杨金权
- 作品数：30 被引量：286H指数：10
- 供职机构：上海海洋大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金上海市高校选拔培养优秀青年教师科研专项基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析被引量：21
- 2009年
- 应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术及细胞色素b(Cytb)基因序列,分析了长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼(Boleophthalmus pecinirostris)群体遗传结构及种群历史,结果显示这一区域大弹涂鱼群体的遗传多样性水平很高。(1)RAPD分析结果:从100个10碱基随机引物中筛选出30个多态性引物,对长江口九段沙湿地、浙江舟山定海、福建霞浦群体各20个体进行RAPD分析,3个群体分别获得236、270、274条带,共301个有效位点。3群体多态位点比例(P)、Nei基因多样性指数(H)、Shannon多样性指数(I)分别在93.02%—96.35%、0.3890—0.4219、0.5618—0.6044。分子方差分析(AMOVA)表明,大弹涂鱼群体间存在显著的遗传分化(Fst=0.03004-0.03254,P<0.05),但仅3.2%的遗传变异来自群体间。(2)Cytb基因序列分析结果:从采自九段沙、定海、霞浦及浙江慈溪的42尾大弹涂鱼样本中,共获得33个Cytb基因单倍型(序列长1141bp)。4群体的平均单倍型多样性(h)、核甘酸多样性(π)分别为0.9814、0.0048。4群体间的遗传分化指数Fst为0.00043—0.07814,仅1.93%的变异来自群体间(AMOVA分析),而基因交流值却达14.50—30.79,群体间K2-P遗传距离为0.0040—0.0056,从而显示大弹涂鱼群体间没有发生明显的地理分化。以Cytb基因序列构建的NJ树揭示4个群体的个体组成2个谱系,但这2个谱系与地理分布并不相关。中性检验、错配分析和网络亲缘关系分析皆表明大弹涂鱼群体有过种群扩张,扩张时间约在更新世末期的0.057—0.023百万年前。
- 刘至治杨金权王正琦唐文乔
- 关键词：大弹涂鱼细胞色素B长江口
- 基于线粒体Cyt b基因序列变异的克孜河塔里木裂腹鱼和斑重唇鱼遗传多样性被引量：19
- 2009年
- 采用线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列,分析了采自新疆克孜河3个群体(斯木哈纳SM、牙师YS、卡拉贝利KL)的塔里木裂腹鱼(Schizothoraxbiddulphi)41尾个体及1个斑重唇鱼(Diptychus maculates)群体(斯木哈纳)23尾个体的种群遗传多样性和遗传结构。结果显示,塔里木裂腹鱼检测到6个碱基变异位点,定义了4种单倍型,平均单倍型多样性指数及核苷酸多样性指数分别为0.525 4和0.001 16。分子变异分析(AMOVA)结果提示,塔里木裂腹鱼的遗传变异全部发生于群体内部;群体间Kimura-2-parameter遗传距离、分化指数(Fst<0.085 25)和基因流(Nm>3.18)都显示3个群体没有种群分化,属于单一种群。斑重唇鱼检测出7个变异位点,定义了8个单倍型,平均单倍型多样性指数与核苷酸多样性指数分别为0.830 1和0.001 13。研究表明,克孜河的塔里木裂腹鱼和斑重唇鱼均处于很低的遗传多样性水平,物种维持力较弱。
- 阎雪岚杨金权唐文乔王丽卿阿达来提.尔迪
- 关键词：CYT
- 从线粒体控制区全序列变异看短颌鲚和湖鲚的物种有效性被引量：92
- 2007年
