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乔坤

作品数:3 被引量:7H指数:2
供职机构:辽宁师范大学生命科学学院更多>>
发文基金:中国科学院实验海洋生物学重点实验室开放基金大连市科技计划项目更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 2篇生物学
  • 2篇农业科学

主题

  • 2篇裙带菜
  • 1篇抑制消减杂交
  • 1篇荧光
  • 1篇荧光定量
  • 1篇原核表达
  • 1篇杂交
  • 1篇上调
  • 1篇上调表达
  • 1篇石莼
  • 1篇实时荧光
  • 1篇实时荧光定量
  • 1篇实时荧光定量...
  • 1篇消减杂交
  • 1篇克隆
  • 1篇孔石莼
  • 1篇分子
  • 1篇分子克隆
  • 1篇干出
  • 1篇CDNA文库
  • 1篇ISSR

机构

  • 3篇辽宁师范大学

作者

  • 3篇乔坤
  • 2篇李世国
  • 2篇侯和胜
  • 1篇吴倩倩
  • 1篇佟少明
  • 1篇李洪艳
  • 1篇杨帆

传媒

  • 2篇海洋渔业

年份

  • 2篇2011
  • 1篇2010
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
裙带菜SAMS基因的克隆、分析及原核表达
本实验采用改良的SDS提取方法从裙带菜配子体中提取总RNA。通过设计简并引物克隆裙带菜S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因/(UpSAMS/)。获得的基因cDNA序列全长为1491bp,并编码397个氨基酸,预测蛋白分子量为43....
乔坤
关键词:裙带菜SAMS分子克隆实时荧光定量PCR原核表达
文献传递
大连海域养殖裙带菜遗传多样性的ISSR分析被引量:2
2010年
采用简单序列重复区间(ISSR)分子标记技术对辽宁大连海域的河口(HK)、旅顺(Ls)、金石滩(JST)、凌水(LSH)4个裙带菜养殖基地和1个实验室人工单一配子体杂交(ZJ)共5个种群45个裙带菜个体进行遗传多样性分析。14个ISSR引物共扩增出清晰可辨的位点176个,其中多态性位点170个,多态位点百分数为96.59%。结果分析表明,在群体水平上基因多样性指数为0.1280~0.2328,Shannon’s信息指数为0.1944—0.3458,Nei的分析结果显示种群间的遗传分化系数(Gst)为0.4566,分子方差分析(AMOVA)显示种群间的遗传变异占总变异的47.57%,种群内变异占总变异的52.43%。UPGMA聚类结果为河口(HK)、金石滩(JST)和凌水(LSH)种群相聚为一支,旅顺(LS)和杂交(zJ)种群聚为另一支。ISSR分析结果表明,这5个裙带菜种群内、种群间的遗传多样性水平均较低,不宜用作育种和育苗的种源。
乔坤李世国李洪艳侯和胜
关键词:裙带菜ISSR
孔石莼在干出胁迫下上调表达基因消减cDNA文库的构建及分析被引量:4
2011年
利用抑制消减杂交技术构建了潮间带绿藻孔石莼(Ulva pertusa)在干出胁迫状态下上调表达基因的消减cDNA文库。获得的阳性克隆经测序得到150条上调表达的EST片段,其中21条为冗余序列(RS),137条非冗余序列(NRS)。片段中最长833 bp,最短106 bp,平均长度364 bp。参与比对的EST片段按照其注释功能可分类为:细胞生长与发育、蛋白合成与分解、代谢过程、胁迫应答、光合作用与光诱导、转录调节、信号转导等相关基因。未知功能和无对比结果序列共60条,占非冗余序列的43.80%。比对相似度主要分布在20%~60%之间,主要与已经完成基因组测序的藻类或高等植物的氨基酸序列具有较高的相似性。孔石莼对密码子第三位碱基的使用偏好无显著差别(P〉0.05),GC使用总频率为50.66%,而对终止密码子则明显偏好TGA。实时荧光定量结果表明,部分分离的基因在干出胁迫状态下表达量上调。这些不同功能基因的表达构成了复杂的调控网络,能够为揭示孔石莼抵御潮间带不良环境的分子机制提供多方面的切入点。
李世国杨帆吴倩倩乔坤佟少明侯和胜
关键词:孔石莼潮间带抑制消减杂交CDNA文库
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