刘芳
- 作品数:5 被引量:6H指数:1
- 供职机构:内蒙古自治区地方病防治研究中心更多>>
- 发文基金:卫生部卫生公益性行业科研专项内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- DNA条形码鉴别内蒙古地区啮齿动物被引量:4
- 2013年
- 为探究应用DNA条形码技术对啮齿动物进行分子生物学鉴定的可行性,检测了内蒙古地区7种啮齿动物的59条线粒体COI基因部分序列,用MEGA5.0软件计算GC含量、遗传距离,采用邻接法(NJ)构建分析系统发育树。结果发现,所有序列富含AT,大部分鼠种都有特定的氨基酸组分。种内平均遗传距离为0.6%,不同鼠种间平均遗传距离为23.1%,NJ进化树能清楚的区分7个不同的类群。所以认为通过COI基因应用DNA条码技术可以鉴别内蒙古地区的啮齿动物。
- 常子丽刘芳王建军李建云胡艳红武正华王浩辉李科杨志羡马志东范蒙光张忠兵
- 关键词:DNA条形码啮齿动物COI基因
- 2004至2013年蒙古旱獭鼠疫疫源地监测结果分析被引量:1
- 2014年
- 目的分析2004至2013年蒙古旱獭鼠疫疫源地监测结果,掌握该疫源地的宿主动物的分布、数量及疫情变化。方法每年5~9月,在满洲里市、陈巴尔虎旗、新巴尔虎左旗、新巴尔虎右旗,以旗(县)为单位开展监测。每个旗(县)监测面积为20 000~40 000 hm^2。采用路线法、一日弓形夹法、五米夹线法调查宿主动物的分布及数量,采集动物标本进行鼠疫病原学和血清学检测。结果 2004年至2013年,蒙古旱獭的平均密度为0.021 hm^2/只,达乌尔黄鼠平均密度为0.608 hm^2/只,蚤指数为1.68。检出达乌尔黄鼠阳性血清学53份,最高滴度1:1 280。结论从2004年,该疫源地再次进入活跃状态,对该地区的监测要加强力度,扩大监测范围,防止人间鼠疫的发生。
- 李建云张忠兵范蒙光刘芳胡艳红张大禹武正华韩效中
- 关键词:鼠疫疫源地
- DNA条形码鉴别内蒙古地区大沙鼠
- 2014年
- 目的探究应用DNA条形码技术对鼠疫宿主动物进行分子生物学鉴定的可行性。方法本研究检测了内蒙古布氏田鼠和长爪沙鼠鼠疫自然疫源地内形态上鉴定为8种啮齿动物的78条线粒体COⅠ基因657bp的片段序列,经过双参数法计算遗传距离,采用邻接法(NJ)构建分析系统发育树。结果除大沙鼠外,种内平均遗传距离为0.6%,种间平均遗传距离为23.1%,而14只大沙鼠种内遗传距离高达8.1%,而分成2组后种内遗传距离最大为0.1%。NJ进化树能清楚的区分不同的鼠种。结论通过COⅠ基因应用DNA条码技术可以对内蒙古的鼠疫宿主动物进行鉴别,同时认为乌兰察布长爪沙鼠疫源地的大沙鼠可能存在2个亚种。
- 常子丽范蒙光张忠兵刘芳李建云王姝懿王浩珲杨志羡王建军
- 关键词:DNA条形码CO大沙鼠
- 内蒙古锡林郭勒盟常见几种鼠疫宿主动物的DNA条码比较
- 2015年
- 目的应用DNA条形码技术对鼠疫宿主动物进行分子生物学的鉴定。方法运用PCR方法检测锡林郭勒盟9种啮齿动物的149条线粒体COI基因657 bp的片段序列,用MEGA 5.0软件采用邻接法(NJ)构建分析系统发育树。结果 NJ进化树能清楚地区分9个不同的类群。结论通过COI基因应用DNA条码技术可以对锡林郭勒盟的鼠疫宿主动物进行鉴别,同时可为形态鉴别提供佐证数据。
- 刘向兵范蒙光张忠兵刘芳常子丽
- 关键词:DNA条形码COI基因鼠疫
- 布氏田鼠疫源地鼠疫宿主动物DNA条形码分析被引量:1
- 2014年
- 目的 探究应用DNA条形码技术对鼠疫宿主动物进行分子鉴定的可行性.方法 采集内蒙古自治区锡林郭勒高原布氏田鼠鼠疫自然疫源地内的7种啮齿动物,包括布氏田鼠、达乌尔黄鼠、达乌尔鼠兔、蒙古毛足鼠、五趾跳鼠、长爪沙鼠和大沙鼠,提取肝脏组织,进行线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ (CO Ⅰ)基因序列分析,用MEGA 5.0软件计算GC含量,通过双参数(Kimura-2-parameter,K2P)模型计算遗传距离,采用邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建系统发育树.结果 共获得61条CO Ⅰ基因序列片段,每条序列长度657 bp.五趾跳鼠、布氏田鼠、长爪沙鼠、达乌尔鼠兔、蒙古毛足鼠、大沙鼠、达乌尔黄鼠的GC含量分别为(46.945±0.109)%、(43.836±0.000)%、(40.313±0.084)%、(47.514±0.073)%、(41.838±0.073)%、(40.335±0.000)%、(39.467±0.032)%,除大沙鼠和长爪沙鼠的GC含量组间比较差异无统计学意义(P> 0.05),其他各鼠种的GC含量组间比较差异均有统计学意义(P均< 0.05).上述7个鼠种在第1位密码子处GC含量分别为(57.534±0.000)%、(55.251±0.000)%、(54.338±0.000)%、(57.078±0.000)%、(55.308±0.057)%、(53.881±0.000)%、(56.164±0.000)%,除布氏田鼠和蒙古毛足鼠的GC含量组间比较差异无统计学意义(P> 0.05),其他各鼠种的GC含量组间比较差异均有统计学意义(P均<0.05);上述7个鼠种在第3位密码子处GC含量分别为(40.835±0.328)%、(33.790±0.000)%、(24.136±0.253)%、(43.455±0.218)%、(27.740±0.207)%、(24.201±0.000)%、(19.772±0.097)%,除大沙鼠和长爪沙鼠的GC含量组间比较差异无统计学意义(P>0.05),其他各鼠种的GC含量组间比较差异均有统计学意义(P均<0.05).各鼠种的种内平均遗传距离为0.003,种间平均遗传距离为0.234 8,NJ系统发育树能清楚的区分7个不同的类群
- 常子丽张忠兵刘芳王建军马志东李振林赵成祥杨晓娟范蒙光
- 关键词:DNA条形码鼠疫