- 经克隆测序获得我国七丝鲚(Coiliagrayii)、凤鲚(C.mystus)、刀鲚(C.nasus)和短颌鲚(C.brachygnathus)以及太湖湖鲚(C.nasus taihuensis)等4个种和1亚种32尾个体的mtDNAD-loop区全序列,以日本鳀(Engraulis japonicus)和秘鲁鳀(E.ringens)为外类群构建了中国鲚属的分子系统发育树,并讨论了短颌鲚和湖鲚的物种有效性。结果显示,七丝鲚的D-loop区全序列长1,208bp,凤鲚1,279-1,361bp,刀鲚1,252-1,290bp,短颌鲚1,214-1,252bp,湖鲚1,252-1,442bp,除七丝鲚外的其他种类个体间均表现出序列长度的多态性。短颌鲚、刀鲚和湖鲚三者间的平均K2-P遗传距离仅为0.011-0.020,明显小于它们与凤鲚、七丝鲚及外类群间的遗传距离(0.051-0.349)。以邻接法和最大简约法构建的系统发育树表明,刀鲚、短颌鲚及湖鲚均未各自构成单系,而是共同构成一个单系群,三者并未发生显著分化。研究表明,短颌鲚和湖鲚为刀鲚的淡水生态型种群,并非有效物种。系统发育分析表明,中国鲚属3个有效物种间以凤鲚最为原始,刀鲚和七丝鲚为姐妹群,处于较进化的位置。推测凤鲚可能是鲚属祖先种最早从起源中心扩散到西北太平洋的后裔,而刀鲚和七丝鲚则是凤鲚在演化过程中分别适应寒冷和温暖气候而分化出的物种。
- 唐文乔胡雪莲杨金权
- 关键词：物种有效性线粒体控制区分子系统发育
- 鱼类学国家精品课程建设的探索与实践被引量：4
- 2009年
- 本文介绍了近年来上海海洋大学《鱼类学》课程体系改革的探索与实践活动,阐述了鱼类学教学改革的总体思路,着重介绍了鱼类学课程的知识模块及其顺序改革、课程的重点、难点及其解决办法、实践教学的设计思想与知识模块安排,特别强调了校园鱼文化环境在《鱼类学》国家精品课程建设中的作用。
- 唐文乔龚小玲鲍宝龙钟俊生杨金权
- 关键词：鱼类学国家精品课程教学改革与实践
- 鮈亚科鱼类分子系统发育、演化过程及生物地理学研究
- 鮈亚科(Gobioninae)是一群集中分布东亚水系,仅个别属跨欧亚分布的中小型淡水鱼类,有近30 个属和亚属,190 余种及亚种,是鲤科(Cyprinidae)中最大的亚科之一。由于种类颇多,形态、生态和行为差异极大,...
- 杨金权
- 关键词：鱼类鲤科系统发育生物地理学
- 文献传递
- 团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析被引量：10
- 2011年
- 为了解团头鲂MHCⅠ类基因的结构,采用cDNA末端快速扩增(Rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次成功克隆了团头鲂"浦江Ⅰ号"F0基础群体及选育F8世代的MHCⅠ类基因,共获得3条cDNA全长序列。序列全长为2 040～2 079 bp,含有87～102 bp的5'-UTR,1 035～1 044 bp的编码区(包括信号肽,alpha 1、alpha 2和alpha 3三个结构域,跨膜区和胞质区)及911～946 bp的3'-UTR区,分别编码347、344个氨基酸。F8世代序列的核苷酸/氨基酸的同源性很高,为89.0%/93.0%,而与F0世代的同源性较低(75.3%～77.0%和71.1%～71.4%),呈现出明显的分子多态性。分析表明,团头鲂具有经典的MHCⅠ类分子的空间结构,与人类HLA-A2的抗原肽结合区的晶体结构相比,二者的差异主要集中在5个(I～V)区上。在Neighbor-joining(NJ)法构建的分子进化树中,团头鲂与草鱼的亲缘关系最近,与鲑鳟鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类及人类的亲缘关系则渐远。RT-PCR组织表达分析表明,团头鲂MHCⅠ类基因在所检测的的8个组织中均表达,在鳃、头肾和血液中有较强的转录本,中等强度表达于肝脏和脾脏,在后肾、肠和肌肉中表达较弱。
- 马晓茜刘至治李思发唐文乔杨金权
- 关键词：团头鲂主要组织相容性复合体克隆
- 上海5条骨干人工河流鱼类本底调查及群落结构分析被引量：1
- 2023年
