周峰
- 作品数：3 被引量：10H指数：2
- 供职机构：中国药科大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 木榄甘油醛-3-磷酸脱氢酶全长cDNA的克隆及其序列分析被引量：7
- 2010年
- 甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)是糖酵解过程和卡尔文循环中的关键酶,在糖代谢和能量代谢过程中起着重要的作用。为揭示GAPDH在植物耐盐过程中的作用,研究了从前期构建的盐胁迫下木榄幼叶cDNA文库中克隆到编码GAPDH的cDNA全序列,并对其编码蛋白的理化性质、结构特点和空间分布特点进行了分析。序列分析结果表明:木榄GAPDH的cDNA全长为1482bp,编码区为1218bp,编码一个由405个氨基酸残基组成蛋白质,理论Mr为43.4k,理论等电点(pI)为8.65。基于该蛋白的氨基酸序列分析基础上的系统发育分析表明木榄的进化地位与毛果杨较为接近。结构分析和预测结果显示:木榄的GAPDH为无信号肽和跨膜区的亲水性蛋白,含有GAPDH的保守结构域NADB-Rossmann(71-222aa)和Gp_dh_C(227-383aa)。同源模建分析结果表明:该蛋白与菠菜相比具有1个高度保守的活性区,该活性区由第70～405氨基酸残基组成。
- 孙伟管悦周峰高向东吴梧桐叶波平
- 关键词：木榄生物信息分析盐胁迫
- 条纹斑竹鲨鱼脂肪酸结合蛋白(FABPs)cDNA的克隆与序列分析
- 2010年
- 脂肪酸结合蛋白(fatty acid binding protein,FABP)在调节脂肪酸代谢、信号传导以及细胞的增殖与分化过程中起着重要的作用。为揭示FABP在肝脏再生过程中的作用,研究了从前期构建的条纹斑竹鲨鱼肝cDNA文库中克隆到编码FABP的cDNA全序列,并对其表达产物的理化性质、结构和空间分布特点以及在肝脏再生过程中的表达进行了分析,结果表明:条纹斑竹鲨鱼FABP的cDNA全长为1194bp,编码一个由115个氨基酸残基组成的无跨膜区的胞外蛋白,该蛋白的理论Mr为13065.1,理论等电点(pI)为8.81。生物信息学分析结果显示:该蛋白与来自铰口鲨、鸡、短尾负鼠和人的FABP在氨基酸水平上分别具有74%、56%、55%和52%的同源性,其进化地位与同属于海洋软骨鱼类的铰口鲨接近。进一步的分析发现该蛋白和其它物种来源的脂肪酸结合蛋白的结构域相似,它们均含有3个蛋白激酶C(PKC)磷酸化位点、1个N-酰基化位点和2个酪蛋白激酶II磷酸化位点。同源模建分析结果表明该蛋白与人肌肉FABP的A链一样具有一个高度保守的活性区,该活性区由第1～111氨基酸残基组成。本研究进一步考察了FABP编码基因在鲨鱼肝脏部分切除后的表达变化,证明其mRNA水平在部分肝切除后迅速上调,至切除后的第6h后达到最高,然后逐渐下调至24h后稳定在一个相对较低的水平。上述结果表明条纹斑竹鲨鱼的FABP在肝脏的损伤再生过程中可能起着重要的调节作用。
- 周峰许媛媛潘征高向东吴梧桐叶波平
- 关键词：脂肪酸结合蛋白生物信息分析肝再生
- 木榄幼苗叶片cDNA文库的构建及其表达序列标签分析被引量：3
- 2010年
- 应用SMART技术构建了25‰盐度下生长4个月的木榄叶片的cDNA文库,文库滴度为106cfu mL-1,重组率为94.4%,插入片断长度为1～2 kb。从cDNA文库中随机挑选了96个重组克隆进行序列分析,共获得94个表达序列标签(ESTs),经质量控制和聚类拼接后得到81个unigenes,包括5个片断聚合群和76个单一序列。Blastx分析结果表明这些unigenes与GenBank的Nr数据库中已报道的基因具有较高的同源性(E<10-5),它们参与呼吸代谢、光合作用、糖代谢、氨基酸代谢、脂肪酸代谢以及不饱和脂肪酸生物合成等重要的生理过程,并与机体的损伤修复、胞吞作用以及PPAR信号途径等相关。
- 叶波平管悦许媛媛孙伟周峰高向东吴梧桐
- 关键词：木榄CDNA文库EST序列功能分析
