靖美东
- 作品数:20 被引量:15H指数:2
- 供职机构:鲁东大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金山东省自然科学基金烟台市科学技术发展计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生环境科学与工程更多>>
- 小家鼠群体遗传学研究
- 小家鼠(Mus musculus)属啮齿目(Rodentia)、鼠科(Muridae)、小家鼠属(Mus),是一类体型较小、夜出活动、与人共栖的世界性分布的家栖鼠类.它的起源及迁移与人类活动关系密切,对其进化研究为人类进...
- 靖美东黄玲
- 关键词:小家鼠线粒体控制区进化
- 新疆小家鼠控制区序列分析被引量:1
- 2010年
- [目的]研究新疆地区小家鼠控制区的序列多样性。[方法]对14只来自新疆于田、和丰和乌鲁木齐的小家鼠个体进行基因组DNA提取,控制区PCR扩增和序列测定,并分析其遗传多样性,构建系统进化树。[结果]14只小家鼠基因组大小均在20 000 bp以上;小家鼠控制区序列中A、T、G、C的平均含量分别为:T:29.0%;C:25.2%;A:33.9%;G:11.9%,个体间碱基组成几乎无差别;14只小家鼠个体与M.m.musculus的亲缘关系较近,在系统进化树中共享1个分支,且该分支中2225、2228和2226具有相同的支长,2242和2243具有相同的支长,2249、2247和2251具有相同的支长。[结论]供试14只新疆小家鼠个体属于M.m.musculus亚种。
- 徐华靖美东黄玲王艳华
- 关键词:控制区系统进化树
- 社鼠(Niviventer confucianus)线粒体基因组全序列分析被引量:1
- 2014年
- 社鼠(Niviventer confucianus)属于啮齿目(Rodentia)、鼠科(Muridae)、白腹鼠属(Niviventer),关于该物种的分子系统学研究极少。为获取社鼠线粒体基因组全序列,提取其基因组总DNA,参照近缘物种线粒体基因组全序列设计34对特异性引物,利用PCR扩增全部片段后进行测序,之后对其基因组组成及结构特点进行了初步分析。结果表明,社鼠线粒体基因组全序列长16 281 bp(GenBank收录号:KJ152220),包含22个tRNA基因、13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和1个非编码控制区;基因组核苷酸组成为34.0%A、28.6%T、24.9%C、12.5%G。将所得序列与社鼠近缘物种(川西白腹鼠、小家鼠、褐家鼠)的线粒体全基因组进行比较,结果显示,四个物种的线粒体基因组虽然在基因组大小、部分tRNA二级结构、部分蛋白质编码基因的起始或终止密码子及控制区长度和碱基组成上有差异,但基因组结构和序列特征方面都具有较高的相似性。四个物种线粒体全基因组间的遗传距离显示,社鼠与川西白腹鼠距离最近,而与小家鼠距离最远。该研究为利用线粒体全基因组信息进行啮齿类分子系统学研究提供了有价值的资料。
- 马晓婷黄玲刘玉静解卫海靖美东
- 关键词:社鼠线粒体基因组
- 鹿科麂属动物基因组演化研究进展被引量:3
- 2012年
- 鹿科麂属(Muntiacus,Cervidae)在近两三百万年内经历了快速物种辐射,但其物种间核型差异大.5个现生种核型数显示,该类染色体数目范围从小麂(Muntiacus reevesi)的46条到赤麂(M.muntjak vaginalis)的6条.该类的因组在较短时间内发生了快速演化,使其成为进化生物学研究的理想材料.40多年来,技的革新使该领域的研究不断深入,染色体重排的类型、推动重排的分子制及物种间的核型演化历程逐渐被阐释.而且,研究中发现,雄性黑麂(M.crinifrons)1p+4染色体的演化途径与哺乳动物Y染色体的演化历程相似,可成为哺乳动物性染色体演化研究的珍贵模型.有关麂动物因组演化依有许多问题等待更加全面、深入的探讨.本文总结了该领域研究进展,并对未来研究热点进行了展望.
- 黄玲靖美东周琦杨凤堂王文
- 关键词:麂属动物核型演化
- 小家鼠群体遗传学及与人类迁徙关系研究
- 讨小家鼠在中国的线粒体DNA分化;推断生物地理演化过程和人类活动对小家鼠迁移的影响,对小家鼠在我国的群体遗传学进行了初步的研究。通过测定来自中国12个采集地的184只小家鼠的控制区全序列,并结合了Genbank里的单倍型...
- 靖美东黄玲
- 关键词:小家鼠群体遗传学地理分布线粒体DNA
- 烟台威海沿海菲律宾蛤仔线粒体遗传多样性分析被引量:3
- 2012年
- [目的]了解我国沿海野生菲律宾蛤仔群体遗传多样性和遗传分化情况。[方法]采用PCR技术对烟台威海2个群体的线粒体COⅠ基因片段进行扩增和序列分析。[结果]50个样本均得到684 bp的COⅠ基因片段序列,共定义了42个单倍型,检测到62个变异位点,2个群体单倍型多样性都较高,而核苷酸多样性相对偏低。用最大似然法(Maximum Likelihood,ML)构建的单倍型系统进化树显示2个地理种群的样本呈现散在分布,无明显的种群分化。[结论]反映了海洋动物的基因交流较容易,不同海域隔离较弱。
- 毕晓欣黄玲靖美东韩立亚郝月
- 关键词:菲律宾蛤仔遗传分化
- 小家鼠群体遗传学研究
- 靖美东黄玲
- 关键词:小家鼠线粒体控制区进化
- 我国不同地区小鼠Y染色体Zfy1基因遗传差异分析被引量:1
- 2019年
- [目的]对我国5个地区小鼠Zfy1基因进行遗传差异分析。[方法]通过对5个地区79个雄性小鼠样品进行DNA提取,PCR扩增后进行序列测定和分析。使用MEGA6.0和DNAsp等软件对获得序列进行分析,计算遗传距离,构建系统发育树。[结果]5个地区Zfy1基因碱基组成基本一致,碱基的平均含量为A 25.1%、T 39.6%、G 20.8%、C 14.4%,呈现出明显的AT偏向。79个样品共定义为13个单倍型,各单倍型间遗传距离小,无明显差异。以大鼠(GATN01000010)为外群,小鼠(NM_009570)为参照构建系统发育树,13个单倍型均处在同一分支上,无明显分化现象。[结论]我国南北方各地区间小鼠Zfy1基因无明显分化现象,基因差异性较小,具有极高的保守性。
- 陈梦璇于立强靖美东
- 关键词:小鼠Y染色体
- 丹顶鹤线粒体基因组全序列分析
- 丹顶鹤(Grusj aponensis)属鸟纲(Aves)鹤形目(Gruiformes)鹤科(Gruidae)。国家一级保护动物,世界五大稀有鹤种之一。繁殖区在黑龙江省的嫩江、松花江和乌苏里江流域,越冬区在长江中下游地区...
- 毕晓欣靖美东张莉黄玲
- 关键词:丹顶鹤线粒体基因组系统发育
- 鳗弧菌和灿烂弧菌对菲律宾蛤仔代谢途径的比较研究
- 海水养殖动物弧菌病的暴发成为威胁养殖业的主要瓶颈之一。菲律宾蛤仔因其生长迅速、养殖周期短、适应性强等特点,成为我国四大养殖贝类之一。本实验以菲律宾蛤仔(白蛤)为研究对象,采用基于核磁共振波谱技术的代谢组学技术,探索菲律宾...
- 申雪娇刘小莉王宜艳靖美东赵彦翠孙虎山