郑伟谋
- 作品数:10 被引量:51H指数:3
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- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:理学自动化与计算机技术文化科学自然科学总论更多>>
- 识别剪切位点的分组权重矩阵方法
- 2007年
- 提出识别剪切位点的分组权重矩阵方法.分组权重矩阵是一个子总体数未知的混合权重矩阵模型.为得到未知参数的极大似然估计,采用了EM方法,而子总体数是利用隙统计量确定的.作者给出了该方法的具体计算步骤.将该方法应用于人类和水稻基因组的供子和受子识别,并与现行的主要方法作了比较.结果表明,分组权重矩阵法的识别效果更为精确.
- 高绍根李国英郑伟谋
- 蛋白质三级结构预测算法综述被引量:13
- 2018年
- 了解蛋白质的三维结构对于认识蛋白质的功能有着重要意义.由于蛋白质结构测定的速度远远跟不上蛋白质序列测定的速度,因此使用计算技术依据蛋白质序列预测结构成为结构测定的有力补充.该文首先总结了蛋白质结构预测的3类基本方法,包括基于序列-序列联配的同源建模法、基于序列-结构联配的归范法以及基于最小化能量函数的从头预测法,并分析了其中的关键技术;进而总结了有代表性的蛋白质结构预测软件工具,然后通过对蛋白质结构预测CASP比赛结果的分析比较了各种方法的性能,并获得了如下结论:当待预测蛋白质与模板蛋白质序列等同度超过30%时,同源建模法能够产生高质量的预测结果,归范法中的远同源检测以及从头预测法中的能量函数设计是尚待突破的关键点;最后,该文总结分析了未来的发展趋势,并阐释了强序列信号"绑架"蛋白质构象生成的观点,即从整体来说,蛋白质序列与结构的关联关系并不显著,但其中某些特定的局部序列片段具有非常强的结构倾向性,这些强信号区域引导蛋白质的折叠过程,对这些强信号区域的认识将会有助于提升蛋白质结构预测算法的性能.
- 王超朱建伟朱建伟巩海娥张海仓卜东波
- 关键词:蛋白质结构同源建模能量函数动态规划线性规划
- 非线性动力学“看图识字”:实用符号动力学
- 郑伟谋
- 二维映射的实用符号动力学被引量:2
- 1995年
- 一维映射的衫符号已经臻于完备,二维映射的符号动力撑仍是研究前沿。本文综述二维符号动力学的基本概念,特别是符号序列的排序规则和允字条件,并简单介绍其对常策分方程的应用。
- 郝柏林郑伟谋
- 关键词:符号动力学二维映射常微分方程
- 量纲分析和量纲制被引量:3
- 2021年
- 物理定律不依赖于测量单位的选择。量纲分析探讨这种不变性及其后果和应用。无纲量为单位变换下的不变量,物理规律最终必然只能用无纲量表达。从一个问题中的物理变量可构造出的无纲量数要少于原始变量数,带来简化,构造的无纲量可更深刻反映物理量间的内在关系。量纲概念足够深刻,但方法足够简单,应该是物理训练的重要内容。文章阐述量纲分析的基本概念、原理及其应用,大部分内容来自文献,着重讨论量纲制及其与单位制的关系,企图厘正文献中的一些混乱。特别指出,仅就量纲分析操作而言,可以只用MLT量纲制。
- 郑伟谋
- 关键词:量纲量纲分析
- 蛋白质中残基远程相互作用预测算法研究综述被引量:6
- 2017年
- 蛋白质是由多个氨基酸残基顺序连接而成的长链.在天然状态下,蛋白质并不是无规则的自由状态,而是自发形成特定的空间结构,以执行其特定的生物学功能.驱动蛋白质形成特定空间结构的主要因素是残基间的非共价相互作用,包括疏水作用、静电相互作用、范德华力等.因此,对残基之间远程相互作用的准确预测将有助于对蛋白质空间结构的预测,进而有助于对蛋白质生物学功能的了解.在蛋白质进化过程,有相互作用残基对之间存在一种"共进化"模式,即当一个残基发生变异时,与其有相互作用的残基也要发生相应的变异,以维持相互作用,进而维持整体空间结构以及生物学功能.基于上述生物学观察,研究者开发了多个统计模型和算法以预测残基对之间的相互作用:1)概述残基之间远程相互作用的两大类基本预测算法,包括无监督学习方法和监督学习方法;2)使用蛋白质结构预测CASP比赛结果来客观比较上述各类算法的性能,分析各个算法的特点和优势;3)从生物学观察和统计模型2个角度分析总结了未来的发展趋势.
- 张海仓高玉娟邓明华郑伟谋卜东波
- 关键词:图模型
- 实用符号动力学被引量:24
- 1990年
- 本文是为物理工作者和工程人员而写的一篇综述,介绍一维映射符号动力学的最新进展,及其在研究非线性系统周期和混沌运动中的应用。
- 郑伟谋郝柏林
- 关键词:符号动力学动力学
- 关于统计力学的基本原理被引量:1
- 2018年
- 文章简要讨论有关统计力学基本原理的几个问题,包括正则系综理论、系综分布函数的支集、与热力学的对应、不可逆性及分布函数的时间演化。
- 郑伟谋
- 关键词:统计力学热力学不可逆性
- 科学出版中的道德行为国际准则(提交国际纯粹与应用物理联合会备用)被引量:1
- 2004年
- 为了给科学出版道德行为提供一个共同的国际准绳并建议在不端行为发生时的适当应对方式,特向科学出版业所涉及各方提出以下准则.
- 刘寄星郑伟谋
- 关键词:科学出版道德行为处罚方式
- 关于量子力学的基本原理被引量:1
- 2020年
- 文章抽选关于量子力学基本原理的几个题目,包括量子力学与经典物理学的对比、量子概念的产生、薛定谔方程的出现、全同性原理和量子路径积分等,作些说明。目的在于激发读者思考量子力学的本质在哪里。
- 郑伟谋
- 关键词:量子力学热辐射薛定谔方程