张玉喜 作品数:16 被引量:90 H指数:5 供职机构: 中国水产科学研究院黄海水产研究所 更多>> 发文基金: 国家重点基础研究发展计划 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
大菱鲆免疫球蛋白轻链IgL全长cDNA的分离、鉴定及表达分析 被引量:2 2010年 实验采用末端快速扩增(RACE)技术从大菱鲆脾脏cDNA文库中筛选得到了免疫球蛋白轻链IgL的全长cD-NA片段。该序列包含47 bp的5′末端非编码区(5′UTR),738 bp的开放阅读框(ORF)和202 bp 3′UTR,整个开放阅读框编码246个氨基酸。系统发生分析表明大菱鲆IgL基因与五条鰤的IgL基因起源关系最近。RT-PCR分析表明,大菱鲆IgL基因只在正常脾脏、肾脏和头肾组织中表达;IgL在大菱鲆胚胎发育细胞期就已开始表达,在大菱鲆胚胎尾芽期和体节期表达持续增强;在鳗弧菌感染大菱鲆脾脏和头肾早期均检测到IgL基因强烈表达,后期表达逐渐减弱;大菱鲆胚胎细胞(TEC)在用鳗弧菌感染48h后,IgL开始表达。这些结果均表明IgL基因在大菱鲆免疫应答中起着重要作用。 王贤丽 张玉喜 孟亮 陈松林关键词:大菱鲆 IGL CDNA RT-PCR 重要海水养殖鱼类MHCⅡ基因克隆、表达及多态性分析 主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)Ⅱ基因是一种编码细胞表面糖蛋白的异二聚体,是高度多态的基因,且其某些基因型与生物体抗病力存在一定的相关关系。本研究以我国重要... 张玉喜关键词:主要组织相容性复合体 组织特异性表达 多态性 牙鲆MHC class ⅡB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析 被引量:59 2006年 用fmhcN1和fmhcC1引物分别从42尾感病个体和42尾抗病个体的基因组DNA中扩增MHC基因片段,扩增产物长度为268/280 bp。在268/280 bp的核苷酸序列中,有32个(11.4%)核苷酸位点是多态的。在其编码的61个氨基酸位点中,有13个位点是多态的,其中有6个位点发生在多肽结合位点上。对核苷酸替代的类型及位点进行分析,发现非多肽结合位点的非同义碱基替代率与同义碱基替代率的比值(dN/dS)(0.523)远远小于多肽结合位点的非同义碱基替代率与同义碱基替代率的比值(dN/dS)(23.091),表明氨基酸替换集中出现在exon2多肽结合位点上。分析84个个体的411个阳性克隆的测序结果,发现有13个不同的MHC classⅡB等位基因,并且分别编码13个不同的氨基酸序列。其中大部分等位基因如a,b,c,d,e,f,j,k,i,m是两个群体共有的,等位基因d在感病群体中出现的频率(23.80%)显著高于在抗病群体中出现的频率(7.14%)。而等位基因g和h只出现在13个抗病个体中,其频率分别为21.4%和9.52%;等位基因l只出现在感病群体中,其频率为19.05%。 张玉喜 陈松林关键词:主要组织相容性复合体 抗病力 牙鲆 牙鲆抗菌肽hepcidin基因的克隆及表达分析 抗菌肽是一类分布广泛的具有广谱抗菌活性的小分子物质,是生物体天然免疫系统的重要成员,在宿主抵抗外界病原侵染过程中起着保护作用。Hepcidin是一类富含半胱氨酸的抗菌肽, 在脊椎动物中具有调节生物离子代谢的作用。本研究采... 李伟 陈松林 张玉喜关键词:抗菌肽 HEPCIDIN 文献传递 大菱鲆1个CXCL10样趋化因子的克隆、鉴定与表达分析 被引量:4 2007年 趋化因子是一类趋化性细胞因子的总称,它们在白细胞的趋化反应中起着重要作用。本研究从构建的大菱鲆(Scophthalmus maximus)脾脏cDNA文库中筛选到一种大菱鲆CXC趋化因子,经过5′-RACE和3′-RACE扩增得到了它的全长cDNA。该趋化因子的全长cDNA含有1个79 bp的5′UTR,1个372 bp的开放阅读框(ORF)和1个227 bp的3′UTR。开放阅读框编码123个氨基酸残基。此CXC趋化因子基因内含有4个外显子和3个内含子,3个外显子的碱基长度分别为591 bp、86 bp和372 bp。