金能智
- 作品数：29 被引量：31H指数：3
- 供职机构：甘肃省计算中心更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划甘肃省重点实验室建设计划国家民委科研基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学理学医药卫生更多>>
- 甘肃省网络科技环境平台扩容及运行经费
- 者建武沈玉琳金能智马尧孙一桐文洮柳亭舒毅彭天蜀白瑞俊肖珺徐惠萍王娜马骥李唐艳赵志威刘光明
- 项目通过升级改造，提升了计算集群的计算能力和存储能力，计算集群计算能力达到70TFlops，存储能力120TB，完成了UPS、精密空调等设施的更新，部署了重点应用领域软件11套，并优化了集群软件环境，保障了计算集群稳定运...
- 关键词：
- 关键词：数据库
- A/swine/H1N1流感病毒中国分离株血凝素进化分析被引量：2
- 2011年
- 2009年3月以来,甲型H1N1病毒已在全球包括中国造成了巨大的危害,所以利用生物信息技术对其进行研究显得十分必要。从NCBI数据库下载中国大陆境内A/swine/H1N1病毒HA基因核酸序列及其编码蛋白序列,利用MEGA4.0软件对核苷酸编码序列构建系统进化树,利用BioEdit软件对蛋白序列进行比对,分析重要抗原位点变异情况,结果显示2010年在广东流行的病毒,从其他地方传播到广东的,而非早期广东流行的的病毒变异而来。2008年福建,山东,北京等地区的病毒传播比较迅速.这些分析结果阐明了中国大陆境内A/swine/H1N1病毒血凝素(HA)基因的进化关系和变异趋向,对于研究A/swine/H1N1病毒具有重要的参考价值。
- 金能智张正权孙一桐沈玉琳
- 关键词：流感病毒血凝素进化树
- Matlab在分形中的应用研究
- 2017年
- Matlab具有强大的科学运算和灵活的程序设计,可提供高质量的图像可视化,已经在很多领域得到广泛应用。分形是非线性科学的重要分支,分形几何学却具有尺度上的对称性,分型图形是计算机图形学和分形理论相结合的产物。该文利用Matlab强大的编程工具和图形显示功能实现Cantor集、Koch曲线、分形树图形,这对数学类、计算机图形学和相关专业类研究人员有一定的参考价值。
- 金能智者建武文洮杨博超李葆光
- 关键词：分形MATLABCANTOR集KOCH曲线
- GPGPU加速生物序列比对研究进展
- 2013年
- 序列比对是生物信息学中最常用和最经典的研究手段。生物序列比对需要有强大计算能力的硬件支撑,而近年快速发展起来的GPGPU正好可堪此任。本文首先介绍GPGPU的发展过程,进而讲述GPGPU硬件设备与其编程环境,然后对GPGPU做科学计算时需要的数学库函数做一介绍,最后综述近年来国内外基于GPGPU的生物序列比对软件和相关研究工作,并总结和展望其辉煌前景。
- 沈玉琳金能智孙一桐者建武马尧
- 关键词：GPGPU
- 人类Y染色体回文序列紧邻核苷酸的语言特征
- 2011年
- 人类基因组Y染色体回文序列具有非常特殊的对称结构,容纳了许多控制着睾丸发育的基因,破译其结构与所隐含的遗传信息成为生物信息学家们的机遇和挑战.利用语言学中Zipf定律的方法分析了Y染色体八个回文序列(P1～P8)中紧邻核苷酸的频率及其关联度的分布特征。用数学模型进行了精确地描述,发现紧邻核苷酸的频率分布并不满足Zipf定律,而满足三次多项式分布及紧邻核苷酸关联度的分布,满足逆函数分布,这些特征是人类Y染色体回文序列长期进化的结果。
- 金能智沈玉琳者建武张正权
- 关键词：人类Y染色体回文序列
- 地层运动活跃区管线管塑性变形行为的高性能计算模拟研究
- 金能智陈宏远文洮王鹏孙一桐李炎华柳亭王海涛沈玉琳吉玲康肖珺黄呈帅彭天蜀
- 项目针对高应变区管线布设需求，在全尺寸精确测量数据基础之上，建立了X70大变形钢管有限元分析模型，通过高性能计算模拟仿真，得到的屈曲应变度量与试验数据一致的结果，表明建立的模型能够很好地表述大变形钢管的表征，可以应用于高...
