孙宇
- 作品数：17 被引量：62H指数：5
- 供职机构：长春市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 长春市2016—2020监测年度甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因特征分析被引量：1
- 2023年
- 目的分析长春市2016—2020年度甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因特征,了解其变异情况及遗传进化特征。方法选取2016—2020年度甲型H1N1流感病毒分离株109株,PCR扩增HA基因并进行序列测定;利用生物信息学软件对分离株的HA基因进行进化和变异分析。结果长春市109株分离株与疫苗株A/California/07/2009的HA蛋白相比均有S84N、S162N和I216T共同的氨基酸位点变异,且有1株发生了HA蛋白D222N位点突变,提示此毒株可引起患者下呼吸道症状。109株病毒株的HA基因之间核苷酸同源性为96.9%~100%,氨基酸同源性为97.2%~100%。在进化树分析上,都属于6B.1大分支,并且随着时间的推移,HA在基因进化树上离早期疫苗株A/California/7/2009越来越远,同一年份里也有毒株位于不同的小分支内。结论长春市2016—2020年度甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因在不断的变异中,应持续进行监测,为预防甲型H1N1流感大流行提供参考。
- 崔薇初秋李晨光龚云伟赵春艳孙宇隋天卓孙炳欣
- 关键词：甲型H1N1流感病毒基因特征
- 长春市2012-2013年流感病毒核酸监测结果分析被引量：9
- 2013年
- 目的分析长春市流感病毒核酸的监测结果,掌握流感流行规律,为流感防控工作提供科学依据。方法用实时定量PCR法对采集的流感样病例标本进行核酸检测。结果 2012年1月-2013年5月共采集流感样病例标本1037份,总阳性率为25.17%。在此期间,共出现两次流感流行高峰:第一次是在2012年2月-3月,主要以乙型和季节H3N2型流感病毒为主;第二次是在2013年1月,主要以季节H3N2型和新甲型H1N1型流感病毒为主。结论应加强流感监测,避免流感大流行的发生。
- 崔薇刘红初秋刘汉芬孙炳欣孙宇乔凤娟
- 关键词：流感流感病毒
- 吉林省长春市肠道病毒Echovirus 18 VP1基因特征分析被引量：1
- 2017年
- 目的 分析2015年长春市一起发热伴出疹疫情中患者粪便肠道病毒Echovirus 18型（E-18）毒株VP1基因序列特征及其与国内外其他流行株的进化关系.方法 采用逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）扩增VP1基因片段并测序,利用DNAman软件和Mega 6.0软件进行序列分析.结果 经RT-PCR方法扩增获得4株774 bp的VP1基因片段并测序,经同源性分析比较发现,各序列间核苷酸同源性为100％.与国内外E-18病毒VP1序列同源性比较发现,长春病毒株与2015年同时发现的河北省分离株同源性最高,核苷酸同源性为97％,氨基酸同源性为99％.与Metcalf原型株比较,核苷酸同源性为80％,氨基酸同源性为93％,氨基酸对比发现有18个位点发生突变.结论 吉林省首次发现E-18型肠道病毒,为中国E-18病毒分子流行病学研究提供重要信息.