Blast分析和系统发生分析都表明这个趋化因子和已知的脊椎动物的CXCL10相近。用鳗弧菌(Vibrio anguillarum)感染大菱鲆后12 h,该趋化因子在肝脏和脾脏中表达水平达到最高,在头肾中则是在感染后5 h表达水平最高。在肝脏中,从感染后12 h开始该趋化因子的表达水平逐渐下降并且在72 h后恢复到正常水平。在脾脏中,一直到感染后24 h该趋化因子保持高水平表达,随后表达水平减弱至正常水平。在头肾中,从感染后5 h开始一直到24 h,表达水平逐渐升高,随后表达水平,立刻降低至与正常水平一致。在正常的大菱鲆组织内没有检测到该趋化因子的表达,表明它仅在受到鳗弧菌感染的时候才被诱导表达。结论认为该趋化因子在免疫反应中可能起着重要作用。 刘洋 陈松林 孟亮 张玉喜关键词:CXC趋化因子 CXCL10 大菱鲆 CDNA文库 牙鲆良种培育技术的建立及“鲆优1号”新品种创制和应用 陈松林 田永胜 邓寒 沙珍霞 刘寿堂 廖小林 王娜 邵长伟 徐田军 王磊 张玉喜 刘云国 季相山 宋文涛 张潇珺 近10年来,项目组对牙鲆分子标记开发、高产抗病良种培育技术等进行了系统研究,在牙鲆微卫星标记批量化发掘、高产抗病良种选育技术以及良种培育等方面取得多项原创性成果:1.批量发掘牙鲆微卫星标记资源,采用文库构建、EST测序、...关键词:关键词:牙鲆 良种繁育 一种新的大菱鲆(Scophthalmusmaximus)CXC趋化因子的克隆、鉴定与表达分析 趋化因子是一类趋化性细胞因子的总称,它们在白细胞的趋化反应中起着重要作用。我们从大菱鲆脾脏cDNA文库中筛选到一种新的CXC趋化因子。它的全长cDNA含有一个81bp的5′UTR,一个414bp的开放阅读框和一个449b... 刘洋 陈松林 孟亮 张玉喜关键词:CXC 趋化因子 CDNA 文献传递 牙鲆抗病相关MHC基因标记及其辅助育种方法 一种牙鲆抗病相关MHC基因标记及其辅助育种方法,它的方法是MHCIIB基因的克隆,抗病和感病群体的制备,抗病相关MHCIIB基因标记的筛选,基因标记辅助育种技术的建立。本发明克隆了牙鲆MHCIIB全基因,并从牙鲆抗病和感... 陈松林 张玉喜 刘云国 沙珍霞 田永胜 邓寒文献传递 大菱鲆(Scophthalmus maximus)MHCⅡA基因全长cDNA的克隆与组织表达分析 被引量:13 2007年 采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)方法,得到1131bp的大菱鲆MHCⅡA全长cDNA片段。该序列包括720bp的开放阅读框(0RF),75bp的5′末端非编码区(UTR)以及336bp的3′末端非编码区。利用CLASTAL W1.8软件进行MHCⅡA基因的氨基酸序列比对和同源性比较,结果表明,大菱鲆MHCⅡA与牙鲆MHCⅡA的相似性最高,为69.8%,与真鲷、鲈鱼和丽鱼的相似性次之,分别为65.5%、69.6%和61.4%,与人、鼠和鲨鱼MHCⅡA的相似性仅为19.8%、31.6%和26.9%。应用RT-PCR分析其组织表达发现MHCⅡA基因在正常大菱鲆组织中均表达,但表达量在各个组织中不同,其中在鳃、脾、头肾、心脏、小肠和皮肤中有较强的转录本,中等程度表达于肝和血,在性腺和肌肉中表达最弱。 张玉喜 陈松林关键词:大菱鲆 MHC 克隆 组织特异性表达 大菱鲆MHCⅡB基因全长cDNA的克隆与组织表达分析 被引量:14 2006年 采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)方法,得到了1297bp的大菱鲆MHCⅡB全长cDNA片段。该序列包括741bp的开放阅读框(ORF),35bp的5’末端非编码区(UTR)以及521bp的3’末端非编码区。序列比对结果表明,大菱鲆MHCⅡB与牙鲆MHCⅡB的同源性高达71.5%,与真鲷、鲈鱼和丽鱼的同源性分别为67.1%,70.7%和68.4%,与人、鼠和鲨鱼MHCⅡB的同源性仅分别为24.1%,25.1%和13.2%。组织表达研究显示,MHCⅡB基因在正常大菱鲆组织中均表达,但表达量在各个组织中不同,其中较强的表达于鳃、脾、头肾、小肠中.中等程度表达于血、心脏和皮肤,在肝、性腺和肌肉中表达最弱。 张玉喜 陈松林关键词:大菱鲆 MHC 克隆 组织特异性表达