张媛媛
- 作品数：65 被引量：328H指数：12
- 供职机构：北京地坛医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学文化科学更多>>
- 肠杆菌科菌株基因组水平上的遗传差异(ANI)及其在菌种鉴定上的应用
- 2013年
- 本研究探讨了高通量测序方法在肠杆菌科菌种鉴定中直接应用的可能性,第一次提出并验证了基因组平均遗传相似度(ANI)指标在肠杆菌科鉴定中的有效性,为该技术的进一步发展提供了数据积累。
- 张雯杜鹏程王海印于伟文张媛媛陈晨
- 关键词：肠杆菌基因组菌种鉴定
- 艾滋病患者感染新型隐球菌的MLST分型及临床特点分析被引量：2
- 2020年
- 目的了解艾滋病患者感染新型隐球菌的基因分型情况。方法收集我院50例艾滋病合并新型隐球菌感染患者的分离菌株,采用PCR测序的方法对分离的新型隐球菌的7个管家基因(CAP59、GPD1、LAC1、PLB1、SOD1、URA5和IGS1)进行PCR扩增和测序,将序列上传至Fungal MLST Database得到序列类型(sequence type,ST),最后通过BioNumerics 4.0软件对ST分型结果进行最小生成树分析。结果50例艾滋病患者中,88.0%(44/50)的为男性,其中31~50岁之间患者占56.0%(28/50),60%患者有中枢神经系统感染,从50例患者的不同部位分离出53株新型隐球菌,其MLST分型分析结果显示,共分离出9种基因型,81.1%(43/53)的菌株为ST5型,ST31和ST296分别有2株,ST63、ST289、ST295、ST298、ST324和ST337分别有1株。结论艾滋病患者感染新型隐球菌以男性为主,北京地区MLST基因分型主要是ST5型,为新型隐球菌的研究提供分子流行病学依据。
- 徐新民张媛媛杜鹏程李敏王慧珠王雅杰
- 关键词：艾滋病新型隐球菌
- EGFR-TKI药物所致皮肤不良反应治疗与护理对策研究进展
- 目前大量患者正在接受靶向药物治疗，发生皮肤的不良反应的几率也明显增多，大大影响了患者的生活质量和心理。为了减轻皮肤不良反应给患者带来的心理负担和提高患者的生活质量，本文从EGFR-TKI所致皮肤不良反应的发病率、发病机制...
- 张媛媛
- 关键词：非小细胞肺癌EGFR-TKI皮肤不良反应护理
- 应用SPOLIGO TYPING技术对吉林省结核分枝杆菌基因分型的研究
- 目的 使用间隔区寡核苷酸分型(SPOLIGO TYPING)对吉林省333株结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型.方法 收集吉林省内结核分枝杆菌临床分离株,应用SPO LIGO TYPING方法进行基因分型研究.基因聚类分...
- 杨修军万康林王艳华赵秀琴郭建华张媛媛王春生
- 关键词：结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸分型基因分型北京基因型
- 文献传递网络资源链接
- 基于16S rDNA数据库的细菌在线分类鉴定平台的构建被引量：4
- 2013年
- 目的利用且兼并简化现有16S rDNA基础数据库,建立可用于传染病预防控制及感染性疾病的临床诊疗的细菌快速分类的核糖体基因数据库,构建快速鉴定在线分析平台。方法收集整理已有的包括RDP、GenBank、SILVA、HOMD等国际公认、公开的16S rDNA数据库,进行整理、筛选和去冗余,重新构建16S rDNA数据库。利用生物信息学构建自动化分析流程,并利用先进的web 2.0、JAVAEE等技术开发设计数据库系统及网站,构建了自动化的在线细菌分类鉴定平台。结果通过核酸序列比较,将已公布的1 450 265条16S rDNA序列简化为具有代表性的96 138条序列,并构建了序列数据库。结合序列比较、序列聚类等生物信息方法,建立了基于web的快速检索系统(http://ssu.bioinfo-icdc.org)。结论通过构建基于16S rDNA序列的细菌分类鉴定在线分析平台,具有快速、简单、明确的特征,能够对病原菌进行快速、准确的分类学鉴定,有效提高传染病预防控制和感染性疾病临床诊疗中的病原菌鉴定和疫情溯源的速度,为及时实施有效治疗和控制措施赢得时间。
- 陈晨彭珂王海印杜鹏程张雯张媛媛于伟文
- 关键词：RDNA数据库
- 2株胞内分枝杆菌临床分离株的鉴定被引量：6
- 2010年
