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孟金涛
作品数:
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供职机构:
深圳先进技术研究院
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相关领域:
理学
自动化与计算机技术
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合作作者
魏彦杰
深圳先进技术研究院
冯圣中
深圳先进技术研究院
彭丰斌
深圳先进技术研究院
张慧琳
深圳先进技术研究院
张慧玲
深圳先进技术研究院
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双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法
本发明涉及一种双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法,包括压缩存储步骤,和deBruijn图构造步骤。本发明提供的双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法,(1)结合DNA序列互补双螺旋结构的特点,对de?...
孟金涛
魏彦杰
成杰峰
冯圣中
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基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法
本发明涉及基因测序技术领域,提供了一种基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法,包括:步骤A:读取测序数据源文件,构造多步双向De Bruijn图;步骤B:在所述多步双向De Bruijn图中对分...
孟金涛
张慧琳
彭丰斌
魏彦杰
冯圣中
文献传递
双向多步De Bruijn图的突出端识别与去除方法
本发明公开一种双向多步De Bruijn图的突出端识别与去除方法,包括步骤,S1、读取测序数据源文件,并构造双向多步De Bruijn图;S2、设定所述双向多步De Bruijn图中的每个顶点u的数据结构,对所述双向多步...
孟金涛
张慧琳
彭丰斌
魏彦杰
冯圣中
文献传递
短序列组装中序列片段的过滤方法及系统
本发明公开了一种短序列组装中序列片段的过滤方法,包括以下步骤:接收测序序列;分别将接收到的测序序列逐个碱基滑动切割得到固定碱基长度的短串;将得到的所述短串的序列值及所述短串的出现频率存储为一个节点;计算所述短串频率阈值;...
孟金涛
魏彦杰
曾理
成杰峰
冯圣中
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一种确定城市交通拥堵的方法
本发明属于城市交通建设技术领域,具体公开了一种确定城市交通拥堵的方法。该方法通过出租车或公共汽车的实时交通GPS信息,通过计算出租车或公共汽车在每一段路的平均速度,根据不同道路的限速不同,采取不同的阈值确定拥堵的路段和拥...
魏彦杰
张帆
张慧玲
彭丰斌
孟金涛
冯圣中
文献传递
双向多步De Bruijn图的错误双向边识别与去除方法
本发明公开一种双向多步De Bruijn图的错误双向边识别与去除方法,包括步骤,S1、读取测序数据源文件,并构造双向多步De Bruijn图;S2、统计整个所述双向多步De Bruijn图的所有双向边的加权平均覆盖度W;...
孟金涛
张慧琳
彭丰斌
魏彦杰
冯圣中
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Smac蛋白二聚拟合物及其鉴定方法
本发明涉及生物化学技术领域,特别涉及一种Smac蛋白二聚拟合物及其鉴定方法与应用。本发明的Smac蛋白二聚拟合物以AT-406为骨架,用连接基团将两个AT-406单体分子连接,在保持AT-406优良的生物活性和药理、毒理...
魏彦杰
张慧琳
彭丰斌
孟金涛
冯圣中
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基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统
本发明涉及生物信息学技术领域,特别涉及一种基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统。本发明的方法基于圆周统计对蛋白质折叠进行表征,高效、准确,即可以更快研究蛋白质的折叠,也可以更准确描述蛋白质动态变化,从而研究相关神经退...
魏彦杰
张慧玲
彭丰斌
孟金涛
冯圣中
双向多步De Bruijn图的重复双向边识别与去除方法
本发明公开一种双向多步De Bruijn图的重复双向边识别与去除方法,包括步骤:S1.读取测序数据源文件,并构造双向多步De Bruijn图;S2.判断出度为3的顶点u是否指向的同一个顶点v的同一方向或者同一端,指向相同...
孟金涛
张慧琳
彭丰斌
魏彦杰
冯圣中
基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的双向边扩展方法
本发明涉及基因测序技术领域,提供了一种基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法,包括:步骤A:读取测序数据源文件,构造多步双向De Bruijn图;步骤B:在所述多步双向De Bruijn图中对交...
孟金涛
张慧琳
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