提取到高质量的总DNA。通过优化酶切连接、预扩增、选择性扩增等实验条件,确定了AFLP银染技术方法,从而建立了中华稻蝗AFLP分子标记研究体系,得到了清晰的AFLP指纹图谱,为探讨稻蝗种间遗传学关系提供了新的技术手段。 郑先云 宣涛 龙文敏 郭亚平 马恩波关键词:AFLP 分子标记 PCR 中华稻蝗 Cd^2+对红裸须摇蚊Propsilocerus akamusi的急性毒性研究 被引量:9 2008年 采用急性毒性实验方法,研究了水环境中常见污染物Cd2+对红裸须摇蚊Propsilocerus akamusi的急性毒性,结果表明,Cd2+对红裸须摇蚊在24h、48h以及72h的半致死浓度(LC50值)分别为235.63(95%CI:160.96~418.82)、165.17(95%CI:140.65~198.35)及94.12(95%CI:81.93~108.78)mmol·L-1Cd。Cd2+对红裸须摇蚊幼虫的毒性与对其他摇蚊物种幼虫有明显不同,该物种对Cd2+急性毒性不敏感,有非常强的耐受能力。同一时间不同浓度的Cd2+处理对CAT活性影响的LSD法多重比较检验结果显示,24h与48h的各浓度Cd2+对CAT活性都没有明显差异,只是在72h时CAT活性在对照组与其他处理浓度组之间的差异达到了显著性水平。时间因子对CAT活性的影响则主要表现为Cd2+浓度在400mmol·L-1时,72h处理组与48h处理组的活性表现出显著差异,CAT活性在72h时被显著抑制。 郑先云 龙文敏 郭亚平 马恩波关键词:LC50 急性毒性试验 蝗虫肠道微生物总DNA提取方法的比较 被引量:3 2009年 采用Bead beating法和QIAamp DNA stool mini kit法提取蝗虫肠道微生物总DNA,并对2种方法提取DNA的得率、完整性以及16SrRNA基因扩增产物的变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)图谱等进行综合比较。结果表明,Bead beating法提取DNA的得率显著高于QIAamp DNA stool mini kit法(P=0.042),而QIAamp DNA stool mini kit法提取DNA片段更完整。PCR-DGGE检测微生物多样性结果显示,QIAamp DNA stool mini kit法提取DNA所代表的微生物群落多样性略高于Bead beating法,但Mann-Whitley统计学检验表明用2种方法检测蝗虫肠道微生物多样性无显著差异(P=0.17)。因此在蝗虫肠道微生物群落多样性的检测中QIAamp DNA stool mini kit法具一定的优势,而Bead beating法同样适用。 龙文敏 严二平 宣涛 魏华 庞小燕 赵立平 马恩波关键词:蝗虫 肠道微生物 DNA提取 PCR-DGGE 蝗虫肠道菌群结构的分子生态学研究 蝗虫是世界性的农业害虫,在我国分布范围广、种群数量大。20世纪90年代以来,受异常气候及生态环境恶化等因素的影响,我国蝗虫的发生逐年加重,以东亚飞蝗为主的蝗灾发生面积扩大,暴发频率提高,对我国农业生产构成严重威胁。东亚飞... 龙文敏关键词:东亚飞蝗 肠道微生物 菌群结构 定量PCR比较两种苦瓜制品对人肠道菌群结构的体外调节作用 被引量:1 2014年 目的通过体外厌氧培养联合定量PCR的方法比较两种不同的苦瓜制品,苦瓜全粉(Bitter melon power,BMP)和苦瓜乙醇提取物(Bitter melon ethanol extract,BME),对健康人和2型糖尿患者肠道菌群结构的调节作用。方法采集一名健康个体和一名2型糖尿病个体的新鲜粪便样品,在体外厌氧的条件下与不同浓度的BMP或BME共培养,收集0、12、24、48 h的菌体沉淀。采用定量PCR的方法,检测乳杆菌属细菌、双歧杆菌属细菌、丁酸盐产生菌、硫酸盐还原菌和肠杆菌科细菌这5类细菌在总菌中相对含量的变化。结果培养过程中,双歧杆菌属细菌、硫酸盐还原菌和肠杆菌科细菌在两名个体培养样本中表现出类似的生长趋势,而乳杆菌属细菌和丁酸盐产生菌则有差异。相同培养时间下,与对照组相比,BMP和BME在两名个体的培养样本中均能富集乳杆菌属细菌、双歧杆菌属细菌和丁酸盐产生菌,并抑制肠杆菌科细菌,但是只有BMP 15 mg/mL能持续抑制硫酸盐还原菌。相同浓度之下,BMP对菌群结构的调节效果比BME显著。结论来自不同个体的相同肠道细菌类群可能呈现不同的体外生长趋势,但BMP和BME均能对同一细菌类群起到类似的调节作用;且相较于BME,BMP通过富集一些有益细菌并抑制机会致病细菌从而改善肠道菌群结构的效果更显著。 何欣欣 徐佳 宋岷埈 张旭 龙文敏 王凌华关键词:肠道菌群 定量PCR 三种胆汁酸盐对Bilophila wadsworthia菌株生长的影响 2015年 本研究通过体外纯培养实验研究了3种胆汁酸盐:牛磺胆酸(TCA)、胆酸(CA)和脱氧胆酸(DCA),对沃氏嗜胆菌(Bilophila wadsworthia)菌株的生长状况的影响。比浊法和活菌计数法结果表明,TCA能显著促进该菌株生长,与添加相同摩尔浓度的牛磺酸(TAU)带来的效应接近,而CA和DCA对该菌株无显著作用。通过超高效液相色谱-质谱技术分析B.wadsworthia菌株对TCA的代谢的结果显示TCA可被该菌株分解产生CA和TAU。Ca2+沉淀法对B.wadsworthia菌株产胆盐水解酶的能力进行鉴定的结果表明该菌株具有产胆盐水解酶的能力。由此推断,TCA对B.wadsworthia菌株的促进作用主要是通过其水解产生的TAU,而非CA来发挥的。 马晓庆 冯舟 赵宇峰 赵立平 龙文敏关键词:牛磺胆酸 胆酸 脱氧胆酸 胆盐水解酶 中华稻蝗不同地理种群遗传多样性的AFLP分析 被引量:8 2010年 为研究中华稻蝗种群遗传多样性和遗传结构,文章对我国7省市的7个中华稻蝗种群进行AFLP分析。选取7对引物扩增128个个体,共产生336条带,多态性条带292条,占86.90%。结果表明:中华稻蝗种群具有较高的遗传多样性水平,其中海南万宁种群的遗传多样性高于其他各种群。Mantel检验(r=0.27,P=0.89)表明中华稻蝗各种群遗传距离与地理距离间没有显著相关性。种群间具有明显的遗传分化现象。UPGMA(Unweighted pair group method average)聚类分析显示,7个中华稻蝗种群按地理距离分为3支:北方北京昌平、山西太原和山东济宁为一支;南方陕西汉中、湖南长沙和广西来宾为一支;海南万宁单独为一支。上述结果以及PCA(Principal component analysis)分析均表明由于地理隔离中华稻蝗种群显示出明显的南北分化和岛屿大陆种群遗传分化现象。 马晋 李涛 龙文敏 安玮玮 郭亚平 马恩波关键词:中华稻蝗 AFLP 地理隔离