杨丽
- 作品数：35 被引量：63H指数：5
- 供职机构：宁夏医科大学基础医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金宁夏回族自治区自然科学基金宁夏回族自治区银川市科技攻关项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学社会学更多>>
- 利福平对耻垢分枝杆菌基因的调控
- 2021年
- 目的探讨利福平(RIF)对耻垢分枝杆菌(MS MC2155)转录组表达的影响。方法以RIF的1/2最小抑菌浓度(MIC)处理的MS MC2155菌株为实验组,用相同稀释倍数的DMSO处理MS MC2155菌株作为对照组,于摇床内37℃培养72 h后,用Trizol试剂提取各组MS MC2155的总RNA,通过Illumina Hiseq 3000测序平台进行全转录组测序,采用Bowtie 2软件比对测序结果,用MS MC2155标准菌株的参考基因组对样本基因进行注释,通过倍数差异分析,筛选获得RIF作用前后的差异基因(different expression gene,DEG),最后用GO及KEGG数据库注释上述获得的DEGs。结果DEG分析显示,在RIF处理后发现了832个DEGs(P≤0.05,|log2FC|≥1),其中457个基因上调(54.93%),375个基因下调(45.07%)。GO富集分析结果显示,DEGs(nuoF、nuoB和sigM)主要涉及氧化还原酶活性、呼吸链复合物等细胞与分子方面的功能,以及外来生物刺激、共生体调节等生物学过程。KEGG富集分析显示,DEGs(cspA、sigM、nrdB、gmk、nuoF、nuoB和mysB)主要集中在万古霉素耐药、氧化磷酸化、核苷酸代谢和酪氨酸代谢等通路。STRING分析结果显示,共有371个基因编码的蛋白质存在相互作用,其中处于中心节点的蛋白的基因包括mysB、pheT和guaB。结论经转录组测序发现,RIF既能影响MS MC2155中sigM、mysB等RNA合成基因的表达;又能抑制其nrdB、gmk和guaB DNA合成基因的表达,进而阻断其DNA和蛋白的合成。
- 刘通杨丽陈赢唐静林源马国荣杨延辉
- 关键词：利福平耻垢分枝杆菌转录组差异基因结核病
- 全转录组揭示化合物M6对谷氨酸棒状杆菌基因表达的影响
- 2022年
- 目的探究化合物M6所干预的谷氨酸棒状杆菌(Cg)基因表达网络,以期为深入研究M6的抗菌作用机制提供候选基因。方法利用Chemdraw 18.0软件展示M6的分子结构,二倍稀释法测定M6在多种微生物中的抗菌谱;模式菌选用与MTB细胞壁相似的Cg,刃天青法测定M6的最低抑菌浓度(MIC);用转录组测序分析M6对Cg基因表达的影响,实验组和对照组分别用1/2 MIC浓度的M6和相同浓度的DMSO处理Cg 24 h,每组设3次生物学重复;Trizol法提取总RNA并进行转录组测序;利用Bewtie 2软件分析差异表达基因(DEGs),用GO功能和KEGG通路分析DEGs富集及功能,STRING分析DEGs表达蛋白质之间的互作关系。