曹蕾
- 作品数：50 被引量：228H指数：9
- 供职机构：南方医科大学生物技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广州市科技计划项目广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术医药卫生文化科学自然科学总论更多>>
- 基于图像块匹配的肾小球基底膜自动分割被引量：1
- 2016年
- 为了实现肾小球基底膜的自动分割,提出了一种基于图像块匹配策略的图像自动分割方法。首先,针对肾小球基底膜的特点,将块匹配算法的搜索范围从一幅参考图像扩展到多幅参考图像,并采用了一种改进的搜索方式提高匹配效率;然后,开始搜索最优的图像匹配块;最后,提取最优匹配块对应的标记匹配块进行加权,重组为肾小球基底膜的初始分割结果,经形态学处理后即可得到基底膜最终的分割结果。在采集到的肾小球透射电(TEM)图像上进行测试,算法分割结果与病理专家手动分割结果之间的Jaccard相似系数最低为83%,最高为95%。实验结果表明所提方法能取得精度较高的分割结果。
- 李创权路艳蒙李穆李明强李然曹蕾
- 关键词：图像分割块匹配透射电镜肾小球基底膜
- 肾小球超微结构分割算法:基于区域级对比学习的深度模型
- 2023年
- 目的为了提高深度模型对电子显微镜图像中肾小球超微结构的分割性能,提出了一种基于超微结构语义相似性的区域级自监督对比学习方法USRegCon。方法USRegCon使用大量无标记数据对模型进行预训练,该预训练过程包括3个步骤:(1)模型对图像中超微结构信息进行编码和解码,并根据超微结构的语义相似性自适应地将图像划分为多个区域;(2)依据所划分的区域,使用区域池化操作提取出每个区域的一阶灰度区域表示和深度语义区域表示;(3)对于一阶灰度区域表示,构建了灰度损失函数,目标为最小化区域内的灰度差异和最大化区域间的灰度差异。对于深度语义区域表示,构建了语义损失函数,目标为最大化表示空间中正区域对的相似性和负区域对的差异性。这两个损失函数将联合对模型进行预训练。结果基于私有数据集GlomEM,USRegCon在肾小球滤过屏障三层超微结构的分割任务中,对基底膜、内皮细胞和足细胞均获得了良好的分割结果,Dice系数分别为85.69±0.13%、74.59±0.13%和78.57±0.16%。该结果优于现有的多种图像级、像素级和区域级自监督对比学习方法,并逼近基于大规模标记数据集ImageNet的全监督预训练方法。结论USRegCon促进模型从大量无标记数据中学习有益的区域表示,弥补了标记数据不足的缺陷,提升了模型对肾小球超微结构的识别和边缘分割能力。
- 林国钰张桢泰路艳蒙耿舰周志涛路利军曹蕾
- 关键词：电子显微镜
- 非计算机专业计算机基础课程教改比对的设计与实施
- 2007年
- 目的研究医学本科生计算机基础课程教学改革方案;方法精心设计了一个教改比对方案,通过对比和实际教学,从中就教学内容、教学模式、素质培养和教学评价等方面提出了改革思路。结果采用新的教学方法,教学效果整体有提高;结论医学本科生的计算机基础课程的教学方法、内容等都必须根据实际情况改革和调整。
- 张煜曹蕾陈浩周猛
- 关键词：医学本科生计算机基础教改
- 一种面向服务的软件Agent设计模型被引量：1
- 2008年
- 软件Agent的设计实现对于解决网络分布环境中的很多应用问题都非常重要。本文在基于事件处理的概念级软件Agent设计模型的基础上,针对Web服务的特殊要求,做出了相应的模型改进。首先对三个知识库进行了细化,然后给出了面向服务的软件Agent内部决策算法过程;考虑到Web服务对Agent协同的要求,还提供了软件Agent必须遵守的交互参考协议。
