靳博
- 作品数：29 被引量：146H指数：7
- 供职机构：北京市西城区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：首都卫生发展科研专项北京市西城区科技计划项目北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 临床分离志贺菌中CTX-M-9型超广谱β-内酰胺酶基因分析被引量：2
- 2013年
- 目的:了解本地区临床分离志贺菌中CTX-M-9型超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)分布,分析CTX-M-9型基因的种类、数量以及多态性。方法:收集2008年-2011年本地区临床分离非重复的志贺菌94株,聚合酶链反应(PCR)检测CTX-M-9型ESBLs基因,对PCR阳性产物进行测序,测序结果在GenBank上比对确定基因亚型,并通过DNAman软件对核酸序列进行分析,确定SNPs位点。结果:94株志贺菌中,17株携带CTX-M-9型ESBLs基因,阳性率18.09%,并在福氏志贺菌、宋内志贺菌和鲍氏志贺菌中均有检出。对DNA序列进行比对、分析,均为CTX-M-14亚型,未发现SNPs位点。结论:本地区志贺菌中CTX-M-9型ESBLs以CTX-M-14亚型为主,基因结构稳定,未发生变异,并可广泛在志贺菌各血清型中存在。
- 苗元刘静王利萍崔京辉王永全吴本和靳博苗智慧
- 关键词：志贺菌超广谱Β-内酰胺酶耐药基因
- 餐饮服务单位及宾馆住宿场所环境和食品从业人员中诺如病毒感染状况研究被引量：5
- 2020年
- 目的了解诺如病毒在餐饮服务单位和宾馆住宿场所环境中的分布及厨师隐性感染状况,并对其基因型别进行研究。方法共抽检北京市西城区40家餐饮服务单位和10家宾馆住宿场所,每家单位采集4份环境涂抹样品及2名厨师粪便标本。用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)对诺如病毒进行初步鉴定。通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)对诺如病毒开放读码框(opening reading frames,ORF)1区序列进行扩增,并对测序结果进行序列和进化分析。结果共采集环境表面涂抹样品200份,厨师粪便标本100份。其中,1份墩布池涂抹样品为诺如病毒阳性,环境样品诺如病毒阳性率为0.5%(1/200),3份厨师粪便中检出诺如病毒,隐性感染率为3.0%(3/100)。3名厨师粪便标本诺如病毒ORF1区序列经RT-PCR扩增,进化树显示,1名厨师为GII.17基因型,2名厨师为GI.3基因型。结论北京市西城区餐饮服务单位及宾馆住宿场所存在诺如病毒传播风险,应强化卫生管理,重视物体表面消毒及厨师健康教育,防止诺如病毒的进一步扩散。
- 吉彦莉王永全崔海洋靳博
- 关键词：诺如病毒餐饮服务单位厨师
- 一起由柯萨奇病毒A4引起的聚集性发热的分子流行病学研究被引量：3
- 2019年
- 目的对2018年北京市一起聚集性发热疫情的病原进行鉴定,并对其进行分子流行病学分析。方法采集此次疫情4例患儿咽拭子标本,提取标本核酸,用实时荧光PCR对其进行初步病原学鉴定。用分型引物通过RT-nPCR对肠道病毒VP1区部分核苷酸序列进行扩增,通过测序和GenBank Blast比对确定肠道病毒型别,并对其进行序列和进化分析。结果 4例患儿标本均为CVA4阳性,在VP1区,其核苷酸序列同源性为100%;序列分析发现,其与2016年澳大利亚CVA4分离株MH111027同源性最高,为99%;与2004—2016年中国境内CVA4分离株同源性为83%～90%。进化分析显示,此次疫情毒株与近年来中国境内流行的CVA4优势毒株不在一个进化树分支上。结论引起此次聚集性发热疫情的病原体是CVA4,其与近年来我国流行的CVA4优势毒株具有不同的种系来源。
- 吉彦莉王永全崔海洋靳博
- 关键词：进化分析
- 2015—2018年北京市西城区5岁以下儿童病毒性腹泻流行病学特征被引量：24
- 2020年