结果大部分G^(-)菌和真菌对M6耐受,G^(+)菌对M6较敏感,特别是MTB最敏感(MIC为0.0625μg·mL-1);分子结构显示M6具备有限的分子构象。选用对M6敏感的Cg(MIC为0.5μg·mL^(-1))为模式菌进行后期的转录组测序,测序结果显示,M6干预使Cg差异表达的mRNA共452个(P≤0.05,|log2FC|≥1.0),其中346个高表达,106个低表达;差异倍数4倍以上的基因有40个,包括高表达的ctpA、ftn、dps、cmr、trxC和clpB等34个基因及6个低表达基因bioB、bioA、gip、hI_0095、DNA81和DNA345。GO功能富集分析显示,DEGs主要富集在核糖体结构组分、r RNA结合和核蛋白复合体等与核糖体相关的功能途径。KEGG通路功能分析显示,核糖体及阳离子抗菌肽耐药性通路中的DEGs富集程度最显著,以rplL、rplJ、rplQ、rpmD、ftn、dps、cmr、trxC、bioA和ugpE等差异性最大。在蛋白互作网络图中,位于中心节点的蛋白质所对应的基因分别为rplQ、rplJ、rspD、rpmD、rpoA、rplE和rplL等。结论M6具备显著的抗MTB活性。在调控Cg的基因表达方面,主要影响了Cg的核糖体及阳离子抗菌肽耐药性通路相关多个基因的表达。
- 杨丽唐静李晓雨梁彤秦闫燕林源杨延辉
- 关键词：转录组结核分枝杆菌谷氨酸棒状杆菌核糖体
- GSK3β抑制剂氯化锂对大鼠前列腺增生的影响
- 2014年
- 目的探讨GSK3β抑制剂氯化锂在大鼠前列腺增生治疗中的作用。方法通过皮下注射丙酸睾酮的方法复制前列腺增生模型,建模大鼠随机分成3组:氯化锂高剂量治疗组、低剂量治疗组和模型对照组,另设正常对照组。高剂量和低剂量治疗组分别以20mg/(kg·d)、10mg(kg·d)的剂量腹腔注射氯化锂,连续给药30d。称量各组大鼠前列腺组织湿重、体积,计算前列腺指数;酶联免疫法测定血清中睾酮(T)、雌激素(E2)和性激素结合球蛋白(SHBG)含量。结果氯化锂治疗组的前列腺湿重、体积和脏器系数较模型对照组显著降低(P<0.01);氯化锂治疗组的T、E2和SHBG水平也较模型对照组降低(P<0.05)。结论 GSK3β抑制剂氯化锂对前列腺增生具有一定抑制作用。
- 楚元奎杨丽廖国玲
- 关键词：前列腺增生氯化锂
- 犬细小病毒宁夏株的分离与鉴定
- 2015年
- 本试验采集宁夏地区疑似犬细小病毒感染病犬的粪便拭子,经过预处理后同步接种胎猫肾细胞(FK81),盲传3代后发现FK81细胞出现明显的细胞毒性改变(CPE)。冻融收获病毒后,对分离出来的病毒进行电镜观察、间接免疫荧光试验(IFA)检测、特异性PCR鉴定及VP2全基因序列扩增分析,成功分离培养出1株犬细小病毒(CPV)。
- 杨丽段相国刘宏鹏徐广贤郭文伟张议心赵瑾
- 关键词：犬细小病毒VP2基因
- 多功能液氮快速冷冻熏蒸装置
- 一种多功能液氮快速冷冻熏蒸装置，属于熏蒸装置技术领域，包括液氮罐及设置在液氮罐内的液氮罐提蓝，所述液氮罐提篮包括提升杆及冻存装置，所述冻存装置与所述提升杆活动连接，所述冻存装置包括存放组织样本的上盒、浮力板及存放冻存管的...
- 丛广志杨文娟杨丽
- 文献传递
- miR-485-5p靶向氧连接的N-乙酰氨基葡萄糖转移酶抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭
- 2024年
- 前列腺癌是男性生殖系统最常见的恶性肿瘤。尽管采用雄激素剥夺疗法等策略在一定程度上对治疗前列腺癌有效,但大多数患者最终会进展为临床尚无有效治疗手段的去势抵抗性前列腺癌。因此,寻找新的更加有效的前列腺癌治疗靶点就显得尤为关键。多项研究表明,微RNA(microRNAs,miRNAs)的异常表达与肿瘤的发生相关。已有报道显示,miRNA-485-5p(miR-485-5p)在多种肿瘤中发挥抑癌作用,但其在前列腺癌中的作用在较大程度上仍未可知。本研究旨在探究miR-485-5p在前列腺癌细胞增殖、迁移与侵袭的作用与机制。生物信息学预测和qRT-PCR检测发现,miR-485-5p在前列腺癌中表达下调。平板克隆形成实验、Transwell实验和划痕愈合实验证明,转染miR-485-5p模拟物显著抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭。生物信息学预测、双荧光素酶报告法、Western印迹和qRT-PCR检测证实,氧连接的N-乙酰氨基葡萄糖转移酶(O-linked N-acetylglucosamine transferase,OGT)是miR-485-5p的一个下游直接靶标。进一步的分析和检测显示,OGT在前列腺癌中呈高表达,转染OGT的siRNA能够显著抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭,同时有效逆转转染miR-485-5p抑制物所发挥的促癌作用。综上所述,miR-485-5p可以通过负向调控OGT进而抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭。本研究结果有助于进一步阐释miR-485-5p在前列腺癌中发生发展的作用和机制,可为寻找前列腺癌的治疗靶点提供实验依据。
- 胡东来赵梓岐李元杨丽雷艳丽楚元奎
- 关键词：前列腺癌迁移
- miR-3064-5p在制备靶向前列腺癌组织基因CTGF的药物中的应用
- 一种miR‑3064‑5p在制备靶向前列腺癌组织基因CTGF的药物中的应用，属于生物制药技术领域。本发明通过试验证实了miR‑3064‑5p与CTGF基因间存在结合位点，且过表达miR‑3064‑5p可降低PCa细胞中C...
- 楚元奎杨晓莹胡东来赵梓岐李元杨丽
- 大鼠Tribble3基因真核表达载体的构建与鉴定
- 2014年
- 目的:构建并鉴定大鼠Tribble3基因的真核表达载体。方法:根据Gen Bank数据库提供的基因序列,设计合成大鼠Tribble3基因CDS扩增引物,RT-PCR法获得目的基因,T载体连接测序后,构建p EGFP-N1-Tribble3真核表达载体,双酶切鉴定。结果:RT-PCR扩增大鼠Tribble3基因片段为1047bp,与预期大小相符;测序结果表明该目的基因序列与Gen Bank公布序列一致;构建的重组质粒p EGFP-N1-Tribble3双酶切鉴定正确。结论:成功构建了大鼠Tribble3基因的真核表达载体。
- 楚元奎杨丽于欣李宗吉刘学英
- 基于CRISPR-Cas技术检测结核分枝杆菌利福平耐药性点突变的crRNA
- 本发明公开了一种基于CRISPR‑Cas技术检测结核分枝杆菌利福平耐药性点突变的crRNA，本发明以MDR‑TB利福平耐药性点突变(rpoBL378D)为检测靶位点，设计并合成靶向该目的序列的crRNA；构建基于CRIS...
- 杨延辉王大军杨丽唐静李晓雨马凯杨玉玛王琦林源马国荣马虹姚青黄凌张炜郭若莹赵艺卿
- 文献传递
- miR-1247-5p对Smad2基因的靶向调控作用
- 2016年
- 目的利用miR-1247-5p过表达模拟物mimics,研究miR-1247-5p对TGF-β信号通路中关键蛋白Smad2的靶向调控作用。方法合成模拟miR-1247-5p过表达的模拟物mimics,及抑制miR-1247-5p表达的抑制物inhibitors;同时构建与miR-1247-5p互补靶基因Smad2的3'非翻译区,将其克隆到线性化的Report荧光报告载体中。将测序鉴定阳性的report-Smad2 3'-UTR重组质粒,与miR-1247-5p的mimics/inhibitors共转染至HEK-293T细胞,通过relative luciferase activity实验验证靶向关系,并通过Western blot实验进一步检测Smad2蛋白表达水平。结果成功构建report-Smad2 3'-UTR重组质粒,Western blot实验表明转染miR-1247-5p mimics组中Smad2蛋白表达下调(P<0.05);而转染miR-1247-5p inhibitors组中,Smad2蛋白表达上调(P<0.05)。结论证实miR-1247-5p直接靶向TGF-β信号通路中关键蛋白Smad2的表达,在蛋白水平对其进行调控,为进一步研究miRNA在细胞通路中的调控作用提供了依据。
- 张议心王利新徐广贤杨丽赵瑾郭文伟刘新兰
- 关键词：TGF-Β信号通路SMAD2基因肿瘤
