贾琳
- 作品数：9 被引量：17H指数：2
- 供职机构：安徽农业大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：安徽省高校省级自然科学研究项目安徽省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学化学工程更多>>
- 草莓镶脉病毒(SVBV)ORFⅠ基因的克隆及序列分析
- 2012年
- 用CTAB法从感染草莓镶脉病毒(SVBV)的草莓叶片中提取总DNA,设计特异性引物扩增含有SVBVORFⅠ的片段,克隆并测序。序列分析表明,该片段全长1 033个核苷酸,其中包含的ORFⅠ全长987个核苷酸,编码328个氨基酸。结果表明:将其与花椰菜花叶病毒属其他成员的ORFⅠ序列相比较,中国SVBVORFⅠ与美国SVBV ORFⅠ序列相似性最高,达88.3%。进一步构建SVBV及其同属其他成员ORFⅠ的系统关系树,结果显示:中国SVBV ORFⅠ与美国SVBV ORFⅠ单独形成1个亚分支,说明来源于草莓的2个SVBV亲缘关系最近。
- 贾琳倪方锐李瑞蒋磊丁菲江彤
- 关键词：草莓镶脉病毒克隆
- 草莓镶脉病毒(SVBV)ORF Ⅵ基因的克隆及蛋白特性分析被引量：2
- 2011年
- 用CTAB法从感染草莓镶脉病毒(strawberry vein banding virus,SVBV)的草莓叶片中提取总DNA,设计特异性引物扩增SVBV ORF Ⅵ基因的全长片段,进行克隆并测序.序列分析表明SVBV ORF Ⅵ基因完整序列全长1 557bp,编码518个氨基酸.将其与SVBV美国分离物以及花椰菜花叶病毒属其他成员的ORF Ⅵ基因相比较,结果表明SVBV中国分离物ORF Ⅵ基因与SVBV美国分离物ORF Ⅵ基因核苷酸序列相似性最高,达84.5%;而与花椰菜花叶病毒属其他成员的ORF Ⅵ基因序列相似性均较低,仅为23.7%～27.9%.构建SVBV及其同属其他成员ORF Ⅵ基因的系统关系树,结果显示SVBV中国分离物与SVBV美国分离物单独形成1个分支,说明来源于草莓的2个SVBV亲缘关系最近,而与其同属其他成员的亲缘关系均较远.生物信息学分析表明SVBVORF Ⅵ基因表达的P6蛋白序列含有多种蛋白激酶磷酸化位点,其二级结构N端是1个α-螺旋富集区.该研究将为进一步研究P6蛋白的功能提供理论依据.
- 李瑞倪方锐贾琳蒋磊江彤
- 关键词：草莓镶脉病毒ORF克隆
- 草莓镶脉病毒(SVBV)启动子的克隆及序列分析被引量：1
- 2011年
- 【目的】对草莓镶脉病毒(SVBV)启动子进行序列测定和分析,为进一步研究该启动子稳定表达活性、表达类型及驱动外源基因稳定表达提供理论依据。【方法】用CTAB法从感染SVBV的草莓叶片中提取总DNA,设计特异性引物扩增SVBV启动子,克隆并测序。将SVBV启动子与花椰菜花叶病毒属其他成员的启动子核苷酸序列进行比较,并构建其系统关系树,再用PlantCARE软件分析SVBV启动子序列中的各个作用元件。【结果】获得全长为1017 bp的SVBV启动子。序列比列表明,本研究构建的中国SVBV启动子与美国SVBV启动子序列相似性最高,达77.29%。从构建的系统关系树可以看出,中国SVBV启动子与美国SVBV启动子单独聚成一个亚分支,说明来源于草莓的2个SVBV启动子亲缘关系最近。另外,SVBV启动子和花椰菜花叶病毒(CaMV)启动子亲缘关系虽然相对较近,但二者序列相似性较低,说明SVBV启动子与CaMV 35 S启动子的结构差异较大。进一步分析表明,SVBV启动子除了具有一般植物启动子的典型作用元件TATA-box和CAAT-box外,还具有一些与组织特异性表达或诱导表达相关的调节因子。【结论】SVBV启动子具有多种转录顺式作用元件,可能是一个在双子叶植物中具有较强驱动活性的组成型启动子。
- 倪方锐李瑞李爽贾琳蒋磊宋培培江彤
- 关键词：草莓镶脉病毒启动子克隆
- 漆树炭疽病病原鉴定及其生物学特性研究被引量：7
- 2010年