- 曹蕾齐治昌张煜陈武凡
- 关键词：软件AGENT
- 基于弹性配准的肺4D-CT中间相位图像重建被引量：2
- 2015年
- 针对肺四维计算机断层摄影(4D-CT)数据获取时辐射剂量高的缺点,提出了一种基于弹性配准的肺4DCT中间相位图像重建方法,利用已知的两个特殊呼吸相位图像,重建出其他中间呼吸相位图像。其具体过程是:选择呼吸周期内的两个相位图像分别作为参考图像和浮动图像,首先用Active Demons配准方法估计出两个相位图像间的运动位移场;然后根据呼吸运动过程的线性假设,相应地求出浮动图像到中间相位图像的运动位移,继而重建出中间相位图像。实验结果表明,重建出的中间相位图像不仅在视觉上与真实图像非常接近,而且用标记点方法量化评价的平均误差也在3 mm内。所提基于弹性配准的重建方法能较准确地重建出肺4D-CT中间相位图像。
- 耿丹丹王婷婷曹蕾张煜
- 基于血管增强分割的三维肺结节自动检测被引量：2
- 2014年
- 在肺结节检测过程中,与肺结节灰度相似的复杂肺部血管结构是干扰肺结节准确检测的一个重要因素。针对这一问题,首先利用基于Hessian矩阵特征值的Frangi多尺度滤波器将大小、形态各异的肺血管结构增强,然后采用模糊C-均值聚类方法将血管分割出来,最后通过去除肺血管,间接得到肺结节图像。实验结果表明,该方法能有效降低血管对肺结节检测的影响,提高肺结节的检测精度。
- 潘烁张煜王凯高绍英曹蕾
- 关键词：FCM
- 基于LDA和SVM的肺结节CT图像自动检测与诊断被引量：9
- 2011年
- 在已实现疑似肺结节图像分割的基础上,提取肺结节图像多维特征,应用LDA和SVM统计分类器,通过对大量样本的训练,实现对肺结节CT图像的自动检测和诊断。实验结果表明该检测和诊断方法达到了较好的分类效果,是适用于CAD系统的实用方法。
- 曹蕾黎维娟冯前进
- 关键词：CADCT图像肺结节诊断
- 基于粒子滤波对肾小球TEM图像的基底膜分割方法
- 本发明公开一种基于粒子滤波对肾小球TEM图像的基底膜分割方法，包括步骤：读取一张包含基底膜的肾小球TEM图像，确定初始化的粒子h<Sub>0</Sub>并设定其初始化权重w<Sub>0</Sub>，以此生成下一个状态的粒...
- 曹蕾李穆李创权
- 文献传递
- 基于自适应体窗结构分析的肺结节检测方法被引量：4
- 2014年
- 基于三维Hessian矩阵的肺结节检测方法具有很高的敏感性,却很难避免血管交叉区域产生假阳性。本文提出了一种基于自适应体窗结构分析的方法,首先利用体素的Hessian矩阵特征值设计结构系数分析其灰度分布特征;然后根据结构系数构建三维自适应体窗分析组织的局部结构特征;最后使用判别函数检测出结节。通过对17套真实肺部CT图像序列进行实验,结果表明本方法可以检测出不同大小和类型的30个结节,并有效减少了血管交叉区域产生的假阳性。结合自适应体窗的Hessian矩阵检测方法可以提高检测效率,减轻医生工作量,为肺结节后续的分割和治疗提供有力的支持。
- 王凯张煜刘哲星林炳权吴志强曹蕾
- 关键词：HESSIAN矩阵
- 医学影像学生Python课程设计及实践
- 2024年
- 研究医学影像学生Python课程的设计与实践。Python编程语言在医学影像学领域的应用日益广泛,然而当前以生物医学数据为主的教学往往未能满足医学影像学生的专业需求。为此,设计了以医学影像数据案例驱动的教学模式,并增加了数据展示与可视化和影像组学分析的小组创新项目训练。教学实践表明,学生对课程设计表现出了较高的学习兴趣,小组创新项目训练培养了学生的实践应用和问题解决能力。然而,仍需要进一步加强专业方向内容,提供更多实践机会,以满足学生的学习需求。
- 钟丽明郝立魏曹蕾阳维
- 关键词：医学影像数据展示
