李滢
- 作品数：42 被引量：525H指数：12
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划北京市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学更多>>
- 甘草酸合成生物学元件初探:甘草法呢基焦磷酸合酶基因的克隆及序列分析
- 甘草酸是中药甘草(Glycyrrhiza uralensis)的主要有效成分,法呢基焦磷酸合酶(famesyl-diphosphate synthase,FPS)是甘草酸合成途径中关键酶之一。根据甘草转录组数据设计引物,...
- 李滢牛云云宋经元罗红梅李秋实孙超
- 关键词：甘草甘草酸基因克隆
- 赤芝萜类合酶GL-TS3编码基因cDNA序列及其应用
- 本发明涉及赤芝萜类合酶GL-TS3编码基因cDNA序列及其应用，所述赤芝萜类合酶GL-TS3编码基因的cDNA序列如Seq？ID？No.2所示，编码347个氨基酸。本发明通过赤芝萜类合酶基因GL-TS3转化大肠杆菌，以内...
- 孙超陈士林曾欣宜王丽芝李滢
- 文献传递
- 近地摄影在样方调查中的应用研究
- 样方的客观性对保证研究结果的科学性具有重要意义,适宜方法是制约其结果客观性的瓶颈,本文对样方为基础的资源调查及监测方法进行了探讨,提出引入近地摄影的方法,以提高样方调查的准确性,减少工作的人为误差,加强对调查或监测工作的...
- 周应群陈士林李西文李滢
- 关键词：中药资源样方盖度
- 文献传递
- 基于高通量测序454 GS FLX的丹参转录组学研究被引量：93
- 2010年
- 本研究应用新一代高通量测序技术454GS FLX Titanium对2年生丹参根的转录组进行测序,研究其基因表达谱,挖掘其功能基因。获得46722表达序列标签(express sequence tags,EST),序列平均长度414bp,与Sanger测序的长度相当。所得序列与GenBank丹参EST合并拼接,获得18235条unigene,其中,454高通量测序发现了13980条新的unigene。数据库中的序列同源性比较表明,其中73.0%(13308条)与其他生物的已知基因具有不同程度的同源性。通过BLAST与Gene Ontology分析获得了可能参与丹参酮合成的序列27条(编码15个关键酶),参与丹酚酸合成的序列29条(编码11个关键酶),细胞色素P450序列70条,转录因子序列577条。454高通量测序技术作为药用植物功能基因组研究的重要手段可在丹参功能基因的发现中发挥重要作用,这些基因的发现为丹参酮和丹酚酸类化合物生物合成研究奠定了基础,同时也为丹参的转录组研究提供了基础数据。
- 李滢孙超罗红梅李西文牛云云陈士林
- 关键词：丹参表达序列标签转录组
- 薯蓣和叉蕊薯蓣叶绿体基因组及特异性DNA条形码鉴定序列筛选研究被引量：8
- 2018年
- 前期研究表明,目前常用的DNA条形码序列对薯蓣属物种的鉴定效率低.本研究利用高通量测序技术测定了薯蓣(Dioscorea opposita)和叉蕊薯蓣(D.collettii)叶绿体基因组,完成了其物理图谱绘制,基因组结构特征解析,特异性DNA条形码序列的筛选.薯蓣和叉蕊薯蓣叶绿体基因组总长度分别为152963和153870 bp,均包含两个反向重复区(IRs)、一个大单拷贝区(LSC)和一个小单拷贝区(SSC)4部分.薯蓣和叉蕊薯蓣均含有125个基因,其中包含87个蛋白编码基因、30个t RNA和8个r RNA.薯蓣和叉蕊薯蓣的GC含量分别为37.04%和37.17%,经多序列比对发现薯蓣属叶绿体基因组中非编码区变异高于保守的蛋白编码区域,LSC区、SSC区变异大于IR区,筛选出了10个潜在的适合作为鉴定薯蓣属植物的特异性DNA条形码序列,其中包括5个蛋白编码基因和5个基因间隔区.系统进化树显示,叶绿体全基因组序列也可作为薯蓣属物种鉴定的超级条形码.本研究为薯蓣属系统进化以及物种鉴定等领域的研究提供依据.