- 孙炳欣吴静孙宇崔薇张兴国
- 引起吉林省2011年手足口病流行的肠道病毒71型VP1区基因的特征被引量：6
- 2012年
- 目的分析引起吉林省2011年手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)VP1区基因的特征。方法对2011年分离自吉林省8个市(州)HFMD病例的35株EV71分离株的VP1编码区基因进行RT-PCR扩增及序列测定,应用Bioedit和MEGA 4.0软件对VP1基因进行同源性和基因亲缘关系分析。结果吉林省2011年的35株EV71分离株均属于C4a基因亚型;其VP1区基因的核苷酸序列同源性在95.9%～100%之间,分属于3个进化枝,形成3个传播链,与2008年安徽阜阳株亲缘关系最近,VP1区基因核苷酸序列同源性达97.6%～99.3%,与2007年的北京株和2003年的浙江株亲缘关系相对较远;2011年吉林省各市中,既存在3个EV71传播链共流行的市,同时监测到2个EV71传播链共流行的市,还发现3个只有单一EV71传播链的市,每个传播链均在5个市流行传播。结论 2011年在吉林省内,3个C4a基因亚型EV71的传播链同时循环传播引起HFMD的流行,未发现优势传播链。
- 范明周剑惠张燕魏雷雷王爽张云仙苟伟民马学军齐忠孙宇赵海霞孙伟陈创
- 关键词：手足口病VP1区基因特征
- 寨卡病毒及寨卡病毒病被引量：1
- 2016年
- 寨卡病毒病是由寨卡病毒引起的一种蚊媒传染病。2015年4月起,在巴西暴发了历史上最为严重的寨卡疫情,同时出现小头畸形和格林巴利综合征聚集病例,WHO强烈怀疑与寨卡病毒疫情有关。2016年2月,
- 崔薇刘红孙炳新初秋孙宇吴静
- 关键词：疫情
- 2016年长春市手足口病病原学监测结果分析被引量：3
- 2017年
- 目的了解2016年长春市手足口病的流行特点,为及时防治手足口病工作提供科学依据。方法采用实时定量PCR(Real-time PCR)法对手足口病例标本进行核酸检测。结果 2016年1月-12月共采集623份病例标本,阳性率为64.53%,高发期在5-10月,其中95.02%病例在6岁以下。结论长春市2016年手足口病原的优势株为柯萨奇6型(CA6),其次是柯萨奇CA16型及其他非EV71和非CA16型。
- 乔凤娟孙宇孙炳欣阴原吴静
- 关键词：手足口病PCRCA16
- 长春市2013年手足口病病原学监测结果及分析被引量：18
- 2015年
- 目的了解2013年长春市手足口病流行的病原学及分布特征,为今后手足口病防治工作提供参考依据。方法用实时定量PCR(Real-time PCR)法对临床诊断手足口病例标本进行核酸检测。结果 2013年1月-12月共采集病例标本376例手足口病例的标本,阳性率为68.94%,96.05%的病例在6岁以下,高发期在5月-9月。结论 2013年长春市手足口患者以小于6岁的儿童为主,其主要病原是柯萨奇6型(CA6),其次是肠道病毒71型(EV71)。
- 孙炳欣许爽崔薇刘红孙宇吴静
- 关键词：手足口病PCREV71
- 吉林省长春市手足口病患者流行病学特征及肠道病毒71型VP1基因特征分析被引量：7
- 2022年
- 目的:分析2014-2018年吉林省长春市手足口病流行特征及肠道病毒71型(EV-A71)VP1基因特征,探讨其流行规律,为及时调整防控策略提供参考依据。方法:利用中国疾病预防控制信息系统中的数据,采用描述性流行病学方法对2014-2018年吉林省长春市手足口病疫情数据进行分析。收集2014-2018年吉林省长春市医疗机构报告手足口病临床诊断病例咽拭子标本,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测标本中总肠道病毒、肠道病毒71型(EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox-A16),确定型别。对EV-A71的VP1区扩增并测序,比对构建系统进化树,分析同源性和氨基酸变异位点。结果:2014-2018年吉林省长春市累计报告手足口病病例12685例,发病率呈现先降后升趋势,2016年达到高峰,之后呈逐年递降趋势。每年流行趋势基本相同,呈单峰分布,有明显的季节性。吉林省长春市14个县区均有病例报告,年均报告发病率前3位的地区为高新区(129.14/10万)、宽城区(102.17/10万)和经开区(100.98/10万)。病例中,男性比例明显高于女性,以5岁以下儿童为主。吉林省长春市EV-A71阳性样本各月份均有检出。2014年3-9月和2017年5月-2018年5月,手足口病毒型别以EV-A71为主,且呈逐渐上升趋势。测序获得EV-A71序列146条,其中除2017年3条序列和2018年7条序列属于EV-A71的B5亚型外,其余序列均属于C4亚型中的C4a亚型。VP1区145氨基酸位点为E,2018年2株检测到VP1104D,另外3株检测到VP1218R,其余各株主要毒理位点和抗原性位点未发生变异,EV-A71的B5亚型较C4亚型有VP143E、VP158T和VP1184T3个氨基酸位点差异。结论:吉林省长春市手足口病发病主要发生在5岁以下男性幼童,引发手足口病流行的肠道病毒以EV-A71为主,主要为C4a亚型,也有少部分B5亚型的流行,部分氨基酸变异位点需持续监测,以免造成大范围流行。
