杨琴玲
- 作品数:4 被引量:22H指数:2
- 供职机构:上海海洋大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金上海市重大科技攻关项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 澳洲鳗鲡微卫星分子标记的筛选与检测被引量:11
- 2009年
- 采用小片段克隆法构建了澳洲鳗鲡(Anguilla australis)的部分基因组文库,并用地高辛标记的(CA)15作探针筛选阳性克隆,共获得76条微卫星序列,其中10次以下CA连续重复序列占83.67%,没有检测到30次以上的连续重复序列。根据微卫星序列两端足够长的侧翼序列,设计引物55对,选择合成引物26对,用澳洲鳗鲡3个个体的混合基因组进行引物筛选,其中的18对具有清晰的扩增条带。将筛选出的18对引物对澳洲鳗鲡1个群体的40个个体进行了遗传多样性分析,其中1对引物扩增产物为单态,17对扩增产物呈现多态;17对扩增多态的引物在40个个体中扩增出等位基因数目为5~14,平均为9个。该澳洲鳗鲡群体的PIC、Ho、He的平均值分别为0.7157、0.6779、0.7374,所有位点均符合哈迪-温伯格平衡(P=0.05),结果证明这17个微卫星位点适于澳洲鳗鲡群体结构的研究分析。
- 龚小玲李思发蔡完其杨琴玲王浩
- 关键词:微卫星分子标记
- 草鱼中国土著群体与欧美日移居群体遗传差异的线粒体序列分析被引量:9
- 2009年
- 草鱼是中国的土著鱼类,自20世纪60年代以来已被移居到100多个国家和地区,主要用来控制水草或水产养殖。本研究通过线粒体D-Loop区(764bp)和COII+tRNA基因(719bp)序列分析,了解草鱼的中国土著群体(长江、珠江、黑龙江)和国外移居群体(匈牙利多瑙河、美国密西西比河、日本利根川河)之间以及各地方群体间的遗传差异。结果表明,中国土著草鱼群体的遗传变异高于国外移居群体;分子方差分析(AMOVA)表明,不同草鱼群体的遗传变异主要来自群体内,而不同地域间的差异极少;群体两两间Fst值比较表明,大多数群体之间遗传差异极显著;由TCS构建的单倍型网络结构图显示,长江草鱼群体是最原始的群体,其他水系草鱼均由长江群体演化而来;通过基因流分析发现,匈牙利多瑙河群体和日本利根川河群体来自长江和黑龙江群体,美国密西西比河群体除引自长江、黑龙江水系外,还有部分引自于珠江水系。
- 宋晓李思发王成辉徐嘉伟杨琴玲
- 关键词:草鱼
- 鳙的线粒体基因组核苷酸全序列分析(英文)被引量:2
- 2009年
- 对采集自我国长江的鳙的线粒体DNA全序列进行了测定。结果表明,鳙的线粒体DNA全长为166221bp,其碱基因组成为A=31.6%;C=27.1%;G=16.0%;T=25.3%,A+T含量为56.9%。鳙线粒体基因组的排列、结构和组成与其它鲤科鱼类相似,包括37个基因,即13个蛋白质编码基因,2个rRNA基因,22个tRNA基因和一个非编码控制区(D-loop)。在13个蛋白编码基因中,除ND6由轻链编码外,其余12个基因均由重链编码。COI基因的起始密码子为GTG,而其它12个蛋白编码基因的起始密码子均为ATG。
- 杨琴玲李思发徐嘉伟陈琴王成辉
- 关键词:鳙鱼线粒体基因组全序列基因排列
- 鳙国内土著群体和美欧移居群体mtDNA遗传差异与SSR标记分析
- 一、国内外鳙不同群体线粒体DNA遗传差异分析
鳙是中国重要淡水鱼类之一,自上世纪60年代以来,已被移植到至少70多个国家和地区,并在当地许多河流中建立各自的生态系统。移植后鳙群体遗传多样性和遗传变异的情况还未见报道...
- 杨琴玲
- 文献传递