- 马双姣周建国李滢陈新连吴明丽孙伟李永华宋经元姚辉
- 关键词：薯蓣叶绿体基因组DNA条形码
- 甘草酸合成生物学元件初探：甘草法呢基焦磷酸合酶基因的克隆及序列分析
- 2013年
- 甘草酸是中药甘草的主要有效成分,法呢基焦磷酸合酶(FPS)是甘草酸合成途径中关键酶之一。根据甘草转录组数据设计引物,对FPS基因进行克隆,获得甘草FPS基因的全长编码序列。甘草FPS基因编码区全长1 029 bp,编码342个氨基酸残基。将甘草FPS基因与GenBank中其他植物FPS基因序列进行比对分析,发现其核酸序列与鹰嘴豆、苜蓿、蒺藜苜蓿、大豆、百脉根的序列相似度最高,分别达到94%、94%、93%、93%、92%。进一步的系统进化分析表明FPS基因具有较高的保守性,其序列进化树与植物分类一致。
- 李滢牛云云宋经元罗红梅李秋实孙超
- 关键词：甘草甘草酸基因克隆
- 氧化鲨烯环化酶基因GpOSC1及其编码产物与应用
- 本发明公开了氧化鲨烯环化酶基因GpOSC1，基因全长开放阅读框核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。并且公开了该基因编码的蛋白。该基因不仅可应用于通过合成生物学或代谢工程技术异源合成和生产三萜皂苷，而且也为绞股蓝的分子...
- 孙超梁彤彤邹丽秋李滢
- 文献传递
- 基于高通量测序技术的药用植物表达序列标签系统的构建与应用
- 表达序列标签（Expressed sequence tag，EST）技术是分离与克隆新基因、研究基因表达谱的有效方法。本研究利用EST分析方法，建立药用植物转录组的研究方法体系，通过新一代高通量测序技术454 GS FL...
- 李滢
- 关键词：转录组表达序列标签蛇足石杉
- 文献传递
- 转录组学在药用植物研究中的应用被引量：51
- 2010年
- 药用植物转录组学研究已经成为药用植物基因组研究中最活跃的领域之一。以转录组学的产生、发展和研究方法为基础,介绍了药用植物中转录组学的应用现状,重点介绍了转录组学当前采用的技术手段以及在西洋参、丹参、乌拉尔甘草功能基因组学中的研究进展。同时对转录组学在药用植物中的发展前景进行了讨论。
- 吴琼孙超陈士林罗红梅李滢孙永珍牛云云
- 关键词：药用植物转录组学功能基因组学GS表达序列标签
- 西洋参PqERF1基因的克隆和生物信息学分析被引量：12
- 2011年
- 乙烯响应因子(ethylene response factor,ERF)是具有PETALA2(AP2)结构域的转录因子。本研究通过西洋参(Panax quinquefolius L)的转录组高通量测序结果分析获得75条具有AP2结构域的转录因子序列,并克隆到一条开放阅读框为933对碱基的基因序列,定名为PqERF1。基因表达分析结果表明PqERF1基因受茉莉酸甲酯(MeJA)的诱导,这与人参皂苷含量的受诱导模式相同。蛋白结构预测结果表明PqERF1是定位于细胞核的具有完整保守的AP2结构域的转录因子,InterproScan蛋白功能结构域分析结果表明PqERF1很可能为发病机制相关蛋白;序列比对和进化关系分析结果也显示PqERF1与发病机制相关蛋白(烟草NtERF4)、次生代谢产物相关合成蛋白(野胡萝卜DcERF1)和花衰老相关蛋白(矮牵牛PhERF12)的相似性高,且系统进化关系较近。因此,推测PqERF1基因可能是参与西洋参次生代谢产物合成调节、抗病性和衰老相关的重要基因。
- 孙永珍牛云云李滢朱英杰罗红梅陈士林
- 关键词：西洋参实时荧光定量PCR次生代谢植物防御