- 为了明确漆树炭疽菌的种类及其病原菌生长特性,此研究采集感染炭疽病的漆树病叶,组织分离得到病原菌纯培养,根据病原菌的形态、培养特征、致病性和寄主范围将其鉴定为胶孢炭疽Colletotrichum gloeosporioides(Penz.)Sacc.。进一步研究其生物学特性发现,漆树炭疽菌菌丝生长与时间呈直线相关,菌丝在10～35℃范围内均能生长,生长最适温度为25～28℃,分生孢子致死温度为48℃,分生孢子在相对湿度达到90%时才能萌发,连续光照可以促进菌丝生长量和产孢量的增加,菌丝在pH3～12范围内均能生长,生长最适pH为6.0。漆树炭疽菌对多种碳、氮源都能利用,以葡萄糖、果糖为碳源以及以天门冬酰胺、丙氨酸为氮源时,其菌丝生长最佳。
- 江正君贾琳蒋磊李瑞檀根甲江彤
- 关键词：胶孢炭疽菌生物学特性
- 水稻条纹病毒安徽分离物CP基因的克隆及序列分析被引量：1
- 2010年
- 采集安徽庐江水稻条纹叶枯病感病稻株,提取病叶总RNA。设计特异性引物进行RT-PCR扩增,获得水稻条纹病毒安徽分离物(RSV-AH)的RNA3部分片段,克隆并测序。序列分析表明,该片段全长1 051个核苷酸,其中包含的CP基因全长969个核苷酸,编码322个氨基酸。将RSV安徽分离物CP基因(AH-CP)与其它来源的RSVCP基因进行核甘酸序列相似性比较,结果表明,安徽庐江的RSVCP基因与江苏洪泽的RSVCP基因序列相似性最高,达99.3%。进一步构建RSVCP基因系统关系树,发现安徽庐江的RSVCP基因同样与江苏洪泽的RSVCP基因亲缘关系最近。
- 丁菲檀根甲贾琳宋培培江彤
- 关键词：水稻条纹病毒CP基因克隆
- 安徽淮北番茄曲叶病的病原鉴定初报被引量：6
- 2010年
- 采用分子手段鉴定了安徽淮北番茄曲叶病的病原。从安徽淮北番茄温室采集番茄叶片样本,用CTAB法从番茄叶片中提取总DNA。利用简并引物PA、PB进行PCR扩增,从大部分样本中扩增出双生病毒500 bp特异性条带。将扩增片段克隆并测序,该片段序列全长541 bp,与我国报道的番茄黄化曲叶病毒（TYLCV）各个分离物序列相似性均很高,达到95.9%~99.4%,可以初步明确侵染安徽淮北番茄的双生病毒为番茄黄化曲叶病毒（TYL-CV）。安徽淮北TYLCV 500 bp片段序列与山东TYLCV相似性最高,达99.4%,而且从构建的系统关系树也可以看出,安徽淮北TYLCV与山东TYLCV的亲缘关系最近,推测安徽淮北番茄黄化曲叶病毒（TYLCV）可能来源于山东。
- 丁菲王前蒋磊李瑞贾琳江彤
- 关键词：番茄
- 草莓镶脉病毒编码的致病相关蛋白鉴定
- 草莓镶脉病毒(Strawberry vein banding virus,SVBV)属于花椰菜花叶病毒科、花椰菜花叶病毒属(Caulimovirus).感染SVBV的弗吉尼亚草莓(Fragaria virginiana)...
- 邓竹根贾琳江彤
- 关键词：草莓镶脉病毒致病机制
- 沉默抑制子CMV 2b基因的克隆及其反向重复植物表达载体的构建被引量：1
- 2010年
- 从安徽亳州采集表现明显CMV症状的烟草样本,取ELISA检测阳性反应最强的样本提取总RNA。设计特异性引物扩增CMV RNA2部分片段,克隆并测序。其中包含的2b基因全长336个核苷酸,编码111个氨基酸。将来源于安徽烟草的CMV 2b基因与其它CMV 2b基因进行序列比对,结果表明,来源于安徽烟草的CMV2b基因与来源于韩国的2b基因AF033667的核苷酸序列相似性最高,达98.8%。构建2b基因系统关系树,也表明来源于安徽烟草的CMV 2b基因与AF033667亲缘关系最近。以安徽CMV 2b为模板,分别扩增大小约为300 bp的正向片段CMV 2b(r)和反向片段CMV 2b(i)。先后将反向片段CMV 2b(i)和正向片段CMV 2b(r)分别插入载体pSK-In所含intron两侧,获得重组质粒pSK-2b(r)-In-2b(i)。再将含intron的正反向片段插入pBIN438,最终得到含CMV 2b部分序列反向重复的植物表达载体pBIN-2b(r)-In-2b(i)。
- 宋培培李爽檀根甲贾琳丁菲江彤
- 关键词：CMV
- P6蛋白在草莓镶脉病毒致病过程中的功能研究
- 植物病毒致病性的强弱往往与其基因组编码的症状决定因子密切相关，即症状决定因子能够协助该病毒成功侵染寄主，使寄主呈现发病症状甚至死亡。本研究克隆了草莓镶脉病毒（SVBV）中国分离物P6基因，以病毒载体携带P6基因或P6突变...
- 贾琳
- 关键词：草莓镶脉病毒致病机制分子检测
- 文献传递
