崔忠凯
- 作品数：23 被引量：91H指数：5
- 供职机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科委科技攻关项目中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 基于高通量测序的青石斑鱼基因组微卫星开发及评价被引量：9
- 2017年
- 本研究采用基因组高通量随机测序的方法对青石斑鱼(Epinephelus awoara)微卫星标记进行了发掘,结果共获得青石斑鱼(Epinephelus awoara)基因组原始数据2.860G。采用MISA(MIcroSAtellite)软件进行微卫星位点搜索,获得967 657条微卫星序列。随机选取了96条微卫星序列设计引物并利用8尾青石斑鱼个体进行多态性位点筛选,共获得60个具有多态的微卫星标记。利用其中16个微卫星标记对一个青石斑鱼亲鱼群体的种群遗传学特征进行评价,共检测到129个等位基因,单个标记的表观等位基因数(NA)分布范围为2~14,平均为7.167;表观杂合度(HO)分布范围为0.422~1.000,平均为0.678 6;期望杂合度(HE)分布范围为0.481~0.893,平均为0.676 8。有5个标记的等位基因频率不符合"哈迪-温伯格平衡",其中EAW-55596、EAW-21755、EAW-30334 3个标记表现为杂合子显著缺失(P<0.05),而EAW-33674和EAW-52520 2个标记表现为杂合子显著过剩(P<0.05)。连锁不平衡检测表明各位点间无连锁不平衡现象。多态信息含量(PIC)分布范围为0.362 3~0.872 2,平均PIC=0.639 7>0.5,说明该亲鱼群体的遗传多样性比较高。而这些微卫星标记将对于青石斑鱼的遗传变异分析、亲缘关系鉴定提供了技术支持,这也将为青石斑鱼的分子遗传育种奠定了基础。
- 高峰涛邵长伟崔忠凯王升鹏魏敏陈松林杨官品
- 关键词：青石斑鱼高通量测序微卫星标记多态性
- 大菱鲆受精卵显微注射技术的建立
- 2018年
- 本研究将100~300 pg含有肌肉特异表达启动子和绿色荧光蛋白(Green fluorescent protein,GFP)基因的重组质粒(smyd1:gfp)显微注射到大菱鲆(Scophthalmus maximus)受精卵动物极细胞中,通过细心培育,成功孵化出鱼苗约120尾。统计分析显示,显微注射后,大菱鲆胚胎存活率为4.8%。利用荧光显微镜观察大菱鲆胚胎及仔鱼,只在注射smyd1:gfp质粒的胚胎及仔鱼的肌肉中发现有绿色荧光。通过进一步PCR扩增检测,在注射的大菱鲆胚胎及仔鱼DNA中扩增出了GFP特异片段,大小约为340 bp。研究表明,本研究成功建立了大菱鲆显微注射技术,可为大菱鲆基因功能研究和遗传育种奠定基础。
- 崔忠凯王倩刘新富孟振陈松林
- 关键词：大菱鲆受精卵显微注射GFP
- 一种半滑舌鳎雌性特异蛋白的表达及应用
- 本发明提供了pitpβ_w蛋白在调控雄性半滑舌鳎中的生长相关基因和性别分化相关基因的表达中的用途；本发明利用pitpβ_w蛋白成功在雄性半滑舌鳎中调控了生长相关基因和性别分化相关基因，对研究相关基因表达模式和表型，以及对...
- 徐文腾崔忠凯孙宇轩陈亚东徐晓东李文龙
- 一种干扰半滑舌鳎配子发生基因的siRNA及其应用
- 本发明涉及RNA干扰领域，具体涉及一种干扰半滑舌鳎配子发生基因的siRNA及其应用；具体而言，本发明提供了一种优化的siRNA，该siRNA成功在ZZ型半滑舌鳎雄鱼中对配子发生基因进行了干扰，具有广阔的应用前景。
- 徐文腾陈松林崔忠凯刘洋
- 文献传递
- 7处移植公鱼种类的分子鉴定被引量：4
- 2012年
- 公鱼属种类曾在中国被广泛移植,但被移植的种类却存在一定的争议,实验利用COⅠ基因序列片段对来自黑龙江、新疆和云南3地7处移植公鱼属种类进行了鉴定,并对它们之间的遗传关系进行了探讨。与GenBank和DNA Barcoding鉴定中心的条形码网站BOLDSystems进行比对,发现3地7处的移植公鱼均与西太公鱼序列相似度达到99%以上;移植公鱼及西太公鱼群体间和群体内的遗传距离均在0.1%～0.3%,与公鱼属其它种类的种间遗传距离则在10%以上;在NJ、Bayesian系统树上,移植公鱼、西太公鱼聚为同一单系,支持率超过98%;以上结果都证明这些移植公鱼均为西太公鱼。研究表明,7处移植公鱼都受到环境的选择压力,但群体间的遗传分化不显著(P=0.066 47>0.05)。在单倍型网络结构图中,它们之间遗传关系和移植路径不明晰,而多次和交叉移植可能是原因之一。
- 龚小玲吴颖崔忠凯鲍宝龙
- 关键词：物种鉴定
- 半滑舌鳎gata5基因的克隆及表达分析
- 2019年