- 张兴国李晨光张智丽孙宇崔薇初秋乔凤娟王宇冰孙炳欣
- 关键词：手足口病肠道病毒71型VP1蛋白基因型别流行病学
- 2012—2018年长春市手足口病非肠道病毒A组71型肠道病毒VP1基因特征分析被引量：2
- 2022年
- 目的 分析2012—2018年长春市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)非肠道病毒A组71型(enteroviruses A71,EV-A71)肠道病毒VP1基因特征,探讨其流行规律,为及时调整防控策略提供参考。方法 收集2012—2018年长春市医疗机构报告的HFMD临床诊断病例样本,选取非EV-A71型肠道病毒对其VP1区扩增并测序,比对构建系统进化树,进行核苷酸同源性及氨基酸变异位点分析。结果 2012—2018年长春市HFMD病例中共获得83条柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)序列、30条柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)序列和10条柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)序列,其中CV-A16序列全部属于B1亚型,除2012年1条和2018年7条序列属于B1a亚型,其他均属于B1b亚型,各株间核苷酸序列同源性为88.2%~100.0%。2012—2018年长春市HFMD病例中CV-A6毒株相对集中,30条序列均属于D3亚型,与D3亚型参考株的同源性为92.8%~98.1%,各株间同源性为91.6%~99.8%;CV-A10毒株相对集中,10条序列均属于D2亚型,与D2亚型同源性较高为96.4%~98.4%,各株间同源性为96.4%~100.0%;CV-A16毒株中存在14个氨基酸位点变异,有12株发现在第14位点上发生N天冬酰胺→S丝氨酸(N14S)的变异,其中9株同时存在L215P变异。有9株存在M23L变异,其中8株为B1a亚型。结论 2012—2018年长春市HFMD病例中CV-A16流行株均属于B1亚型,且同时存在B1b和B1a亚型,B1b为主要优势型别,毒株存在14个氨基酸位点变异,其中N14S和L215P可能成为稳定流行位点。CV-A6和CV-A10毒株相对集中,分别为D3和D2亚型,同源性较好。加强对非EV-A71型HFMD病原的检测,对HFMD疫情的防控具有重大意义。
- 张智丽李晨光张兴国孙宇崔薇乔凤娟孙炳欣
- 关键词：手足口病肠道病毒VP1蛋白基因型别
- 一株神经氨酸酶H275Y突变的甲型H1N1流感病毒全基因组序列特征分析
- 2022年
- 目的了解1株含有神经氨酸酶H275Y突变的甲型H1N1流感病毒的变异情况及遗传进化特征,为疫情防控和治疗用药提供依据。方法选取长春市2018-2020年度甲型H1N1流感病毒分离株,PCR扩增NA基因并进行序列测定,筛选出1株甲型H1N1流感病毒株A/Jilin-Chaoyang/SWL112/2019(H1),含有神经氨酸酶H275Y耐药位点的突变,对其进行全基因组测序分析。结果流感病毒A/Jilin-Chaoyang/SWL112/2019(H1)8个节段与早期疫苗株A/California/07/2009相比,核苷酸的同源性为96.1%-98.3%,氨基酸同源性为94.9%-99.2%;与同期疫苗株A/Brisbane/02/2018相比,核苷酸的同源性为98.8%-99.7%,氨基酸同源性为98.7%-100%。其HA基因和NA基因在各自的系统进化树上都属于6B.1A5簇,其NA基因具有H275Y耐药位点突变,M2基因具有S31N耐药位点突变。结论本次研究的甲型H1N1流感病毒,具有金刚烷胺类药物和奥司他韦耐药位点突变,未来仍应加强耐药位点监测,为预防甲型H1N1流感大流行提供参考依据。
- 崔薇孙炳欣李晨光宋亚男初秋隋天卓孙宇王宇冰乔凤娟张兴国
- 关键词：甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶
