胡皝 作品数:4 被引量:50 H指数:2 供职机构: 湖南农业大学 更多>> 发文基金: 湖南省“十一五”重大科技专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
超级杂交稻亲本株1S TIR1 cDNA的克隆与生物信息学分析 超级杂交稻是我国重要的粮食作物之一,以袁隆平院士为代表的我国科学家正在为实现2015年达到13.5t·hm的产量目标而奋斗。生长素是最早被发现的一类植物激素,参与调控植物生长和发育的许多方面。水稻中生长素作用机制的研究对... 胡皝关键词:生长素受体 生物信息学 超级杂交稻 文献传递 超级杂交水稻TIR1类似基因cDNA的克隆与生物信息学分析 被引量:7 2008年 生长素受体TIR1通过形成SCFTIR1复合体与生长素直接结合,即为Aux/IAA在26S蛋白酶体降解过程中的关键蛋白质。在Blast检索和生物信息学分析的基础上设计特异引物,以超级杂交水稻(Oryza sativa)亲本株1S为材料,通过RT-PCR扩增并经T-A克隆后测序,获得一条长度为2219bp的序列,其开放阅读框长度为1764bp,编码含587个氨基酸残基的肽链。该序列经生物信息学分析发现,其与拟南芥TIR1相似性为77%,同样具有2个保守的结构域,即F-box和亮氨酸富集重复区域(LRR),且都不具有跨膜结构域和信号肽。该cDNA序列命名为OsTIR1。 黄志刚 胡皝 赵玄之 王若仲 萧浪涛关键词:生长素受体 生物信息学 超级杂交水稻 超级杂交稻母本OsCHLH cDNA的生物信息学分析与克隆 2009年 通过生物信息学分析得到正确的水稻镁离子螯合酶H亚基(Mg-chelatase H subunit,CHLH)的cDNA。以超级杂交稻母本株1S为材料提取总RNA,并反转录成cDNA,用得到的序列设计特异引物,经PCR扩增出株1ScDNA片段,cDNA片段经T-A克隆后进行测序,获得一条长1350bp序列。提交NCBI的GenBank数据库后接收,登录号为EU569725。 赵玄之 胡皝 黄志刚 王若仲 萧浪涛关键词:脱落酸 生物信息学分析 生物信息学在新基因全长cDNA电子克隆中的应用 被引量:43 2007年 新基因全长cDNA序列的获得常常是生物学工作者面临的难题,电子克隆是利用生物信息学手段得到新基因全长cDNA序列的新方法。介绍了电子克隆的方法及其生物信息学在其间的具体应用,并概述了一些生物信息学在序列分析中的应用。 胡皝 萧浪涛关键词:生物信息学 电子克隆 全长CDNA