李锡花
- 作品数：3 被引量：13H指数：2
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- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 棉花纤维伸长相关基因的RNA-Seq转录组分析
- 棉花是世界性的重要经济作物，它既是重要的纤维作物、油料作物和盐碱地先锋作物，又是研究纤维发育、多倍体起源的模式作物，也是纺织、精细化工原料和重要的战略物资。转录组测序技术(又称RNA-Seq)，是最近发展起来的利用深度测...
- 李锡花
- 关键词：棉花纤维伸长转录组QRT-PCR
- 文献传递
- 棉花SAUR基因家族分析与功能验证
- 棉花是重要的经济作物之一,棉纤维为纺织行业提供了自然原材料。面对着纺织行业对棉花质量要求的不断提高,棉花纤维品质改良成为棉花育种的主攻目标之一。棉花纤维是研究单细胞伸长、次生壁的合成与纤维合成的理想模式系统,基于以前对纤...
- 李锡花
- 关键词：棉花纤维伸长转录组
- 文献传递
- 棉花纤维发育早期RNA-Seq转录组分析被引量：9
- 2013年
- 为了揭示棉花纤维发育早期基因表达变化情况,本研究以纤维长度存在显著差异的两个陆海回交近交系NMGA-062(32.58 mm)和NMGA-105(27.06 mm)为材料,利用Illumina HiSeqTM 2000对0、3 DPA(Dayspost anthesis)的胚珠及10 DPA的纤维进行RNA-Seq测序。六个文库进行拼接,共得到长度大于200 bp的Unigene 98464个,总长度约为88.2 Mb。对10 DPA的纤维转录组数据进行差异表达分析,共筛选到1931个差异表达基因,1536个Unigene上调,395个Unigene下调。GO(Gene ontology)功能显著性富集和Pathway显著性富集分析发现,差异表达基因富集在脂质转移活性(Lipid transport activity)分子功能组和脂质代谢通路(Lipid metabolism pathway),由此推测脂类相关基因可能在纤维伸长发育过程中起重要作用。通过对棉纤维发育10 DPA基因转录水平差异比较分析,为深入开展纤维伸长相关功能基因的克隆和功能验证提供了丰富的资源,并为揭示棉花纤维伸长的机制打下了坚实的基础。
- 李锡花吴嫚于霁雯张金发范术丽宋美珍庞朝友喻树迅
- 关键词：RNA-SEQQRT-PCR
