袁一 作品数:6 被引量:13 H指数:2 供职机构: 上海大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 自动化与计算机技术 农业科学 更多>>
基于核酸测序流程的信息管理系统 2009年 通过分析研究核酸测序实验室的工作流程和管理体系,采用Java技术开发了一套基于实验流程管理的测序实验室的信息管理系统。系统为B/S体系,采用轻量级J2EE系统的分层架构,层次清晰、安全可靠,易于维护和扩展。系统实现了对实验流程的全方位跟踪管理,实现了对数据的采集、存储、整合、查询、导出等功能。系统的实施应用极大地提高了实验室的工作效率和管理水平。同时可为今后分子生物学、医学及其他学科的实验室信息管理系统的建设提供参考。 王超 袁一 吴坚 郭景康 王健关键词:实验室信息管理系统 LIMS 生物信息学 生物实验流程管理系统模型及其在水稻基因组测序中的应用 被引量:1 2009年 生物实验流程管理是生物实验室信息管理系统的核心,针对生物实验室实验流程灵活,数据流网络复杂等特点,设计了一套生物实验流程管理模型(Biological experiments flow management model,简称BioEFM),为生物实验室信息管理系统软件(Biology Laboratory Information Management System Software,缩写为BioLIMS)的开发提供了理论基础,大大提高了BioLIMS的开发效率。在此基础上开发的生物实验室信息管理系统软件(BioLIMS)应用于水稻基因组测序实验的信息管理中,为水稻基因组测序实验提供了灵活、便捷、高效的实验信息管理工具,为水稻基因组测序及后续的生物信息学分析奠定了良好的基础。 杨亮 赵晓飞 袁一 杨德光 王健基于J2EE的生物实验室信息管理系统的设计与实现 随着计算机技术以及自动化技术的飞速发展,生物学上的很多实验都可以交由机器来自动、高效地完成,而由此将会产生大量的数据。尤其对于那些拥有先进设备的大型实验室来说,这些自动化技术所带来的海量数据将会是呈指数级的增加。如何才能... 袁一关键词:生物实验室 信息管理 系统设计 J2EE平台 B/S模式 文献传递 生物实验信息管理模块建模技术研究 被引量:1 2010年 实验信息管理模块是生物实验室信息管理系统的核心,其设计的好坏直接关系到整个系统建设的成败。针对生物实验室实验流程灵活,数据流网络复杂等特点,研究设计了一套实验信息管理模块的模型,并将研究的模型用于基因测序实验室信息管理系统的开发并取得了成功。实践证明,该模型为实验室信息系统(LIMS)中实验管理模块的开发提供了理论支撑,并且提高了LIMS的开发效率。 袁一 王超 吴坚 王健关键词:实验室信息管理系统 建模技术 基于SNP实验流程的信息管理系统 被引量:8 2007年 针对研究单核苷酸多态性(SNP)分子生物实验的特点和需求,利用Java技术开发一套基于SNP实验流程的,并且集成TaqMan、Sequencing、Illumina 3个实验平台数据的实验室信息管理系统。系统为B/S体系,采用基于MVC(Model-View-Con- troller)模式的J2EE架构,层次清晰、界面友好、使用方便、支持多用户同时在线操作,且可跨操作系统平台(Windows/Linux/ Unix)运行。本文简要介绍系统的设计思路、体系架构、实现过程和主要功能。本系统实现了实验室数据的收集、存储、整合、查询,提高实验室的工作效率和管理水平,可为今后分子生物学、化学、医学以及其他实验学科的实验室信息管理系统的建设提供参考。 李罡 黄懿 戢茜 袁一 吴坚 王超 郭景康 王健关键词:实验室信息管理系统 单核苷酸多态性 JAVA 基于UML的生物实验室信息管理系统建模研究 被引量:4 2009年 生命科学研究中的实验流程复杂、实验数据类型繁多。在系统分析生物实验室运作流程的基础上,用数据流图(DFD)描述了一个典型生物实验室的业务流程与数据流,给出了生物实验室信息管理系统的基本功能模块以及需要管理的数据流。以资源管理模块为例,详细描述UML对生物实验室信息管理系统业务的建模过程。建模的结果方便了用户、需求分析人员与开发人员之间沟通,减轻了开发和管理的工作量,降低了软件开发的风险。 罗磊 曹顺良 王超 吴坚 袁一 郭景康 王健关键词:统一建模语言 数据流图 实验室信息管理系统