石之光
- 作品数:3 被引量:11H指数:1
- 供职机构:贵州大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 植物ADH基因家族的生物信息学分析及棉花Zn结合脱氢酶的克隆与原核表达
- 在本研究中,我们用生物信息学的方法分析了玉米等物种ADH的保守功能域、蛋白二级结构和进化关系。分析证实,植物ADH通常含有3个保守功能域,它们是具有GroES结构的ADH-N结构域,Rossmann折叠NAD(P)(+)...
- 石之光
- 关键词:生物信息学开放阅读框棉花
- 文献传递
- 乙醇脱氢酶(ADH)家族生物信息学分析被引量:9
- 2009年
- 本研究用生物信息学的方法分析了玉米等7个物种ADH的保守功能域、蛋白二级结构和进化关系。分析证实,植物ADH通常含有3个保守功能域,它们具有GroES结构的ADH_N结构域,Rossmann折叠NAD(P)(+)结合蛋白和锌结合位点,这3个保守结构在物种中具有相当的保守性。二级结构的分析表明,在我们研究的物种中,每个物种的两个ADH同工酶折叠情况大体相同,物种间蛋白二级结构也趋向一致。通过构建系统进化树,分析了供试物种中ADH以及ADH两个同工酶间的进化关系。初步显示,在进化上,单、双子叶植物源自不同的ADH祖先。双子叶植物ADH在物种间具有差异;而在单子叶植物不同物种其ADH同工酶出现分化。
- 石之光叶磊巩鹏涛赵德刚柳参奎
- 关键词:乙醇脱氢酶生物信息学保守结构域蛋白质二级结构
- 控制棉花长绒和短绒纤维生长发育的基因型分析被引量:1
- 2009年
- 本研究利用在纤维性状上有明显差异的4个棉花种质DP99B(毛籽棉,陆地棉)、FLS2123(裸籽棉,陆地棉)、ZYS20(光籽棉,陆地棉)以及VH8(光籽棉,海岛棉)作为棉花实验材料。利用以上4个棉花材料作为亲本组配了4个杂交组合,其组合分别为:DP99B(毛籽)×FLS123(裸籽)、DP99B(毛籽)×ZYS20(光籽)、ZYS20(光籽)×FLS123(裸籽)、DP99B(毛籽)×VH8(光籽),获得以上4种组合的F1代种子及F2代群体种子,分析F1、F2种子棉纤维性状,试图弄清控制棉花长短纤维分化和发育的基因型。根据本研究4种杂交组合其F1及F2分离表型结果,推定供试亲本材料的长绒生长发育的基因型可能为:DP99B(毛籽)的基因型为:LiALiA或LiAliA及LiDLiD或LiDliD;ZYS20(光籽)的基因型为:LiALiA或LiAliA及LiDliD或LiDliD;FLS2132(裸籽)的基因型为:LiALiALiDliD;VH8(光籽)的基因型为LiALiA或LiAliA及LiDLiD或LiDliD。4个组合的长绒的长度上都成较好的正态分布,认为棉花长纤维长度的发育是一种数量性状遗传。就短绒而言,在4个组合的F2代群体里的,ZYS20×FLS2132全为光籽、DP99B×VH8全为毛籽没有出现分离,DP99B×FLS2132和DP99B×ZYS20出现了分离,分析以上分离的具体情况并结合以前研究者结论,可以推断控制短绒和长绒分化和发育的基因并非同一组基因。推定出4个亲本DP99B(毛籽棉)、FLS2123(裸籽棉)、ZYS20(光籽棉)、VH8(光籽棉)控制短绒发育的几种可能的基因型。DP99B可能的基因型为:ii,susu,Ft1Ft1,Ft2Ft2,Ft3Ft3,FcFc;ii,susu,Ft1Ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc;VH8可能的基因型为:Ii,Susu,Ft1Ft1,Ft2Ft2,Ft3Ft3,FcFc;Ii,susu,Ft1Ft1,Ft2Ft2,Ft3Ft3,FcFc,ZYS20可能的基因型为:Ii,Susu,Ft1ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc;Ii,susu,Ft1ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc;ii,Susu,ft1ft1,ft2ft2,Ft3Ft3,fcfc;FLS2132可能的基因型为:II,SuSu,Ft1ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc;Ii,Susu,Ft1ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc。同时进一步推定出其4个组合DP99B×FLS123,DP99B×ZYS20,ZYS20×FLS123,DP99B×VH8其F1代控制短绒发育的基因
- 叶磊石之光巩鹏涛李永起方宣钧
- 关键词:短绒基因型分析