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周文鹃
作品数:
3
被引量:3
H指数:1
供职机构:
西南科技大学计算机科学与技术学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
自动化与计算机技术
生物学
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合作作者
刘自伟
西南科技大学计算机科学与技术学...
陈昌平
西南科技大学计算机科学与技术学...
彭春艳
西南科技大学计算机科学与技术学...
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2009
1篇
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串联重复序列识别方法研究
被引量:1
2008年
非编码区重复序列分析在基因组研究中起着重要作用,其基础就是在非编码DNA序列中识别和定位所有的重复结构。重复序列识别问题在计算机科学中主要体现为字符串匹配问题。在分析了后缀树和后缀数组字符串匹配算法的基础上,详细阐述了基于后缀数组的精确串联重复序列识别方法。实验表明,该方法适合用于非编码DNA序列分析。
陈昌平
刘自伟
周文鹃
彭春艳
关键词:
串联重复序列
后缀树
基于DC3算法的非编码区序列最大串联重复识别
被引量:2
2009年
非编码区信息结构分析是目前生物信息学研究的热点之一。运用DC3算法构建的后缀数组以及最长公共前缀(LCP)作为辅助工具构造一个算法,用于对非编码区中存在的重复序列进行搜索,进而研究可能与其相关的功能元件,从而揭示出非编码区的结构信息。通过实验证明其实用性。
周文鹃
刘自伟
陈昌平
关键词:
非编码区
后缀数组
Y染色体NC-DNA结构比较分析
生物信息学的主要任务是利用信息处理方法揭示海量生物学数据中蕴涵的生物学意义、探索生命活动的奥秘。生物基因组中存在大量的非编码区序列,这些序列中包含许多未知的生物功能或信息,对它的结构进行分析已成为生物信息学研究最重要的课...
周文鹃
关键词:
串联重复序列
后缀数组
Y染色体
数据库结构
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