杨桂梅 作品数:25 被引量:102 H指数:7 供职机构: 上海海洋大学 更多>> 发文基金: 上海市教育委员会重点学科基金 上海市教育发展基金 引进国际先进农业科技计划 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 更多>>
Ⅳ型分泌系统和IS911转座子在产TTX气单胞菌质粒上的发现 关于TTX起源于河豚等体内共生的产TTX细菌的假说已经越来越普遍。很多进化关系不是很密切的产TTX的细菌从动物体和环境中分离出来,提醒我们基因水平转移可能存在于这些细菌中。本文通过对来自共生或寄生在暗纹东方鲍体内的产TT... 刘静 杨桂梅 鲍宝龙关键词:河豚毒素 水平基因转移 文献传递 暗纹东方鲀体内细菌类群组成分析及产河鲀毒素菌株的筛选 关于河鲀鱼体内河鲀毒素的起源,至今为止仍无定论。近二十年来,大量研究发现寄生于鱼体内的部分细菌被证实能够产河鲀毒素。许多研究者认为这些细菌主要是通过食物链进入鱼体。为了了解饵料对鱼体内细菌组成的影响,本文以暗纹东方鲀为研... 杨桂梅关键词:河鲀毒素 暗纹东方鲀 菌株筛选 文献传递 16S rDNA文库法分析草鱼肝胰脏和胆汁细菌群落组成 被引量:8 2010年 利用16S rDNA文库随机测序法分析了草鱼肝胰脏和胆汁细菌菌落组成,结果表明,在肝胰脏中共鉴定出19种共生细菌,分别隶属于气单胞菌属、假单胞菌属、摩根菌属、不动杆菌属、弧菌属和变形杆菌属。气单胞菌属和假单胞菌属为优势属,气单胞菌属的丰度为36.17%,假单胞菌属为31.91%。其中,气单胞菌属的GZ16和假单胞菌属的GZ9菌株丰度最高,均为12.77%。在胆汁中共鉴定出10种共生细菌,分别隶属于气单胞菌属、假单胞菌属、摩根菌属和变形杆菌属。气单胞菌属和假单胞菌属为优势属,气单胞菌属的丰度为35%,假单胞菌属为27.5%。其中,变形杆菌属的DN1菌株丰度最高,为25%。肝胰脏中只有10.5%的细菌群落与胆汁的细菌群落相似,胆汁中只有20%的细菌群落与肝胰脏相似,表明草鱼肝胰脏和胆汁有各自特有的共生细菌群落。本研究结果,为进一步探讨肝胰脏和胆汁共生细菌的生理功能,以及细菌与宿主草鱼之间的协同进化提供了基础。 蒋燕 鲍宝龙 谢彩霞 杨桂梅关键词:草鱼 肝胰脏 胆汁 抑制差减杂交法克隆牙鲆变态早期差异表达的基因 被引量:7 2006年 为了克隆变态早期牙鲆头部差异表达的基因,采用抑制差减杂交法,以变态前的仔鱼头部表达的RNA作为驱动RNA,建立了牙鲆变态早期的差减cDNA文库,并利用相对定量RT-PCR对其进行了筛选。差减库的平均插入片段558bp左右,阳性率为81.8%。随机测定的45个克隆,在剔除假阳性克隆后,共得到22个不同的基因,其中13个为已知cDNA的同源基因,而另外9个为已知蛋白的同源基因,分别为prolactin receptor-like,COL1A1,M-3muscarinic receptor,Sfrs3,tropomyosin,ribosomal protein L27,ribosomal protein S12,GAPDH,COL1A3。在所有22个基因中,COL1A1基因在差减库中的分布频率最高,为22.2%。RT-PCR检测结果表明,在所检测的11个基因中,所有基因在右眼移动前后的牙鲆头部均有表达,只是体现在表达水平上的不同。 鲍宝龙 杨桂梅 施志仪 任大明关键词:抑制差减杂交 牙鲆 新生和格特隐球菌种、变种、基因型和交配型的分子鉴定 被引量:3 2008年 目的评价限制性片段长度多态性(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)方法检测α和a交配型位点内GEF1α/a基因片段在鉴定新生和格特隐球菌种、变种、基因型和交配型中的作用。方法筛选交配型位点内的GEF1α/a基因进行PCR—RFLP分析。根据各基因型和交配型参考株的GEF1α/a基因保守序列设计引物,扩增受试新生和格特隐球菌GEF1α/a基因部分片段。利用DNAMAN和Vector NTI软件进行序列比对、限制性图谱分析、限制性内切酶的筛选和模拟电泳。选择EcoT14 Ⅰ和Hap Ⅱ限制性内切酶分别对125株新生和格特隐球菌的GEF1α/a基因扩增片段进行RFLP分型。