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抗原肽运载体TAP2基因与乙型肝炎病毒感染预后的相关性研究（摘要）: 2006年; 目的研究上海地区中国人群抗原肽运载体（transporter associated with antigen processing，TAP）基因与HBV感染以及慢性HBV感染和慢性肝炎并发肝硬化之间的相关性。方法收集临床病例，检测乙型肝炎病毒标志，参照“病毒性肝炎防治方案-2000”，选取101例乙型肝炎病毒感染者，21例HBV感染康复者及113例正常对照，进行TAP2等位基因分型。对数据分组进行统计分析。结果慢性乙型肝炎组的TAP2＊0201基因频率显著低于感染恢复组（X^2=4．95，P〈0．03）；肝硬化组的TAP2＊0101基因频率显著高于正常对照组（X^2=5．72，P〈0．02）；在慢性乙型肝炎并发肝硬化组中DR4与TAP2＊0101等位基因间存在显著的连锁不平衡（△=0．026，P〈0．05）。结论TAP2＊0101等位基因型携带者易感慢性乙型肝炎和乙型肝炎并发肝硬化，而丁AP2＊0201则表现出对慢性乙型肝炎的抗性。两者均与HBV感染的预后似有一定相关。; 夏天郝妍王小华刘洋陈兆鹏沈锡中朱乃硕; 关键词：乙型肝炎病毒感染慢性HBV感染预后慢性乙型肝炎等位基因分型 TA

谈系统发生树建立的分子标准被引量：7: 2004年; 随着进化生物学以及生物信息学的发展 ,研究不同物种间进化关系的方法也有了新的进展。其中分子进化方法使得系统发生树的建立更加简便和精确。几种系统发生树的建树方法及相关分子标准目前比较流行。。; 刘洋朱乃硕; 关键词：分子进化系统发生树

基于融解曲线分析的一种快速HLA-DR荧光分型方法的建立: 2007年; 据统计目前已经发现的HLA等位基因有2200多种，其中HLA—DR就有500多种，随着国内外干细胞和器官移植的广泛开展，快速、特异、高分辨、高通量、低成本地鉴定供、受者HLA型别变得越来越迫切。90年代末期实时荧光PCR（RQ—PCR）被引入HLA分型，它具有快速、灵敏、不易污染、自动化程度较高等优点，主要包括Taqman探针法和染料法。; 刘洋史繁华朱乃硕; 关键词：HLA等位基因实时荧光分型方法 TAQMAN HLA分型

抗原肽运载体TAP2基因与乙型肝炎病毒感染预后的相关性研究被引量：7: 2005年; 目的　研究上海地区中国人群抗原肽运载体(transporter associated with antigen processing, TAP)基因与HBV感染以及慢性HBV感染和慢性肝炎并发肝硬化之间的相关性。方法　收集临床病例,检测乙型肝炎病毒标志,参照“病毒性肝炎防治方案2000”,选取101例乙型肝炎病毒感染者,21例HBV感染康复者及113例正常对照,进行TAP2 等位基因分型。对数据分组进行统计分析。结果　慢性乙型肝炎组的TAP2 *0201基因频率显著低于感染恢复组(χ2 =4.95, P<0.03);肝硬化组的TAP2 *0101基因频率显著高于正常对照组(χ2 =5.72, P<0.02);在慢性乙型肝炎并发肝硬化组中DR4与TAP2 *0101等位基因间存在显著的连锁不平衡(△=0.026,P<0.05)。结论　TAP2 *0101等位基因型携带者易感慢性乙型肝炎和乙型肝炎并发肝硬化,而TAP2 *0201则表现出对慢性乙型肝炎的抗性。两者均与HBV感染的预后似有一定相关。; 夏天郝妍王小华刘洋陈兆鹏沈锡中朱乃硕; 关键词：乙型肝炎病毒感染预后慢性HBV感染等位基因分型病毒感染者等位基因型

GAGE基因家族的分子进化特征的研究被引量：2: 2007年; GAGE基因通常表达于睾丸组织和部分恶性肿瘤组织中,被认为可能是理想的癌症诊断的标记和治疗的靶位。我们对GAGE基因家族作了生物信息学分析,发现它们在X染色体上串联成簇排列,为灵长类所独有,各拷贝序列趋异度很低。在人类有15个以上的拷贝,在黑猩猩和猕猴分别有3个和4个。对GAGE基因家族构建进化树,并估算了复制事件发生的时间,结果显示在近400万年内陆续发生。用两种方法计算了GAGE各拷贝间的Ka/Ks值,结果为显著大于1,表明该基因家族受到正选择作用。这些结果提示该基因可能与灵长类的特征有关,其在进化上的地位和在配子发育和肿瘤发生中承担的功能值得深入研究。; 诸奇赟刘洋朱乃硕; 关键词：灵长类正选择

原发性肝癌患者血液中XAGE-1b mRNA的表达被引量：3: 2008年; XAGE-1是一类通过生物信息学的方法获得的肿瘤-睾丸抗原编码基因，XAGE-1b是其主要的表达剪接体。临床研究已获得了较为详细的XAGE-1在肿瘤细胞中的表达谱，发现在肺癌、黑色素瘤、前列腺癌等肿瘤组织中有较高的XAGE-1检出率，并且逐步揭示出XAGE-1的表达与病理进程和肿瘤亚型间的关联。本研究采用实时荧光定量聚合酶链反应（real-time PCR）检测了XAGE-1b mRNA在125例原发性肝癌患者血液中的表达情况，对其表达的临床意义进行了探讨。; 侯振宇宋玉亮潘泽亚秦兴军关晓峰刘洋周伟平朱乃硕; 关键词：原发性肝癌患者 MRNA 实时荧光定量聚合酶链反应血液抗原编码基因生物信息学

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刘洋