- 目的联合应用多种分子生物学技术进行分枝杆菌菌种鉴定。方法从经PNB、TCH鉴别培养基鉴定为结核分枝杆菌的临床分离菌株285株中选取6株,其中包括oxyR-ahpC基因间隔区检测时PCR产物分子量异常的2株和另外随机选择的PCR产物分子量正常者4株,采用H37Rv、鸟分枝杆菌95001和胞内分支杆菌95002做对照,PCR扩增oxyR-ahpC基因间隔区,对其产物进行测序和网上同源性(H37Rv、U18263、U71061)比对。同时,采用多位点PCR扩增和hsp65 PCR-限制性酶切片段长度多态性分析,从而判定分枝杆菌菌种类型。结果经PNB、TCH鉴别培养基鉴定初步判定为结核分枝杆菌的285株临床分离株中2株临床菌株oxyR-ahpC基因间隔区PCR产物大小约为1 000bp,DNA序列与胞内分枝杆菌同源性极高,达99%,而与同片段序列结核分枝杆菌H37Rv的差异大,同源性为84%。多位点PCR指纹显示为非分枝结核杆菌,hsp65 PCR-RLFP/RFLP指纹与95002一致。结论2株oxyR-ahpC基因间隔区PCR产物分子量异常的经PNB、TCH鉴别培养基鉴定为结核分枝杆菌的临床分离株确定为胞内分枝杆菌。多种分子生物学技术联合应用能够快速、简便、更准确地鉴定分枝杆菌菌种。
- 潘爱珍张媛媛王心赵秀芹万康林
- 关键词：分枝杆菌结核分枝杆菌菌种鉴定
- 诺卡氏菌研究进展被引量：40
- 2012年
- 目的诺卡氏菌是一种新发的人兽共患病病原,呈全球性分布,它能引起不同程度的人类疾病。近年来,病例报道明显增加,但大多数人对该菌不熟悉,本文就诺卡氏菌的分布、感染途径、致病性、分类及鉴定等做一综述。
- 张媛张媛媛李振军万康林
- 关键词：诺卡菌
- PCR技术在结核病诊断中的应用被引量：10
- 2005年
- 曹晓慧张媛媛万康林
- 关键词：结核病诊断PCR技术改良罗氏培养基BACT/ALERT结核菌素肺结核病人
- 结核分枝杆菌西安分离株北京家族基因型检测及其耐药相关性研究被引量：13
- 2008年
- 目的了解西安市结核分枝杆菌临床分离株的耐药情况及其与北京家族基因型(Beijing Family)的相关性,为有效防治结核病提供依据。方法对临床分离结核分枝杆菌采用绝对浓度法进行药物敏感性检测。间隔寡核苷酸分型(Spoli-gotyping)方法进行北京家族基因型鉴定。结果统计学分析采用χ2检验。结果104株结核分枝杆菌对4种一线抗结核药物,异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB),全部敏感的菌株为71株(68.3%);耐药菌株33株(31.7%),其中,单耐药菌株12株(11.5%),耐多药菌株21株(20.2%)。结核分枝杆菌对4种一线药物INH、RFP、SM和EMB的耐药率分别为24.04%(25/104)、18.69%(19/104)、16.34%(17/104)和2.88%(3/104)。104株结核分枝杆菌中北京家族基因型(BeijingFamily)占全部菌株的83.7%,非北京家族基因型占16.3%。87株北京家族基因型菌株中耐药菌株28株(32.18%),敏感菌株59株(67.82%),而17株非北京家族基因型菌株中耐药菌株5株(29.41%),敏感菌株为12株(70.59%)。经统计学分析其差异无统计学意义(χ2=0.05,P>0.05)。结论西安市分枝杆菌的耐药情况较为严重。结核分枝杆菌北京家族基因型与耐药性之间无明显相关性。
- 刘志广张选民张媛媛曾令城吕冰王西临赵秀芹杜新玲韩跃玲万康林
- 关键词：结核分枝杆菌基因分型
- 结核分枝杆菌多位点可变数目串联重复序列分型方法标准化操作程序的建立被引量：27
- 2008年
- 目的建立结核分枝杆菌多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）的标准化方法，评价该方法的分型能力、应用价值。方法选取15个位点，采用核酸提取、PCR和琼脂糖凝胶电泳等技术，结合BioNumerics（Version5．0）软件，对中国54株结核分枝杆菌临床分离株进行分型。结果确定标准化的MLVA方法，包括细菌分离培养、核酸提取、PCR、琼脂糖凝胶电泳等实验步骤及标化参数的相关数据分析软件的使用。VNTR位点确定为ETRA、ETRB、ETRC、ETRD、ETRE、MIRU10、MIRU16、MIRU23、MIRU26、MIRU27、MIRU39、MIRU40、Mtub21、Mtub30和Mtub39。结论建立MLVA标准化技术方案，该方法操作简便，分型鉴定能力及实验室间结果可比性强，便于网络化，有利于结核病流行中追溯传染源，分析流行趋势。
- 吕冰Christine Pourcel刘敬华董海燕张媛媛蒋毅刘志广赵秀芹万康林
- 关键词：结核分枝杆菌