结果所有受试的82株新生隐球菌和43株格特隐球菌均扩增出1300bp大小片段,而罗伦隐球菌、白念珠菌、热带念珠菌、近平滑念珠菌、克柔念珠菌、光滑念珠菌、阿萨希毛孢子菌、烟曲霉和黄曲霉参考株均扩增阴性。RFLP分型准确鉴定所有125株新生和格特隐球菌的种、变种、基因型和交配型。结论针对GEF1α/a基因片段的PCR—RFLP方法特异性高、稳定性好,适用于新生和格特隐球菌种、变种、基因型和交配型的同步和快速鉴定以及进一步的分子流行病学分析。 冯晓博 姚志荣 杨桂梅 凌波 任大明关键词:隐球菌属 基因型 暗纹东方鲀几种组织中可培养细菌的组成分析(英文) 被引量:4 2008年 采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方鲀的表皮、肠道和河鲀毒素累积组织(肝和卵巢)中可培养细菌的群落组成。根据分子系统发育分析,共鉴定出45种可培养细菌,在这些细菌中,以变形细菌的gamm a亚群占多数,其它分别隶属于低GC含量革兰氏阳性菌和高GC含量革兰氏阳性菌。摄食不同饵料的暗纹东方鲀,其肠道、表皮或河鲀毒素累积组织中的细菌菌落组成是不同的,但不管是摄食人工配合饲料或天然饵料,在暗纹东方鲀的肠道、表皮或河鲀毒素累积组织中,均发现已有报道的可产河鲀毒素的细菌类群,表明饵料来源对暗纹东方鲀的河鲀毒素产生不是必需的。 杨桂梅 鲍宝龙 李会荣 唐文乔 任大明关键词:暗纹东方鲀 RDNA 产河豚毒素的气单胞菌从暗纹东方鲀组织分离、发酵培养和所产河豚毒素的检测方法 一种产河豚毒素的气单胞菌Aeromonas molluscorum从暗纹东方鲀Takifugu fasciatus组织分离、发酵培养和所产河豚毒素的检测方法,包括细菌分离、细菌鉴定、细菌发酵培养、气单胞菌所产河豚毒素的竞... 鲍宝龙 杨桂梅PCR-DGGE分析不同龋敏感儿童牙菌斑内口腔链球菌属菌群组成 目的:应用PCR-DGGE技术,分析不同龋敏感儿童牙菌斑内口腔链球菌属菌落组成多样性。方法:收集无龋、中龋和高龋儿童牙菌斑各15例,提取细菌总DNA,扩增链球菌属rnpB特征序列,DGGE分离,测序并与核苷序列数据库进行... 姜云涛 梁景平 李超伦 杨桂梅 张明珠 任大明关键词:菌斑 细菌群落 变性梯度凝胶电泳 文献传递 Al(OH)3和CpG ODN免疫佐剂对丙型肝炎病毒多表位抗原PCX3疫苗免疫效果的影响 被引量:3 2009年 以HCV蛋白疫苗PCX3为抗原,分别加入Al(OH)3佐剂,CpG ODN佐剂,以及两种佐剂联合作用的复合佐剂,对雄性六周龄BALB/c小鼠进行常规免疫.与其他免疫组相比,Al(OH)3和CpG ODN复合佐剂与PCX3抗原联合作用组产生的特异性IgG(1×106)和IgM(1×105)抗体滴度最高、持续时间最长;自然杀伤效应(CTL)实验显示该组小鼠诱发的CTL杀伤效应(40.91%)显著高于其他免疫组(P<0.05);流式细胞仪对小鼠淋巴细胞亚群进行分型分析发现:从第2周开始,该组小鼠体内CD4+/CD8+细胞比值(3.26)显著高于PCX3抗原单独作用组(P<0.05).结果表明,Al(OH)3和CpG ODN复合佐剂可以从体液免疫和细胞免疫两方面对HCV蛋白疫苗PCX3的免疫效果进行增强,并且具有协同效应. 祁淑红 杨桂梅 谢匡成 刘龙丁 任大明关键词:AL(OH)3 CPG ODN 温州乐清湾三个泥蚶群体遗传多样性的初步研究 被引量:8 2006年 采用形态判别分析和RAPD分析相结合的方法,对温州乐清湾地区三个泥蚶群体:乐清湾泥蚶,福建泥蚶,和韩国泥蚶三个群体的遗传多样性进行了初步的分析。结果表明:(1)在分子水平上,乐清湾泥蚶群体与韩国群体的亲源关系最为接近,而与地理位置更为接近的福建群体亲缘关系较远。(2)根据形态判别分析,乐清湾泥蚶群体与福建泥蚶群体亲缘最近,而与韩国较远。(3)韩国泥蚶群体的遗传多样性最高,乐清湾泥蚶群体次之,福建泥蚶群体最低。三者的平均遗传杂合度和群体内的遗传距离分别为0.275 4和0.304 8,0.257 5和0.240 1,以及0.247 3和0.211 5,但总体来说,三者的遗传多样性都保持比较高的水平。(4)随机引物S.418,S.359和S.431扩增的结果有乐清湾泥蚶群体特有的条带,其可以作为区分乐清湾泥蚶与其它两种泥蚶的分子标记。 徐义平 孙开练 杨桂梅 李琼文 鲍宝龙 任大明关键词:泥蚶 RAPD 亲缘关系