- 目的了解2015—2018年北京市西城区5岁以下儿童病毒性腹泻的流行特征,为病毒性腹泻防控提供依据。方法采集2015—2018年北京市西城区儿童腹泻监测哨点医院门诊就诊的5岁以下病例粪便标本,用实时荧光PCR对A组轮状病毒(RVA)、诺如病毒(NV)、腺病毒(AdV)、星状病毒(AstV)进行检测。结果共采集粪便标本972份,A组轮状病毒阳性142例(14.61%),诺如病毒阳性136例(13.99%),腺病毒阳性67例(6.89%),星状病毒阳性49例(5.04%),混合感染46例(4.73%)。RVA发病高峰为冬季,NV秋季高发,AstV春季检出率最高,AdV感染无明显季节特征。2岁以内腹泻患儿RV、NV、AdV、AstV的检出率分别为80.28%、77.94%、83.58%、87.75%。结论2015—2018年北京市西城区5岁以下儿童病毒性腹泻的主要病原是轮状病毒和诺如病毒,2岁以内儿童是高发人群,冬季检出率最高。
- 吉彦莉王永全崔海洋靳博曹玮刘潇潇
- 关键词：病毒性腹泻轮状病毒诺如病毒腺病毒星状病毒
- 北京市西城区2017年急性胃肠炎疫情流行特征与病原学分析被引量：7
- 2018年
- 目的 分析北京市西城区2017年急性胃肠炎聚集性和暴发疫情的流行特征.方法 采用现场流行病学方法对每一起急性胃肠炎疫情进行调查,采集病例及相关人员便标本进行急性胃肠炎病毒检测.结果 2017年西城区共调查处置急性胃肠炎暴发疫情7起、聚集性疫情66起,累计病例788例,总罹患率为12.39%.疫情发生时间集中在春夏季的3月至6月,多发生在小学(68.49%)和幼儿园(28.77%).患者临床表现主要为呕吐(93.27%)和腹泻(30.46%).病例便标本急性胃肠炎病毒检出率为71.90%,以诺如病毒GⅡ型为主(90.76%).8起疫情密切接触者中有隐性感染者,6起疫情中食堂工作人员中有隐性感染者.结论 诺如病毒GⅡ型是引起北京市西城区急性胃肠炎聚集和暴发的主要病原体,疫情春夏季高发,小学为重点场所.加强食堂工作人员及隐性感染者的监测与管理对于疫情的防控非常必要.
- 黄艳红刘潇潇初艳慧孔庆征陈瑜崔海洋靳博
- 关键词：诺如病毒胃肠炎流行病学特征
- 北京市腹泻儿童人博卡病毒VP1区基因特征分析
- 2019年
- 目的了解北京市5岁以下腹泻儿童人博卡病毒(human bocavirus, HBoV)感染状况及分子流行病学特征。方法收集2015年11月—2016年12月北京市哨点医院5岁以下急性腹泻儿童粪便标本,用巢式PCR对HBoV部分VP1区序列进行扩增,并对阳性序列进行基因特征分析。结果共采集粪便标本396例,检出HBoV 30例(7.58%),包括3种基因型别,分别为HBoV1型(17例)、HBoV2型(11例)、HBoV3型(2例),未检出HBoV4型。进化分析表明,HBoV1序列在进化树上包括两簇,其中,BJ16-325变异程度较大,自成一簇;其他HBoV1序列共同形成一簇。北京地区所有HBoV2序列均位于一个新的HBoV2亚型分支上。结论 2015—2016年北京市5岁以下腹泻儿童检出的HBoV包括3种基因型(1～3型);北京市至少存在2组不同来源HBoV1的流行;本地区流行的HBoV2为一种新的亚型。
- 吉彦莉王永全崔海洋靳博
- 关键词：病毒性腹泻人博卡病毒进化分析
- 北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况及基因特征分析被引量：2
- 2021年
- 目的了解北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况,分析其基因特征。方法2014年11月-2015年10月,采集北京市三个水产品销售市场新鲜花蛤各24件。用两种方法对花蛤鳃和肠内容物进行病毒浓缩,提取核酸后用实时荧光RT-PCR法检测诺如病毒GI/GII组和A组轮状病毒核酸。用半巢式RT-PCR方法,扩增诺如病毒阳性样本衣壳蛋白VP1区基因,对PCR阳性产物进行测序,用诺如病毒分型工具进行基因亚型鉴定,用MEGA软件最大似然法构建进化树。结果72件花蛤中未检出A组轮状病毒,诺如病毒检出率为34.7%(25/72),GII组、GI组和GI/GII组混合检出率分别为27.8%(20/72)、4.2%(3/72)和2.8%(2/72)。11月诺如病毒检出率最高,为100.0%(6/6);三个水产销售市场诺如病毒检出率分别为25.0%(6/24)、50.0%(12/24)和29.2%(7/24)。10件测序成功,其中6株为GII.17,GII.6、GII.2、GI.3a和GI.4各1株。这些毒株与腹泻患者和外环境参考毒株相似性为97.9%~100.0%。结论北京市市售花蛤存在诺如病毒污染,而且与腹泻患者和外环境参考毒株高度同源,应加强花蛤及销售人群和环境的诺如病毒监测。
- 王永全靳博崔海洋田祎严寒秋高志勇
- 关键词：花蛤诺如病毒轮状病毒