- 【目的】研究半滑舌鳎(Cynoglossussemilaevis)gata5基因(csgata5)的序列特征及该基因在半滑舌鳎性腺分化、成熟过程中的表达模式。【方法】通过克隆获得csgata5编码区序列,利用荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测csgata5 mRNA在不同类型性腺、胚胎和性腺发育中的表达模式,借助原位杂交技术定位csgata5 mRNA表达的细胞类型。【结果】克隆获得csgata5 cDNA序列1 777 bp,包含1 167 bp的编码区(Coding sequence,CDS),262 bp的5′UTR和348 bp的3′UTR区,预测csgata5编码388个氨基酸残基(aa),分子质量为41.9 ku,等电点为8.90,在C端含有两个典型的GATA锌指结构域;基因组分析显示csgata5位于半滑舌鳎10号染色体上,包含7个外显子和6个内含子区。RT-qPCR分析显示csgata5 mRNA在2龄雄鱼和伪雄鱼精巢中表达高于卵巢;csgata5m RNA主要定位在卵母细胞、精原细胞和精子中。胚胎发育过程中,csgata5m RNA表达在1细胞期至囊胚期呈下降趋势,之后上升,至原肠胚期达到峰值,随后降低并维持较低水平至孵化出膜。在精巢发育过程中,csgata5m RNA表达水平呈升高趋势,在1龄达到检测的峰值;在卵巢发育过程中,csgata5m RNA表达趋势类似精巢,表达水平低于同期精巢。【结论】csgata5参与半滑舌鳎原肠胚期的组织器官分化,具有促进原始生殖细胞向雄性生殖细胞分化及雄性生殖细胞发育的作用。
- 董忠典董忠典崔忠凯张宁崔忠凯
- 关键词：半滑舌鳎RT-QPCR原位杂交性腺分化
- 鳗鲡属6种鱼类线粒体COⅠ和COⅡ基因序列分析和分类的有效性被引量：5
- 2013年
- 对鳗鲡属(Anguilla)的美洲鳗鲡(A.rostrata)、欧洲鳗鲡(A.anguilla)、太平洋双色鳗鲡(A.bicolor pacifica)、花鳗鲡(A.marmorata)、澳洲鳗鲡(A.australis)、日本鳗鲡(A.japonica)6种鱼类54个体COⅠ和COⅡ基因片段中1 179 bp和633 bp的序列特征、分子分类的有效性、以及构建的系统关系进行了比较分析,结果表明:(1)COⅠ和COⅡ基因可变位点、简约信息的百分比分别为17.98%、16.45%和12.16%、10.11%,COⅠ较COⅡ基因的变异率高;(2)两种基因序列均表现出明显的反G偏倚(在COⅠ和COⅡ中G的百分含量分别为18.45%,16.67%);(3)基于COⅠ基因种间遗传距离均高于COⅡ基因,且均大于2%(欧洲鳗鲡和美洲鳗鲡基于COⅡ基因序列的种间遗传距离为1.8%除外),种内遗传距离都小于1%;(4)以两序列构建的系统树,各物种所有个体均形成独立、高支持率单系,但两序列构建的系统关系并不完全一致。由此说明,COⅠ和COⅡ都能对鳗鲡属鱼类进行有效的物种分子鉴定,但在探讨鳗鲡属鱼类系统进化关系上还需要联合其它基因。
- 龚小玲岳丽佳崔忠凯张晓懿
- 关键词：物种鉴定
- 一种半滑舌鳎抗病免疫相关基因及其应用
- 本发明的目的是提供一种半滑舌鳎抗病免疫基因，其氨基酸序列为SEQ ID NO:1，编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO:2。本发明首次克隆了半滑舌鳎类IgT基因，获得了其cDNA序列，设计了其表达检测的PCR引物，建...
- 陈松林王双艳王磊王洁周茜陈张帆崔忠凯杨英明
- 水产育种生物技术发展战略研究被引量：1
- 2023年
- 生物技术是水产种业可持续发展的核心驱动力,全面提升水产育种生物技术创新能力并实现种源自主可控,对于保障国家食品安全具有重要意义。本文梳理了我国水产育种的发展现状和存在的问题,总结了国内外水产行业在转基因育种、倍性育种、分子标记辅助育种、基因组选择育种、基因组编辑育种、分子设计育种、生殖干细胞移植等生物技术方向的研究进展与应用情况,进一步分析了相关技术方向上的未来研发需求。研究提出了未来水产育种生物技术的发展目标,包括水产生物优异种质资源收集、保存与精准鉴定,重要性状遗传基础与调控机制深度解析,高效精准育种技术创建,突破性新品种创制在内的重点任务。研究建议,优化水产种业发展政策、推动水产育种技术创新、建立水产良种创制与转化平台、设立专门项目推动技术创新和种业发展,以此推动我国由水产种业大国向水产种业强国的深刻转变。
- 陈松林陈松林卢昇胡炜胡炜王德寿胡晓丽刘清华刘清华赵紫霞覃钦博王师崔忠凯
- 关键词：生物技术传统育种技术分子育种技术
- 塔里木裂腹鱼胚胎和仔鱼的发育与生长被引量：21
- 2013年
- 2012年4月至6月，在新疆博湖苇业股份有限公司三苇场（新疆且末县）进行了塔里木裂腹鱼的人工繁殖和苗种培育研究。人工授精的受精率为83%，孵化率为89%。塔里木裂腹鱼受精卵在16~19 ℃下历时约93 h经过卵裂期、囊胚期、原肠期、神经胚期、孵化期等时期孵化出膜，初孵仔鱼平均体长（7.29±0.18） mm。1~25日龄的仔鱼可分为卵黄囊期、弯曲前期、弯曲期和弯曲后期4个发育阶段；对仔鱼阶段的全长（LT）、头长（LH）、躯干长（LQ）、尾部长（LC）、眼径（D）、体高（HB）、头高（HH）、湿重（W）8项生长指标的特定生长率进行了分析，结果表明仔鱼各个阶段的发育是异速的；仔鱼全长、尾部长、头长、头高、体高、眼径的生长方程都为二次多项式，体长与体质量之间呈指数相关。
- 龚小玲崔忠凯吴敏芝殷建国李岩王成辉
- 关键词：胚胎仔鱼发育