- 关键词：
- 关键词：油气管道建设
- 混合架构超级计算集群在流感病毒药物设计中的应用研究
- 2017年
- 频发的流感或其并发症严重影响人类的正常生活,传统的流感疫苗对新出现的病毒无效,亟需这方面治疗药物的出现。流感病毒神经氨酸酶(NA)是抗流感病毒的重要靶点,而GPGPU架构的设计与其发展比较适合在流感病毒药物方面的研究工作,混合架构的超级计算机群因其高效性和节能性已经成为下一代超级计算集群的一个发展方向。因此,这2个方面的结合将是未来的一个趋势。该文利用先进的CPU+GPGPU混合架构超级计算集群和分子对接技术完成流感病毒药物神经氨酸酶抑制剂设计研究工作,具有重要的科研意义。
- 金能智张其斌者建武孙一桐杨博超
- 关键词：流感病毒
- 人类Y染色体回文序列中的重复序列与碱基关联被引量：1
- 2009年
- 利用信息论和统计学的方法并结合生物学的特征研究人类Y染色体回文序列的互信息、“n字”熵、条件熵，定量分析了回文序列的长程关联和短程关联，发现其中既存在长程关联也存在短程关联，并且它们主要是由序列中的重复序列引起的．研究表明重复序列含量越高碱基之间的关联越强．
- 金能智刘子贤齐燕姣邱文元
- 关键词：人类Y染色体回文序列互信息
- 甘肃省计算中心高性能计算平台运营模式对策研究被引量：3
- 2019年
- 高性能计算又被称作超级计算,目前已成为解决科学研究、经济发展、国家安全等方面诸多重大难题的重要手段。甘肃省计算中心作为早期建成的高性能计算普及和应用的载体,为提高甘肃省基础科研能力和创新能力提供了动力。但是近几年在国家快速发展、体制改革的大潮中,甘肃省计算中心由于自身运营模式存在一定的问题,在自我更新与可持续化发展方面缺乏相应的策略。文章通过分析甘肃省计算中心现状,对平台存在的问题进行了分解研究,并结合我国当前部分优秀超级计算中心的发展经验,对该平台今后的发展提出了一些建议和思考,为我国正在计划建设或者发展较慢的高性能计算平台提供一定的参考。
- 文洮沈玉琳金能智费振华
- 血清白蛋白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系被引量：2
- 2017年
- 莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一。分析莪术醇与转运蛋白—血清白蛋白之间的相互作用能够帮助研究者更好的理解药物的作用机制。本文通过用多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术醇与人血清白蛋白相互作用位点及其在其他亲缘关系较近的物种中的特点。结果表明,莪术醇与人血清白蛋白相互作用的结合位点II和III处周围几乎都是疏水性的氨基酸,分子间的疏水作用起着很重要的作用,其最低结合能分别是-7.22 Kcal/mol和-8.34 Kcal/mol。莪术醇与人血清白蛋白之间的作用位点在其他亲缘关系较近的狼(Canis lupus)、绵羊(Ovine)、牦牛(Bos mutus)、家牛(Bos Taurus)物种中都较为保守,少数有变化的氨基酸基本是在极性相同的氨基酸之间发生的。与分子相互作用前的结构相比,莪术醇中的羟基的结构在活性位点处发生了最明显的变化。
- 齐燕姣陆会宁金能智
- 关键词：莪术醇血清白蛋白相互作用亲缘关系