- 扇贝和花蛤诺如病毒2种富集方法的比较
- 2020年
- 目的对市售的扇贝和花蛤,进行诺如病毒2种富集方法的比较。方法 2014年11月-2015年10月,采集扇贝和花蛤各72件。取扇贝和花蛤消化组织,分别采用PEG 8000沉淀法(F1)和蛋白酶K消化/PEG 8000沉淀法(F2)2种方法进行病毒富集。提取核酸后用实时荧光PCR法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ组核酸。用配对卡方检验比较不同富集方法检出率的差异。结果扇贝标本诺如病毒检测,F1和F2检出率分别为27.78%(20/72)和2.78%(2/72),两者差异有统计学意义(P <0.01)。花蛤标本诺如病毒检测,F1和F2检出率分别为25.00%(18/72)和11.11%(8/72),两者差异有统计学意义(P=0.013)。结论扇贝和花蛤标本诺如病毒富集时PEG8000沉淀法优于蛋白酶K消化/PEG8000沉淀法。
- 王永全严寒秋崔海洋靳博高志勇田祎
- 关键词：诺如病毒实时荧光PCR法
- 应用2种RT-PCR方法检测和分析北京市市场销售牡蛎中诺如病毒基因特征被引量：2
- 2022年
- 目的应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法检测和分析牡蛎中诺如病毒的基因特征。方法应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法,对2014年11月至2015年10月北京市采集的新鲜市售牡蛎进行诺如病毒GⅠ/GⅡ组并联试验检测,分析检出率,应用符合率和一致性检验(Kappa值)对半巢式RT-PCR方法进行可靠性评价,应用半巢式RT-PCR方法扩增诺如病毒GⅠ/GⅡ衣壳蛋白区基因,对阳性产物进行测序。采用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对、Mega 6.0软件构建进化树。结果72份样品中,实时荧光RT-PCR、半巢式RT-PCR和并联试验的诺如病毒检出率分别为31.94%(23/72)、38.89%(28/72)和48.61%(35/72)。2种方法符合率为73.61%,中度一致(Kappa值=0.43)。测序成功13株诺如病毒,11株(7株GⅡ.17、2株GⅡ.4 Sydney_2012、1株GⅡ.1和1株GⅡ.21基因型)为2种RT-PCR方法检测诺如病毒阳性样本所得;2株(GⅡ.17和GⅡ.3基因型各1株)为半巢式RT-PCR方法检测诺如病毒阳性样本、实时荧光RT-PCR方法检测诺如病毒阴性样本所得。这些毒株与腹泻患者、环境污水和贝类水产品参考株的相似性为84.4%~100.0%。结论用2种RT-PCR并联法检测牡蛎中诺如病毒,不仅能提高检出率还能获得更多基因型;牡蛎中诺如病毒毒株与人源、环境污水及贝类水产品参考毒株高度同源,应对经常接触牡蛎的人群及相关环境进行诺如病毒监测和防控。
- 严寒秋王永全崔海洋靳博高志勇王全意
- 关键词：诺如病毒基因特征牡蛎
- 一起由诺如病毒和肠道腺病毒混合感染引起的急性胃肠炎聚集性疫情的病原鉴定及进化分析被引量：1
- 2023年
- 目的对一起儿童急性胃肠炎聚集性疫情的病原进行鉴定、分型及进化分析。方法收集本次疫情患儿粪便标本,提取核酸,采用实时荧光PCR初步进行病原鉴定。通过反转录-聚合酶链反应对诺如病毒阳性标本的聚合酶区和衣壳VP1区部分基因序列进行扩增;通过PCR对腺病毒阳性标本的六邻体区部分基因序列进行扩增。对扩增产物进行测序,利用生物信息学软件及网站对病毒进行型别鉴定及进化分析。结果共收集到3例患儿粪便标本,诺如病毒和腺病毒均为阳性。3株诺如病毒毒株均为诺如病毒GII.P12-GII.3型,其聚合酶区部分基因序列(206 bp)与2015─2018年我国GII.P12-GII.3型诺如病毒参考序列的同源性为98%,且位于同一进化树分支上;3株腺病毒毒株均为腺病毒F亚属41型(F41型),其六邻体区部分基因序列(420bp)与2015─2019年我国F41型腺病毒参考序列的同源性为100%,且位于同一进化树分支上。结论本次儿童急性胃肠炎聚集性疫情是由GII.P12-GII.3型诺如病毒和F41型腺病毒混合感染引起,毒株序列分别与近年来我国流行的GII.P12-GII.3型诺如病毒及F41型腺病毒序列高度同源。本研究为混合感染急性胃肠炎疫情病原的快速鉴定及溯源分析提供了参考。
- 吉彦莉王永全崔海洋靳博
- 关键词：诺如病毒腺病毒聚集性疫情病原进化分析
