郑德锋
- 作品数：6 被引量：38H指数：4
- 供职机构：上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室更多>>
- 发文基金：上海市教育委员会重点学科基金上海市科技兴农重点攻关项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 我国沿海棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)群体遗传结构的AFLP分析被引量：13
- 2011年
- 利用AFLP技术分析了我国沿海棘头梅童鱼8个地理群体(山东荣成、江苏南通、启东、上海芦潮港、浙江温州、瑞安、福建福州和广州番禺)的遗传结构特征。10对引物组合在8个群体160尾个体中共扩增出272个位点,多态位点72个,多态位点比例为26.47%。8个地理群体的多态位点比例、Nei遗传多样性指数分别为8.82%—15.07%、0.0291—0.0514,表明棘头梅童鱼群体遗传多样性水平较低。AMOVA分析表明,群体间差异对群体遗传总变异的贡献率为47.91%,群体内差异的贡献率为52.09%。8个群体间的遗传分化指数(Fst)为0.1151—0.5995(P<0.05),存在显著分化。聚类分析表明,荣成与南通群体聚为一支,启东、芦潮港、瑞安群体聚为一支,温州、福州和番禺群体聚为一支。我国沿海棘头梅童鱼群体初步呈现南北分化的格局,但不同类群间尚存在交叉分布。
- 郑德锋赵金良周文玉严骏骢
- 关键词：棘头梅童鱼AFLP
- 鳙中国土著群体与移居群体遗传变异的AFLP分析被引量：11
- 2011年
- 为全面了解鳙(Aristichthys nobilis)在世界范围的群体遗传状况,本研究采用AFLP技术分析了鳙中国土著群体(长江、珠江)与国内、外移居群体(中国黑龙江、欧洲多瑙河、北美密西西比河)的遗传变异特征,结果表明,鳙长江、珠江土著群体的Nei’s基因多样性(H)分别为0.0394±0.1221和0.0529±0.1236,黑龙江、多瑙河、密西西比河移居群体分别为0.0233±0.0883、0.0122±0.0619和0.0134±0.0614,说明国内、外移居群体的遗传多样性显著低于国内土著群体,这与移居群体的来源以及在异地适应、定居、建群过程中发生了明显的遗传瓶颈效应有关。AMOVA分析表明,群体间差异对群体总遗传变异的贡献率为31.48%,而群体内的贡献率为68.52%。鳙长江、珠江群体间的遗传分化指数Fst值为0.3501(P<0.01),土著群体与国内、外移居群体间的总Fst值为0.1550(P<0.01),鳙土著群体与国内、外移居群体间表现为显著分化,反映了移居新形成的自然群体在遗传背景、遗传漂变、经历的生态环境压力与自然选择等方面与土著群体间存在明显差异。本研究通过了解鳙自然群体的遗传现状,海内、外移居群体与中国土著群体的遗传差异,旨为进一步监测该物种海内、外移居群体的遗传变化趋势积累资料,为鳙遗传资源保护、引种移植管理提供依据。
- 严骏骢赵金良李思发郑德锋曹阳
- 关键词：AFLP
- 棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构被引量：12
- 2011年
- 采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtysiucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列。棘头梅童鱼控制区序列长度为778～782bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列。共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样性(Hd)为0.9347±0.0175,平均核苷酸多样性(π)为0.0175±0.0023。棘头梅童鱼群体内的遗传距离(K2-P)为0.0017～0.0228,群体间的遗传距离为0.0023～0.0433,群体间的分化指数FST为-0.0584～0.8458,基因流为0.05～19.62。AMOVA分析结果显示,群体间的变异为74.21%,群体内的变异为25.79%(P<0.05),表明群体间发生了显著的遗传分化。以NJ法构建的亲缘关系树显示,棘头梅童鱼7个群体分为两个大支,一支以北方类群(南通、启东、芦潮港、温州群体)个体为主,另一支以南方类群(福州和番禹群体)个体为主,而位于南、北方类群中间位置的瑞安群体则与两大类群均有交叉。
- 郑德锋赵金良周文玉
- 关键词：棘头梅童鱼群体遗传结构线粒体控制区
- 基于线粒体控制区序列和AFLP分析我国沿海棘头梅童鱼群体遗传结构
- 棘头梅童鱼Collichthys lucidus ( Richardson)属鲈形目Perciformes、石首鱼科Sciaenidae、梅童鱼属Collichthys，是我国沿海重要的小型经济鱼类。采用PCR扩增测序法...
- 郑德锋
- 文献传递
- 长江口邻近水域棘头梅童鱼线粒体控制区序列变异与遗传多样性
- 采用PCR测序方法获得了长江口南通、启东、芦潮港3个地理群体27尾棘头梅童鱼(Collichtys iucidus)mtDNA控制区全序列,分析了该基因序列变异和群体遗传结构.棘头梅童鱼控制区序列长度为781～782 b...
- 郑德锋赵金良
- 关键词：棘头梅童鱼线粒体控制区
- 鲢中国土著群体与海外移居群体遗传多样性的AFLP分析被引量：9
- 2010年
- 采用AFLP技术从长江群体内(邗江、老河)、中国长江、珠江、黑龙江群体间以及中国土著群体和海外移居群体(多瑙河、密西西比河)间3个层面分析了鲢自然群体在世界范围内的遗传格局。结果表明,邗江、老河、珠江、黑龙江群体的Nei氏基因多样性(H)分别为0.0481±0.1151、0.0659±0.1333、0.0510±0.1155和0.0661±0.1364,多瑙河、密西西比河群体分别为0.0576±0.1250和0.0540±0.1221;中国土著鲢总的遗传多样性(0.0729±0.1295)高于海外移居群体。AMOVA分析表明,群体间差异对群体总遗传变异的贡献率为8.14%,而群体内差异的贡献率为91.86%。长江石首与邗江群体间的遗传分化FST值为0.0701(P<0.01),长江、珠江、黑龙江群体间的FST值为0.0704(P<0.01),中国土著群体与海外移居群体间的FST值为0.0424(P<0.01),鲢中国土著群体内、土著群体与海外移居群体间均表现分化显著。研究结果为进一步监测海内、外鲢自然群体的遗传变化趋势积累基础资料。
- 严骏骢赵金良李思发郑德锋
- 关键词：扩增片段长度多态性
