胡弘
- 作品数:4 被引量:3H指数:1
- 供职机构:东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室更多>>
- 发文基金:江苏省自然科学基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 跨平台基因表达模式分析软件系统被引量:1
- 2004年
- 构建了可在不同操作系统平台之间通用的基因表达模式分析软件系统。该软件集成了多种基因表达模式分析算法,并通过模块化设计保持了算法的可扩展性。同时具有原始数据可视化和过滤、多种相似性度量选择、聚类方法选择、表达模式匹配查询、计算结果可视化等功能。软件使用Java作为开发平台,具有良好的可移植性,为在高性能计算机上进行基因表达模式分析打下了良好的基础。
- 胡弘谢建明汪德正孙啸
- 关键词:跨平台软件系统
- 再测序DNA微阵列的等长变覆盖探针设计方法被引量:2
- 2004年
- 针对再测序DNA微阵列的寡核苷酸探针设计 ,提出了 2种等长变覆盖的方法 :①基于Tm距离的探针优化方法 ,从冗余探针集中逐步删除具有最大Tm 距离的探针 ;②应用遗传算法 ,将候选探针集编码为染色体 ,通过选择、交叉和变异等遗传操作得到最大适应度的探针集 .这 2种方法 ,都能在探针长度相等的情况下 ,通过改变相邻探针之间的覆盖度使探针的Tm 值尽可能保持一致 .实验结果表明 :等长变覆盖法得到的探针集整体优于等长移位法和变长变覆盖法的结果 ,具有更好的杂交条件一致性 .
- 谢建明方辉胡弘陆祖宏孙啸
- 关键词:探针设计遗传算法
- 基因表达数据挖掘方法研究
- 基因表达是指细胞在生命过程中,把储存在DNA序列中的遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子的过程.细胞中各个基因之间存在着复杂的表达与调控关系.表达型基因芯片可检测出以极低水平出现的mRNA,且易于同时监...
- 胡弘
- 关键词:基因表达数据挖掘可视化
- 文献传递
- 利用序列统计特征分析基因组序列
- 本文从一个新的角度来分析DNA序列,探索DNA序列的统计特征,研究基于特征的序列分析方法。利用序列的两个统计特征,即核苷酸单词频率特征(WF)和碱基关联性特征(BBC),分析基因组序列,发现核苷酸单词频率特征可用于辨别基...
- 孙啸傅静焦典胡弘周士新谢建明
- 关键词:生物信息学
- 文献传递