石运娇
- 作品数：4 被引量：5H指数：1
- 供职机构：河北农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：河北省自然科学基金国家自然科学基金转基因生物新品种培育专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- PEG11基因在自然繁殖牛和体细胞核移植牛中印记及DNA甲基化分析
- 体细胞核移植技术(somatic cell nuclear transfer，SCNT)，又称体细胞克隆技术，在医疗、农业及畜牧业等诸多领域有重要的应用价值。尽管体细胞核移植已经在多种哺乳动物中获得成功，但克隆效率仍然很...
- 石运娇
- 关键词：体细胞核移植技术
- 牛PEG11基因生物信息学分析
- 2013年
- 采用生物信息学方法对牛PEG11基因进行分析,为进一步揭示该基因生物学功能和其分子调控机理奠定基础。选取6种哺乳动物PEG11基因的CDS序列作为研究对象,进化分析表明:包括牛、羊、小鼠、熊猫、猪和人在内的6种哺乳动物间的遗传距离小于0.109,且牛与猪遗传距离最小,为0.036,与基因进化树分析结果一致。CpG岛在线软件预测显示,在牛中该基因上游5kb内没有CpG岛。启动子在线软件预测和转录因子分析相结合显示,启动子可能位于该基因5′端上游2 181～2 131bp处,此区域包括大量潜在转录因子结合位点,并在2 173bp处存在一个TATA框。蛋白质在线软件分析表明,PEG11基因编码一种螺旋形跨膜蛋白质,有α-螺旋、β-转角和自由卷曲3种二级结构。
- 石运娇苏红张坤李冬杰李世杰
- 关键词：生物信息学
- 牛Meg9基因序列及结构的预测与分析
- 2012年
- 应用生物信息学方法对牛Meg9基因的序列进行预测及分析,发现牛Meg9基因共含有3个外显子,存在3种可变剪切体。与鼠、人和羊序列进行相似性分析,发现牛Meg9基因与绵羊相似性最高,为92%。应用在线软件对牛Meg9基因启动子区及转录因子结合位点进行预测,发现启动子可能位于5′侧翼区1 903～1 953bp处,有16种转录因子结合位点。CpG Island在线软件分析发现牛Meg9基因5′侧翼区和内含子1处共有3个CpG岛。以上研究结果将为研究牛Meg9基因的功能及印记的分子机理奠定基础。
- 张坤苏红石运娇李冬杰李世杰
- 关键词：启动子CPG岛
- PEG11基因在体细胞核移植牛中印迹和DNA甲基化状态分析被引量：5
- 2016年
- 为了分析PEG11基因在体细胞核移植(somatic cell nuclear transfer,SCNT)牛中的印记以及重编程状态,本研究应用RT-PCR产物直接测序法对PEG11基因在自然繁殖牛和新生死亡SCNT牛7个组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪)中的表达进行了分析。结果发现PEG11基因在自然繁殖牛的7个组织中均为单等位基因表达,表明PEG11基因在牛中是印记的;在SCNT牛肺脏中PEG11基因为双等位基因表达,而在其余6个组织中为单等位基因表达。进而用亚硫酸氢盐测序法分析自然繁殖牛和SCNT牛肺脏PEG11基因中54CpGs位点的甲基化状态,发现PEG11基因在SCNT牛肺脏中呈现与自然繁殖牛相似的高甲基化状态(97.26%),推测PEG11基因在新生死亡SCNT牛肺脏中印记紊乱可能是导致SCNT牛肺脏发育缺陷的原因之一,PEG11基因内部CGIs的甲基化不参与调控PEG11基因的基因组印记。
- 张明月杨文志石运娇张萃陈玮娜崔亚丽张巍巍李宁李世杰
- 关键词：DNA甲基化器官缺损