- 为摸清上海黄浦江5条骨干人工河流开挖半个世纪以来形成的鱼类物种资源家底,文章于2021年6月(夏季)和11月(秋季)用刺网对20个断面作了采集,获得鱼类标本13379尾,经鉴定有60种,隶属于8目17科45属。其中,鲤形目有2科28属41种,鲈形目7科8属8种;洄游鱼类2种,河口鱼类8种,其余均为淡水鱼类。IRI≥1000的优势种合计有9种,刀鲚(Coilia nasus)是5条河流共有的优势种。ABC曲线反映除金汇港外,其他河流总体上以中小型鱼类为主体,鱼类群落受到了严重干扰。βc指数和βr指数均反映浦东川杨河与大治河之间的鱼类组成相异性最大,浦南金汇港与龙泉港之间的鱼类组成相异性最小。20个断面可分为3组,D1和Z2断面为组Ⅰ,金汇港、龙泉港和除Z2断面的大治河为组Ⅱ,川杨河和除D1断面的淀浦河为组Ⅲ,似鳊(Pseudobrama simoni)、刀鲚、鲫(Carassius auratus)和?(Hemiculter leucisculus)是造成组间鱼类群落结构差异性的主要分歧种。研究认为,这5条人工骨干支流保存了比黄浦江源头、干流及自然支流更多的鱼类物种资源,人口密度可能是造成所在河流鱼类群落结构出现明显空间差异性的重要原因。
- 陈振锋唐文乔赵振官张彦彦龚珑唐振张亚郭弘艺郭弘艺杨金权
- 关键词：鱼类群落结构
- 基于线粒体COⅠ基因DNA条形码的中国鲚属物种有效性分析被引量：36
- 2010年
- 分析了150尾刀鲚Coilia nasus、湖鲚C.nasus taihuensis、短颌鲚C.brachygnathus、七丝鲚C.grayii及凤鲚C.mystus个体的COⅠ基因DNA条形码序列变异。结果显示,150条COⅠ基因条形码序列包含63种单倍型,单突变位点主要集中在100bp和600bp附近。刀鲚、短颌鲚和湖鲚群体间的遗传距离在0.253%～0.557%之间,显著低于COⅠ基因DNA条形码鉴别不同物种2%的遗传距离阈值,表明这3个群体应为同一物种。但是凤鲚两群体间的遗传距离为5.08%,大于2%的鉴别阈值,显示凤鲚两群体可能达到了种或亚种级差异水平。以日本鳀Engraulisjaponicus为外群,用邻接法、最大简约法和最大似然法构建了分子系统树显示,刀鲚、湖鲚和短颌鲚群体聚在一起,未能各自形成单系;凤鲚根据地理分布聚为两支;七丝鲚则聚成单系。研究表明COⅠ基因条形码技术可用于我国鲚属物种的鉴定。
- 周晓犊杨金权唐文乔刘东
- 关键词：DNA条形码分子系统树物种鉴定
- 大弹涂鱼群体遗传多样性及种群历史分析
- 应用RAPD技术及Cyt b基因序列,分析了长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼(Boleophthalmas petinirostris)群体遗传结构及种群历史,结果显示这一区域大弹涂鱼群体的遗传多样性水平都很高。(1)RA...
- 刘至治杨金权王正琦唐文乔
- 关键词：大弹涂鱼长江口
- 文献传递
- 基于线粒体控制区的序列变异分析中国东南部沿海凤鲚种群遗传结构被引量：22
- 2009年
- 为了解中国东南部沿海凤鲚(Coilia mystus)的种群遗传多样性和遗传结构,本文分析了长江口(CJ)、钱塘江口(QT)、闽江口(MJ)和九龙江口(JL)4个凤鲚地理群体的mtDNA控制区561bp片段的序列变异。65尾样本共检测到28个单元型。4个群体总的单元型多样性和核苷酸多样性均较高(h=0.9433±0.0168,π=0.0317±0.0158),但单个群体的核苷酸多样性水平却很低,其中以CJ最高(π=0.0080±0.0046),MJ最低(π=0.0015±0.0013)。MJ与JL群体之间以及CJ与QT群体之间的平均K2P遗传距离很小,分别为0.3%和0.8%;而CJ、QT分别与MJ、JL群体之间的遗传距离均较大,达到了6%。采用最大似然法(ML)、最大简约法(MP)和邻接法(NJ)分别构建的单元型间的系统发育树揭示,4个凤鲚群体构成CJ-QT和MJ-JL2个支系,且具有极高的支持率。单元型的网络分析也显示这两个支系间有高达28步的突变次数。AMOVA分析显示大部分的遗传变异来自这两支系群体间(90.77%),表明凤鲚群体间存在着显著的地理分化。种群分化指数和基因流分析也表明,支系间群体有着明显的遗传分化(FST>0.9,Nm<0.03)。所有分析结果支持所研究的凤鲚标本属于两个不同的地理种群,且种群的分化至少已达到亚种水平。采用BEAST和TRACER软件得到凤鲚两个亚种的最近共同祖先约在0.34-0.46百万年前,处于更新世晚期,推测可能是第四纪晚期的气候旋回和海平面的升降导致了凤鲚的种群分化。
- 阎雪岚唐文乔杨金权
- 关键词：东南沿海线粒体控制区
